应用海森结构光超高分辨率显微镜研究靶向溶酶体的线粒体衍生囊泡的发生机制

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    91854112
  • 项目类别:
    重大研究计划
  • 资助金额:
    91.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0701.细胞器及亚细胞结构、互作与功能
  • 结题年份:
    2021
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2021-12-31

项目摘要

Mitochondria not only produce energy to the whole cell but also participate in various biosynthesis and life processes. To maintain its normal morphology and function, mitochondria actively interact with other organelles. Vesicle transport is one of the interacting modes. Mitochondrial-derived vesicles (MDVs) carry mitochondrial proteins, lipids, etc. to the peroxisome or late endosome/lysosome. MDVs targeted to lysosomes not only regulate the morphology and movement of mitochondria, participate in the presentation of immune antigens, but also play an important role in the control of mitochondrial quality. However, due to its smaller diameter than the resolution of conventional confocal microscopes, it cannot be differentiated from mitochondrial fragments under conventional microscopes. Moreover, the confocal microscope has high excitation light intensity, and mitochondria are very sensitive to phototoxicity. Therefore, current studies on MDVs can only rely on electron microscopy or fluorescent staining with antibodies to observe fixed samples. Technical limitations hinder the mechanism research on MDVs. We intend to implement real-time dynamic super-resolution imaging of MDVs using a self-developed Hessian structured illumination microscopy, and to develop new algorithms to analyze the kinetic characteristics and generation mechanisms of their formation, transport, and fusion with target organelles. We expect this study will provide new discoveries on mitochondria quality control mechanisms and deepen the understanding of organelles communication.
线粒体不仅产生能量还参与多种生物合成与生命过程。为维护其正常的形态与功能,线粒体与其它细胞器之间存在着活跃的交流。囊泡运输是其中的一种方式。线粒体来源的囊泡MDVs携带线粒体蛋白、脂质等运输到过氧化物酶体或晚期内体/溶酶体。靶向溶酶体的MDVs不仅调节了线粒体的形态、运动,参与免疫抗原的呈递,还是一种线粒体质量控制的重要机制。然而由于其直径小于常规共聚焦显微镜的分辨率,在传统显微镜下无法与线粒体片段相区分。而且共聚焦显微镜的激发光强度高,而线粒体对光毒性非常敏感。所以目前关于MDVs的研究只能依赖于电镜或抗体荧光染色来观察固定样本。技术上的限制阻碍了关于MDVs的机制研究。我们拟利用自主研发的海森结构光超高分辨率显微镜实现对MDVs的实时动态成像,并开发新的算法来解析其形成、运输和与靶器官融合的动力学特点及生成机制,期望为线粒体质量控制机制提供新发现,并加深对细胞器之间相互交流方式的理解。

结项摘要

线粒体衍生囊泡MDVs是近年来发现的从线粒体上出芽形成的、包含不同集群的囊泡。其中线粒体外膜通道转位酶TOM20所标志的TOM20+ MDVs是数目最多的一类亚群,被认为靶向溶酶体降解,是一种线粒体质量控制的机制。然而对于TOM20+ MDVs 的形成机制,动力学特点与功能机制等还知之甚少。该项目利用海森结构光超高分辨率显微镜研究TOM20+ MDVs的发生机制。首先借助深度学习相关的图像处理技术建立了线粒体结构自动化识别与分析的软件和算法。进一步,我们应用海森结构光超高分辨率显微镜实时动态观察MDVs的生成、动力学特点以及靶向。我们发现TOM20+ MDVs并不像文献报道的那样,只是单一大小的囊泡状结构,其还存在一些条索状结构。而且条索状MDVs可转变为囊泡状MDVs。DRP1敲低导致TOM20+ MDVs数目减少,尺寸增加。与以往人们的认识不同,我们发现大部分TOM20+ MDVs并不靶向溶酶体降解,而是靶向过氧化物酶体。敲除过氧化物酶体关键因子PEX3/PEX19显著降低TOM20+ MDVs数量,提示TOM20+ MDVs可能与过氧化物酶体的发生与功能密切相关。本项目开发的线粒体结构自动化识别与分析技术使得从海量的超分辨成像数据中进行定量分析从而发现有意义的生物学现象成为可能。生物学实验结果为重新认识线粒体与过氧化物酶体的互作机制提供了有趣的新发现。

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
In vivo imaging of beta-cell function reveals glucose-mediated heterogeneity of beta-cell functional development
β 细胞功能的体内成像揭示了葡萄糖介导的 β 细胞功能发育的异质性
  • DOI:
    10.7554/elife.41540
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    eLife
  • 影响因子:
    7.7
  • 作者:
    Zhao Jia;Zong Weijian;Zhao Yiwen;Gou Dongzhou;Liang Shenghui;Shen Jiayu;Wu Yi;Zheng Xuan;Wu Runlong;Wang Xu;Niu Fuzeng;Wang Aimin;Zhang Yunfeng;Xiong Jing-Wei;Chen Liangyi;Liu Yanmei
  • 通讯作者:
    Liu Yanmei
E-syt1 Re-arranges STIM1 Clusters to Stabilize Ring-shaped ER-PM Contact Sites and Accelerate Ca2+ Store Replenishment
E-syt1 重新排列 STIM1 簇以稳定环形 ER-PM 接触位点并加速 Ca2 存储补充
  • DOI:
    10.1038/s41598-019-40331-0
  • 发表时间:
    2019-03-08
  • 期刊:
    SCIENTIFIC REPORTS
  • 影响因子:
    4.6
  • 作者:
    Kang, Fei;Zhou, Mengxuan;Chen, Liangyi
  • 通讯作者:
    Chen, Liangyi
Super-resolution fluorescence-assisted diffraction computational tomography reveals the three-dimensional landscape of the cellular organelle interactome
超分辨率荧光辅助衍射计算断层扫描揭示了细胞器相互作用组的三维景观
  • DOI:
    10.1038/s41377-020-0249-4
  • 发表时间:
    2020-01-28
  • 期刊:
    LIGHT-SCIENCE & APPLICATIONS
  • 影响因子:
    19.4
  • 作者:
    Dong, Dashan;Huang, Xiaoshuai;Chen, Liangyi
  • 通讯作者:
    Chen, Liangyi

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活细胞超灵敏结构光超高分辨率显微镜
  • DOI:
    10.16262/j.cnki.1000-8217.2018.04.005
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    中国科学基金
  • 影响因子:
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  • 作者:
    黄小帅;李柳菊;范俊超;刘彦梅;谭山;陈良怡
  • 通讯作者:
    陈良怡

其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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