副溶血弧菌外膜蛋白复合物组及其作用网络的研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    30972279
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    34.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1907.水产生物免疫学
  • 结题年份:
    2012
  • 批准年份:
    2009
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2010-01-01 至2012-12-31

项目摘要

蛋白质-蛋白质复合物组及其网络结构的揭示,已经成为生命科学研究的前沿热点领域。因此,加快对病原性弧菌蛋白质组相互作用网络的研究,对该菌的防制具有十分重要的价值。本项目拟在实验室比较扎实的前期研究的基础上,采用His-pull down和native/SDS-PAGE方法辅以Far-Western blotting和免疫共沉淀等技术,以副溶血弧菌为对象,按照亚蛋白质复合物组学技术路线,发现和鉴定外膜蛋白质复合物组及其相互作用网络。将对单个蛋白差异的蛋白质组推进至蛋白质-蛋白质复合物的蛋白质复合物组的研究,并进一步将蛋白质复合物组推进至蛋白质复合物组相互关系的揭示。并在此基础上,对耐盐蛋白质复合物组进行相关功能研究。这些结果将对深入开展病原菌弧菌的病原学研究具有十分重要的意义。

结项摘要

揭示蛋白质-蛋白质复合物组及其网络结构,已经成为生命科学研究的前沿热点领域。因此,加快对病原性弧菌蛋白质组相互作用网络的研究,对该菌的防制具有十分重要的价值。本项目采用基于native-SDS/PAGE的蛋白质组学技术路线结合Far-Western blotting和免疫共沉淀等蛋白质-蛋白质相互作用技术方法,开展副溶血弧菌和大肠杆菌外膜蛋白质复合物组的研究。分别建立了大肠埃希菌K12 BW25113和副溶血弧菌的Native/SDS PAGE 2D图谱。前者鉴定出94个蛋白,发现先前未报道的22种蛋白复合物,采用蛋白质-蛋白质相互作用方法对其中6种进行了确认;后者共鉴定出70个蛋白点,分析出15种蛋白复合物,对其中4种进行了确认;进而构建其相互作用网络。在此基础上,开展耐药、耐盐和铁离子限制蛋白质复合物组的研究,旨在发现细菌以蛋白质复合物组进行环境不利因素应激的特征,揭示细菌调节能量代谢系统的相关规律。首先发现耐药、耐盐和铁离子限制蛋白质复合物组。进一步采用基因克隆、原核表达、重组蛋白纯化和抗体制备,对这些差异蛋白及其复合物进行了验证。同时采用缺失菌株和高表达菌株对这些重要复合物进行功能研究。结果发现,能量代谢相关复合物组功能下调,导致质子动力势下降,使抗生素进入细胞减少。这一机制阐明对理解细菌耐药特性与能量代谢代偿的关系具有重要意义。这些研究将对单个蛋白差异的蛋白质组推进至蛋白质-蛋白质复合物的蛋白质复合物组的研究,并进一步将蛋白质复合物组推进至蛋白质复合物组相互关系的揭示。这些结果对深入开展病原菌弧菌的病原学研究具有十分重要的意义。项目发表论文10篇,其中SCI论文9篇,影响因子均大于3 (大约5的3篇); 部分内容获省科技进步一等奖1项。

项目成果

期刊论文数量(5)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Alterations of protein complexes and pathways in genetic information flow and response to stimulus contribute to Escherichia coli resistance to balofloxacin
遗传信息流中蛋白质复合物和途径的改变以及对刺激的反应有助于大肠杆菌对巴洛沙星的耐药性
  • DOI:
    10.1039/c2mb25090j
  • 发表时间:
    2012-01-01
  • 期刊:
    MOLECULAR BIOSYSTEMS
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Li, Hui;Pan, Jian-Yi;Peng, Xuan-Xian
  • 通讯作者:
    Peng, Xuan-Xian
Complexome of Escherichia coli cytosolic proteins under normal native conditions
正常天然条件下大肠杆菌胞质蛋白的复合体
  • DOI:
    10.1039/c1mb05103b
  • 发表时间:
    2011-01-01
  • 期刊:
    MOLECULAR BIOSYSTEMS
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Pan, Jian-Yi;Wu, Hongkai;Peng, Xuan-Xian
  • 通讯作者:
    Peng, Xuan-Xian
Complexome of Escherichia coil Envelope Proteins under Normal Physiological Conditions
正常生理条件下大肠杆菌包膜蛋白复合体
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH
  • 影响因子:
    4.4
  • 作者:
    Pan, Jian-Yi;Li, Hui;Ma, Yan;Chen, Ping;Zhao, Ping;Wang, San-Ying;Peng, Xuan-Xian
  • 通讯作者:
    Peng, Xuan-Xian
Downregulation of Na(+)-NQR complex is essential for Vibrio alginolyticus in resistance to balofloxacin
Na()-NQR复合物的下调对于溶藻弧菌对巴洛沙星的耐药性至关重要
  • DOI:
    10.1016/j.jprot.2012.03.006
  • 发表时间:
    2012-05-17
  • 期刊:
    JOURNAL OF PROTEOMICS
  • 影响因子:
    3.3
  • 作者:
    Li, Peipei;Liu, Xianjie;Peng, Xuan-Xian
  • 通讯作者:
    Peng, Xuan-Xian

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其他文献

Li, Hui; Wang, Bao-Cheng; Xu, Wen-Jiao; Lin, Xiang-Min; Peng, Xuan-Xian; Identification and network of Outer membrane proteins regulating streptomysin resistance in Escherichia coli
李慧;
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    Journal of Proteome Research
  • 影响因子:
    4.4
  • 作者:
    彭宣宪
  • 通讯作者:
    彭宣宪
Outer membrane proteome and its regulation networks in response to glucose concentration changes in Escherichia coli.
大肠杆菌外膜蛋白质组及其响应葡萄糖浓度变化的调控网络。
  • DOI:
    10.1039/c1mb05193h
  • 发表时间:
    2011-11
  • 期刊:
    Mol Biosyst
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    彭宣宪
  • 通讯作者:
    彭宣宪
HBV Pre S1蛋白在酵母细胞中转录激活功能研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    中华实验和临床病毒学杂志,2002,2:57(MI收录号:12196828)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    肖生祥;楚雍烈;彭宣宪;肖生彬;吴艳红;曹振平.
  • 通讯作者:
    曹振平.

其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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