反式环辛烯-四嗪反应研究及其在蛋白质定点标记和激活中的应用

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    21708020
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    23.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    B0702.生物分子的化学生物学
  • 结题年份:
    2020
  • 批准年份:
    2017
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2018-01-01 至2020-12-31

项目摘要

Bioorthogonal chemistry has attracted an explosion of interests due to the great impact on studies of the complex biological processes as well as on therapeutic applications. Reaction between trans-cylooctene and tetrazine has been the most ideal bioorthogonal ligation reaction so far due to its excellent kinetics and biocompatibility. However, this reaction has emerged as a bioorthogonal decaging reaction in prodrug and protein activation recently. The potential conflict between ligation and decaging from the same reaction promoted us to systematically study the reaction and comprehensively understand the structure-activity relationship of tetrazine. Consequently, the structures of terazines used for ligation and decaging will be rationally designed and optimized respectively. After confirming their high efficiency in ligation reaction and decaging reaction, these newly designed tetrazines will be used for protein labeling and activation in living cells. Finally, by coupling the protein labeling and activation, a strategy for studying feedback regulation in cell signal transduction will be developed.
近年来,生物正交反应因其在研究复杂生命过程以及临床诊断成像等方面的巨大应用前景而备受关注。其中反式环辛烯-四嗪反应由于极佳的反应动力学和生物兼容性而成为目前最理想的生物正交偶联反应。然而最近的研究发现该反应也能成为生物正交脱除反应。这两种相反的反应类型同时存在必然会严重干扰各自的反应效率。我们初步的实验结果证明四嗪的结构对反应的类型有较大影响。因此,本项目计划先从化学角度系统深入地研究反式环辛烯-四嗪反应中四嗪的构效关系。在此基础之上,我们将分别对用于偶联和脱除的四嗪分子的结构进行优化,并在小分子、纯蛋白以及活细胞等多个层面实验评测这些新的四嗪分子的性能。据此筛选出来的高效率的四嗪分子将分别被用于活细胞内目标蛋白的特异标记和激活。最后,利用该反应一种反应两种类型这个特殊的性质,我们将联用蛋白标记和蛋白激活开发用于细胞通路中反馈调节的研究方法。

结项摘要

该项目的研究内容主要是面向生物应用的化学反应开发,因此项目成果主要分为化学反应的发展和化学工具在生物中的应用两方面。第一方面,就化学反应发展而言,由于绝大多数生物活性分子都含有氮原子,而希夫碱作为制备含氮化合物的重要底物就成为我们研究的重点化合物,因此我们主要针对希夫碱开展了一系列化学反应的研究。借助可见光催化途径,我们成功实现了希夫碱的极性反转,将传统的亲电性质的希夫碱转化成具有极强亲核活性的中间体,从而将希夫碱的反应范围从亲电试剂扩展到亲核试剂,大大扩展了其反应类型,使得含氮类生物活性分子的制备更为方便快捷。例如,实现了以重水为底物的胺类化合物的高效氘代,实现了氨基醇类化合物的高效制备,为吲哚啉类荧光分子的制备提供了多样性底物,实现了太阳光驱动的以二氧化碳为底物的氨基酸的简便合成等。第二方面,就化学工具在生物中的应用而言,我们发展了用于活细胞的铜介导的生物正交剪切反应,实现了可控释放型抗体偶联药物(Cleavable ADCs)用于对癌细胞的选择性杀伤,用于对细胞表面蛋白的可逆修饰,实现了细胞表面受体与配体相互作用的精准调控等。此外,就四嗪反式环辛烯反应,我们系统总结目前该反应的发展与应用的进展,为该反应进一步的深入研究奠定了基础。

项目成果

期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(5)
Visible light-promoted CO(2) fixation with imines to synthesize diaryl α-amino acids.
可见光促进 CO2 与亚胺固定合成二芳基 α-氨基酸
  • DOI:
    10.1038/s41467-018-07351-2
  • 发表时间:
    2018-11-22
  • 期刊:
    Nature communications
  • 影响因子:
    16.6
  • 作者:
    Fan X;Gong X;Ma M;Wang R;Walsh PJ
  • 通讯作者:
    Walsh PJ
Calcium carbonate as heterogeneous support for recyclable organocatalysts
碳酸钙作为可回收有机催化剂的多相载体
  • DOI:
    10.1016/j.jcat.2020.11.013
  • 发表时间:
    2021-01-01
  • 期刊:
    JOURNAL OF CATALYSIS
  • 影响因子:
    7.3
  • 作者:
    Lizandara-Pueyo, Carlos;Fan, Xinyuan;Pericas, Miquel A.
  • 通讯作者:
    Pericas, Miquel A.
Development and applications of inverse-electron-demand Diels-Alder reaction in bioorthogonal chemistry
逆电子需Diels-Alder反应在生物正交化学中的发展及应用
  • DOI:
    10.1360/ssc-2020-0110
  • 发表时间:
    2020-09
  • 期刊:
    Scientia Sinica Chimica
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Zhang Xianrui;Luo Huixin;Fan Xinyuan;Chen Peng R
  • 通讯作者:
    Chen Peng R
Copper-Triggered Bioorthogonal Cleavage Reactions for Reversible Protein and Cell Surface Modifications
铜引发的生物正交裂解反应用于可逆蛋白质和细胞表面修饰
  • DOI:
    10.1021/jacs.9b05833
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Journal of the American Chemical Society
  • 影响因子:
    15
  • 作者:
    Wang Xin;Liu Yanjun;Fan Xinyuan;Wang Jie;Ngai William Shu Ching;Zhang Heng;Li Jiaofeng;Zhang Gong;Lin Jian;Chen Peng R.
  • 通讯作者:
    Chen Peng R.
Reductive Cross-Coupling of Aldehydes and Imines Mediated by Visible Light Photoredox Catalysis
可见光光氧化还原催化介导的醛和亚胺的还原交叉偶联
  • DOI:
    10.1021/acs.orglett.8b03394
  • 发表时间:
    2019-01-04
  • 期刊:
    ORGANIC LETTERS
  • 影响因子:
    5.2
  • 作者:
    Wang, Rui;Ma, Mengyue;Walsh, Patrick J.
  • 通讯作者:
    Walsh, Patrick J.

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蛋白质脱笼化学工具的开发及应用研究
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2020
  • 资助金额:
    63 万元
  • 项目类别:
    面上项目
糖脂代谢网络蛋白的时空调控技术
  • 批准号:
    91957101
  • 批准年份:
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  • 项目类别:
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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