DegP分子伴侣和蛋白酶双功能的单分子探测
批准号:
20973015
项目类别:
面上项目
资助金额:
38.0 万元
负责人:
赵新生
依托单位:
学科分类:
化学生物学理论、方法与技术
结题年份:
2012
批准年份:
2009
项目状态:
已结题
项目参与者:
刘鹏程、吴思、支泽勇、杨新星、李勋、葛静、尹延东、刘肇芳
中文摘要
广泛存在于生物体内的HtrA蛋白质家族是一类重要的热休克蛋白,同时具有分子伴侣和蛋白酶的双重功能,在生物体对蛋白质进行质量控制中起关键作用。人类的HtrA同源蛋白质与各种疾病如癌症、帕金森症、老年痴呆症都有关系。HtrA在大肠杆菌中被称作DegP,对于细菌外膜蛋白的生物合成和质量控制至关重要。我们拟以DegP为对象,采用单分子探测技术研究HtrA家族的分子伴侣和蛋白酶双重功能的分子机制。将单分子探测这一物理化学新方法引入相关研究,可以揭示出新的现象和规律,增进人们对生物体实现蛋白质的正确折叠、抵御外部胁迫环境、清除错误折叠的蛋白质的机理的了解,为人类认识相关疾病的发病机理和提出治疗对策提供科学依据。这是一个有相当难度的课题,但我们经过多年的探索与准备,已经具备了实现预定目标的研究基础,可以圆满完成任务。
英文摘要
广泛存在于生物体内的HtrA蛋白质家族是一类重要的热休克蛋白,同时具有分子伴侣和蛋白酶的双重功能,在生物体对蛋白质进行质量控制中起关键作用。HtrA在大肠杆菌中被称作DegP。前人发现,SurA、Skp与DegP一起在细菌的膜间质中对外膜蛋白(OMP)的生物生成的保护和质量控制起关键作用,但其机理不清楚。我们采用单分子探测技术研究了DegP的分子伴侣和蛋白酶双重功能的分子机制,及与SurA、Skp的协同机制,得到如下成果:在与OMP结合时,Skp和SurA在动力学上比DegP有优势,而DegP在热力学上比Skp和SurA有优势,从而在保护OMP时,形成从Skp和SurA到DegP的传输关系。Skp和SurA结合OMP后对其折叠状态进行处理,再与DegP结合,使得DegP无法对OMP有效行使蛋白酶功能。反之,没有经过Skp和SurA处理的OMP处于错误折叠状态,其与DegP结合后,DegP行使蛋白酶功能,将错误折叠的OMP降解。在得到上述全局图像后,我们从Skp开始更为深入地研究相关蛋白质之间相互作用的详细动力学机理。我们对Skp和OMP的不同位点进行突变和荧光标记,观察它们之间相互作用的动力学,发现:三聚体形态的Skp通过其触须端将OMP吞入其空腔内,并且发现首先进入Skp的是OMP的N端。Skp将OMP吸入的动力来自于疏水环境增强的两个蛋白质之间离子键的不断产生和断开。我们还同时开展了蛋白质折叠、核酸修饰的动力学机理研究,并发展和完善荧光相关光谱技术。项目期间共发表学术论文17篇,培养博士5名,组织全国学术会议1次。圆满完成项目预定的目标。
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Kinetic and thermodynamic characterization of the reaction pathway of box H/ACA RNA-guided pseudouridine formation.
Box H/ACA RNA引导的假尿苷形成反应途径的动力学和热力学表征
DOI:
10.1093/nar/gks882
发表时间:
2012-11
期刊:
Nucleic acids research
影响因子:
14.9
作者:
[Yang X, Duan J, Li S, Wang P, Ma S, Ye K, Zhao XS]
通讯作者:
Zhao XS
DOI:
--
发表时间:
--
期刊:
Accounts of Chemical Research
影响因子:
作者:
[Yin, Yandong, Zhao, Xin Sheng, ]
通讯作者:
A Microfluidic Mixer for Single-Molecule Kinetics Experiments
用于单分子动力学实验的微流体混合器
DOI:
10.3866/pku.whxb20110804
发表时间:
2011
期刊:
Acta Physico-chimica Sinica
影响因子:
10.9
作者:
[]
通讯作者:
DOI:
10.1002/cphc.201100652
发表时间:
2011-12
期刊:
Chemphyschem : a European journal of chemical physics and physical chemistry
影响因子:
--
作者:
[Zeyong Zhi;Pengcheng Liu;Peng Wang;Yanyi Huang;Xin Sheng Zhao]
通讯作者:
Zeyong Zhi;Pengcheng Liu;Peng Wang;Yanyi Huang;Xin Sheng Zhao
Maximum Entropy Method for Analyses of Fluorescence Correlation Spectra of Oligonucleotide Intra-Chain Collision
寡核苷酸链内碰撞荧光相关光谱分析的最大熵法
DOI:
10.3866/pku.whxb20100408
发表时间:
2010-04
期刊:
Acta Physico-chimica Sinica
影响因子:
10.9
作者:
[]
通讯作者:
共 16 条
酶对核酸进行化学修饰的动力学机理
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批准号:21233002
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项目类别:重点项目
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资助金额:310.0万元
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批准年份:2012
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负责人:赵新生
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依托单位:
生物物理化学发展战略研讨会
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批准号:21043401
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项目类别:专项基金项目
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资助金额:4.0万元
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批准年份:2010
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负责人:赵新生
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依托单位:
基于超精细结构的集成微流芯片生物检测新方法
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批准号:20733001
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项目类别:重点项目
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资助金额:210.0万元
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批准年份:2007
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负责人:赵新生
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依托单位:
DNA微阵列高特异性识别单核苷酸多态性的原理与技术
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批准号:20673002
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项目类别:面上项目
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资助金额:35.0万元
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批准年份:2006
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负责人:赵新生
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依托单位:
生物大分子特征识别技术的基础研究
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批准号:20333010
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项目类别:重点项目
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资助金额:200.0万元
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批准年份:2003
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负责人:赵新生
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依托单位:
在硅表面引入有机膜的新方法
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批准号:29973003
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项目类别:面上项目
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资助金额:22.0万元
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批准年份:1999
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负责人:赵新生
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依托单位:
分子反应动力学的含时量子研究
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批准号:29673001
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项目类别:面上项目
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资助金额:9.0万元
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批准年份:1996
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负责人:赵新生
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依托单位:
表面、界面的非线性光学研究(2)
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批准号:19434012
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项目类别:重点项目
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资助金额:15.0万元
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批准年份:1994
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负责人:赵新生
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依托单位:
激光二次谐波研究类脂膜
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批准号:29273090
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项目类别:面上项目
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资助金额:6.5万元
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批准年份:1992
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负责人:赵新生
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依托单位:
有机自由基高振动激发态的光谱学
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批准号:29140002
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项目类别:专项基金项目
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资助金额:5.0万元
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批准年份:1991
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负责人:赵新生
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依托单位:
国内基金
海外基金