课题基金 / 基金详情

利用目标基因靶向测序技术研究血友病A新的分子致病机制

批准号:
81401741
项目类别:
青年科学基金项目
资助金额:
23.0 万元
负责人:
游国岭
依托单位:
学科分类:
分子生物学检验
结题年份:
2017
批准年份:
2014
项目状态:
已结题
项目参与者:
王静、杨海鸥、陆晔玲、郑昭璟、张晓青、李慧敏

项目摘要

结项摘要

项目成果

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中文摘要
血友病A(HA)是临床最常见的遗传性出血性疾病,主要是由F8基因突变造成凝血因子Ⅷ(FⅧ)蛋白生成异常或功能障碍所致。目前绝大多数HA患者的发病机制已明确,但仍有2%~5%患者的分子致病机制尚未明了。本课题组前期在对450个HA家系进行研究时发现8例先证者的发病机制未明。本项目拟以此8例HA先证者为研究对象,采用Agilent HaloPlex靶向捕获系统和Illumina Miseq技术平台,对12个可能导致FⅧ异常的目标基因进行高通量靶向基因组测序,结合生物信息学分析,并经Sanger测序法验证和家系分析,发现新的HA相关基因突变;随后,通过构建相关基因突变表达质粒,研究相关基因突变对F8 mRNA水平、蛋白质水平及FⅧ活性等的影响,探讨相关基因突变在HA发病中的作用。本研究有望发现新的HA分子致病机制,为进一步完善HA的基因诊断、产前诊断和遗传咨询提供理论依据。
英文摘要
Hemophilia A (HA) is the most common inherited bleeding disorder and is mainly caused by mutations in the F8 gene, resulting in a quantitative and qualitative abnormality of coagulation factor VIII (FVIII). At present, the pathogenic mechanisms for most HA patients have been identified; however, in 2%~5% of the HA patients, the pathogenesis is still not yet clear. Our previous studies have shown that the causal mutations couldn't be identified in 8 of 450 HA pedigrees by routine molecular diagnostics. This study is designed to capture and sequence 12 target genes that are associated with synthesis and functioning of FVIII protein in samples from the eight HA proband with Agilent HaloPlex Target Enrichment System and Illumina Miseq paltform. Sequencing data will be processed and analyzed by a variety of bioinformatic tools, and the candidate causal variants will be identified through stringent filtering procedures. Sanger sequencing and co-segregation analysis will be undertaken to validate the candidate causal variants. Furthermore, the functional impacts of the candidate causal variants will be assessed in vitro through constructing of mutant plasmids on levels of mRNA, protein and bio-activity of FVIII. This study may help further elucidating the new molecular mechanism for FVIII deficiency in HA cases without detectable mutations, and provide the theoretical basis for prenatal diagnosis and genetic counseling.
血友病A(HA)是临床最常见的遗传性出血性疾病,主要是由F8基因突变造成凝血因子Ⅷ(FVIII)蛋白生成异常或功能障碍所致。目前绝大多数HA患者的发病机制已明确,但仍有2%~5%患者的分子致病机制尚未明了。本项目利用Agilent SureDesign在线设计工具HaloPlex设计了针对12个HA相关基因的捕获探针。本项目拟运用靶向高通量测序、AccuCopy及Affymetrix CytoScan HD等技术,以8例未知基因突变HA及393个散发HA患者为研究对象,通过对8例发病机制未明的HA患者靶向高通量测序发现,在1例患者F8基因存在c.4372dupA,p.K1458fs突变;在1例患者F8基因存在c.C6046T,p.R2016W突变(NM_000132);1例患者F8基因内含子深部区域存在一个g.70806A>G(NG_011403.1),c.1923+39A>G突变,生物信息学软件预测此突变可能导致剪切位点异常,提取此家系先证者mRNA,反转录成cDNA,设计引物扩增患者F8基因11号外显子和12号外显子,PCR后进行测序,发现此突变导致F8基因mRNA的11号外显子和12号外显子间插入了一段93 bp的片段,此突变可能导致FVIII蛋白多31个氨基酸,因而引起FVIII蛋白功能的异常;1例重型HA患者X染色体存在inv(X)(p11.21q28)的异常倒位,其中一个断裂点位于F8基因的7号内含子,另一个断裂点位于X染色体PFKFB1基因上游。在对393个散发HA患者进行检测(AccuCopy、22号内含子倒位、1号内含子倒位、连锁分析及嵌合体检测等),60%患者突变来源于父亲,12%患者突变来源于母亲,28%患者突变为自发新生突变。新发22号内含子倒位家系中30%的母亲及新发点突变家系中11.5%的母亲为体细胞嵌合,在4个常规检测中未发现F8基因突变的患者中进行体细胞嵌合体检测,发现2例女性及1例男性为嵌合状态。本项目初步阐明了发病机制未明HA患者的致病机制,为进一步完善HA的基因诊断、产前诊断和遗传咨询提供理论依据。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
Association between ABO Blood Group and Risk of Congenital Heart Disease: A 6-year large cohort study.
ABO 血型与先天性心脏病风险之间的关联:一项为期 6 年的大型队列研究
DOI: 10.1038/srep42804
发表时间: 2017-02-17
期刊: Scientific reports
影响因子: 4.6
作者: [Zu B, You G, Fu Q, Wang J]
通讯作者: Wang J
心肌源性lncRNA BANCR通过调控心内膜内皮间充质转化参与心脏流出道发育的分子机制研究
  • 批准号:
    --
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    55万元
  • 批准年份:
    2021
  • 负责人:
    游国岭
  • 依托单位:
国内基金
海外基金