半知菌类真菌链格孢属Alternaria在全球分布极广，是植物的病原和内生菌，或腐生菌。引起人呼吸道和皮肤的疾病,并产生真菌毒素. 植物长春花中链格孢内生菌能产生抗癌药物长春碱。由于决大多数种类有性世代的不明或缺失，造成该属真菌鉴定和分类的混乱状况。国际上对链格孢系统发生关系的研究仍然局限于一定区域采集的菌株的个别基因上。本项目将测序一系列全球范围代表性菌株(30个以上)的组蛋白（Histone gene）基因、β-微管蛋白（β-tubulin gene）基因和核糖体RNA基因ITS片段等三个以上基因DNA 序列，结合应用申请者已发表的链格孢DNA排序,及基因银行等现存的有关DNA序列，进行大规模(150条以上) DNA排序，采用最新PAUP*版系统发生分析软件,构建链格孢属真菌系统发生关系的基因树。对一系列种类的系统发生、演化及其分布范围进行深入研究，并进行相关种类基因系统学的界定。