基于贝叶斯理论和形态有限介入的昆虫多样性研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31272340
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    84.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0402.动物系统与分类
  • 结题年份:
    2016
  • 批准年份:
    2012
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2013-01-01 至2016-12-31

项目摘要

Studies on insects diversity have been greatly improved due to the technology of DNA barcoding worldwide. However, with the development of DNA barcoding, lots of insects specimens newly collected require re-identification of species membership due to the degrade of insects genomic DNA from museum. The general solution to this issue is to check all specimens under study so that experts in the field have been heavily burdened. The main goal of this research is to propose a new approach with which one can identify a small number of specimens in prior, then predict all other specimens under the framework of Bayesian theory with certain statistic significance,and further to assess species diversity of insects. An empirical case study of Lasiocampidae will be used to test the new method proposed in this study.
国际及国内DNA条形码的兴起极大地促进了昆虫多样性的研究,然而随着各种DNA条形码项目的启动与逐步推进,大量昆虫标本的重新鉴定成为迫切需要解决的问题,这主要是因为大量馆藏昆虫标本常无法保证能提取出可用的基因组DNA用于比对,通常情况下,所有新采集的标本均需检视鉴定,这很大程度上加重了分类学专家的负担,如何只对少量标本进行形态学鉴定,即有限的形态学介入,而无需检视所有标本,又能在一定统计学精度范围内进行昆虫身份识别,从而进一步用于昆虫多样性评价,是本项目要解决的关键科学问题。本项目将在申请人所取得的初步研究成果的基础上,通过开发相关贝叶斯算法,探讨昆虫多样性评估体系的构建,并以枯叶蛾类毛虫为例进行测试,从而为生产实践中昆虫多样性调查评估奠定理论与应用基础。

结项摘要

随着全球生物多样性丧失的加剧,迫切需要建立物种多样性评价的快速有效的方法,国际及国内DNA条形码的兴起极大地促进了生物多样性的研究,项目在前期研究的基础上,通过有限的形态学介入,结合贝叶斯算法,初步构建了基于DNA条形码的昆虫多样性评估体系;在我国重要的鳞翅目昆虫类群夜蛾和枯叶蛾中进行测试,结果表明基于DNA条形码的多样性评估体系(香浓指数等6个常用的多样性指数)与传统的基于形态的多样性评估体系并无显著性差异,且同时具有简便、快速及易于标准化的优点;建立了DNA条形码与可视化芯片相结合的昆虫物种识别新方法;运用线粒体基因组学的方法研究了我国重要林业害虫松毛虫属的遗传多样性及系统发育关系,从而为生产实践中昆虫多样性调查评估奠定理论与应用基础。

项目成果

期刊论文数量(12)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
高通量转录组测序技术及其在鳞翅目昆虫上的应用
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    昆虫学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    杨帆;黄立华;张爱兵
  • 通讯作者:
    张爱兵
Transcriptome Characterization of Dendrolimus punctatus and Expression Profiles at Different Developmental Stages.
马尾松毛虫的转录组特征和不同发育阶段的表达谱
  • DOI:
    10.1371/journal.pone.0161667
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    PloS one
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Yang CH;Yang PC;Li J;Yang F;Zhang AB
  • 通讯作者:
    Zhang AB
昆虫DNA条码分析中的距离方法
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    应用昆虫学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    金倩;张爱兵
  • 通讯作者:
    张爱兵
Mitochondrial phylogenomics and genetic relationships of closely related pine moth (Lasiocampidae: Dendrolimus) species in China, using whole mitochondrial genomes.
使用全线粒体基因组研究中国近缘松蛾(Lasiocampidae:Dendrolimus)物种的线粒体系统发育学和遗传关系
  • DOI:
    10.1186/s12864-015-1566-5
  • 发表时间:
    2015-06-04
  • 期刊:
    BMC genomics
  • 影响因子:
    4.4
  • 作者:
    Qin J;Zhang Y;Zhou X;Kong X;Wei S;Ward RD;Zhang AB
  • 通讯作者:
    Zhang AB
昆虫系统发育重建的常用方法及步骤
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    应用昆虫学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    秦洁, 张爱兵
  • 通讯作者:
    秦洁, 张爱兵

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其他文献

遥感技术及其在昆虫生态学中的应用
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  • 发表时间:
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  • 作者:
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
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  • 作者:
    苏斌;孔令高;张爱兵
  • 通讯作者:
    张爱兵
环境及地理因素对中国枯叶蛾科昆虫β多样性格局的影响
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  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    环境昆虫学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    金倩;张天芯;张智慧;王飞飞;王夏雯;王信海;张爱兵
  • 通讯作者:
    张爱兵
基于DNA条形码的物种界定算法比较研究——以北京周边地区舟蛾科为例
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    金倩;武春生;张爱兵
  • 通讯作者:
    张爱兵
DNA条形码技术在田间常见蓟马种类识别中的应用
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    Acta Entomologica Sinica
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    乔玮娜;万方浩;张爱兵;闵亮;张桂芬
  • 通讯作者:
    张桂芬

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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