PRC2复合物介导的细胞核RNA干扰的功能与机制研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    91640110
  • 项目类别:
    重大研究计划
  • 资助金额:
    85.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0601.遗传物质结构与功能
  • 结题年份:
    2019
  • 批准年份:
    2016
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2017-01-01 至2019-12-31

项目摘要

Polycomb family proteins and histone 3 lysine 27 methyltransferase mediates the modification of H3K27, which plays critical roles in the establishment and maintenance of cell memory and development.RNA interference (RNAi) is a widely conserved mechanism to regulate gene expression in eukaryotes. However, it is unclear how RNAi is conducted in the nucleus. In this project, we propose to use C. elegans and human embryonic stem cells (hES) to study the mechanism and function of PRC2 complex in nuclear RNAi, and the roles of Nrde pathway in pluripotency maintenance and differentiation of hES cells. We will examine the subcellular localization of PRC2 complex, its binding to pre-mRNA or DNA, as well as whether these interactions rely on the presence of small RNAs or the Nrde pathway. Finally, we will study the roles of PRC2 complex and Nrde pathway in regulating the differentiation of hES cells to neuronal cells. Through this research, we will not only understand the basic biology of small RNA-mediated epigenetics and transcription regulation, but also assist the application of small RNA-based technology.
Polycomb家族蛋白和H3K27甲基转移酶介导了基因组的H3K27me3的修饰, 对建立和维持细胞记忆和生长发育起着关键作用。RNA干扰(RNA Intereference)是真核生物中一个广泛且保守的基因表达调节机制,对生物体的遗传和发育都非常关键。然而细胞核内RNAi的分子机制还不清楚。在本课题中,我们将以秀丽线虫和人类胚胎干细胞(hES细胞)为模型,探讨PRC2复合物在细胞核RNA干扰缺陷(Nrde)通路中的分子机制,以及细胞核RNA干扰在干细胞全能性维持和定向分化中的作用。我们将检查PRC2复合物的定位、与pre-mRNA以及DNA的结合,以及这些定位与结合是否依赖于小干扰RNA和Nrde通路。最后我们将研究PRC2复合物和Nrde通路在hES细胞向神经细胞定向分化中的作用。通过以上研究,我们将更深入地了解小RNA指导的表观遗传和转录调控机制,并为其应用提供相应的理论支持。

结项摘要

项目背景:.RNA干扰是真核生物中一个非常广泛而且保守的基因调节机制。早期的试验已经成功地表明小RNA 可以用来抑制癌基因和病毒基因的表达。然而,在小RNA被应用于临床和制药的尝试过程中,人们发现小RNA在体内的稳定性,定向输送,以及错靶调节现象等严重制约着其效果。深入地了解RNA干扰错靶的原因和机理,不仅对理解RNA的基础生物学有重要意义,而且有助于更好地将小RNA干扰技术用于研究和临床治疗。..主要研究内容:.在本课题中,我们探讨了PRC2复合物在细胞核RNA干扰缺陷(Nrde)通路中的分子机制;检查了PRC2复合物的定位、与pre-mRNA以及DNA的结合,以及这些定位与结合是否依赖于小干扰RNA和Nrde通路;研究了PRC2复合物和Nrde通路在细胞定向分化中的作用。从而更深入地了解小RNA指导的表观遗传和转录调控机制,并为其应用提供相应的理论支持。..重要结果:..在本课题的支持下,我们得到了以下几项结果:.(1).发现和解析了针对rRNA的反义小干扰RNA(risiRNA)的产生与作用机制。(PNAS, 2018; Nature Structural & Molecular Biology, 2017).(2).发现了解析了参与piRNA产生与加工的USTC复合物和 PICS复合物。(Cell Reports, 2019; Genes & Development, 2019).(3).发现细胞质RNAi通路可以介导RNAi过程的多代遗传。(Cell Reports, 2018).(4).发展了诱导染色体倒置的基因编辑技术。(G3, 2018)...在项目的支持下,以本实验室为独立单位发表SCI研究论文6篇(见上),应邀撰写综述5篇(Frontiers in Genetics 2019; Biology of the Cell 2018; RNA biology 2017; 中国科学.生命科学 2018, 2017)。毕业博士3名。..科学意义:..本项目进一步研究了模式生物秀丽线虫中调节下小RNA的产生与作用方式,发现了新种类的小干扰RNA,发现了调控piRNA的产生与加工因子,解析了获得性遗传的分子机制。这项研究不仅对理解RNA的基础生物学有重要意义,而且有助于更好地将小RNA干扰技术用于研究和临床治疗。

项目成果

期刊论文数量(11)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
细胞核内小干扰RNA介导的表观遗传和基因表达调控
  • DOI:
    10.1360/n052016-00335
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    中国科学: 生命科学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    冯雪竹;光寿红
  • 通讯作者:
    光寿红
The USTC co-opts an ancient machinery to drive piRNA transcription in C. elegans
中国科学技术大学利用一种古老的机制来驱动线虫中的 piRNA 转录
  • DOI:
    10.1101/gad.319293.118
  • 发表时间:
    2018-12
  • 期刊:
    Genes & Development
  • 影响因子:
    10.5
  • 作者:
    Chenchun Weng;Joanna Kosalka;Ahmet C. Berkyurek;Przemyslaw Stempor;Xuezhu Feng;Hui Mao;Chenming Zeng;Wen-Jun Li;Yong-Hong Yan;Meng-Qiu Dong;Natalia Rosalía Morero;Cecilia Zuliani;Orsolya Barabas;Julie Ahringer;Shouhong Guang;Eric Miska
  • 通讯作者:
    Eric Miska
The Functions of Non-coding RNAs in rRNA Regulation
非编码RNA在rRNA调控中的功能
  • DOI:
    10.3389/fgene.2019.00290
  • 发表时间:
    2019-04-05
  • 期刊:
    FRONTIERS IN GENETICS
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Yan, Qi;Zhu, Chengming;Feng, Xuezhu
  • 通讯作者:
    Feng, Xuezhu
A new layer of rRNA regulation by small interference RNAs and the nuclear RNAi pathway.
小干扰 RNA 和核 RNAi 途径的新 rRNA 调控层。
  • DOI:
    10.1080/15476286.2017.1341034
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    RNA Biol
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Zhou Xufei;Chen Xiangyang;Wang Yun;Feng Xuezhu;Guang Shouhong
  • 通讯作者:
    Guang Shouhong
RdRP-synthesized antisense ribosomal siRNAs silence pre-rRNA via the nuclear RNAi pathway
RdRP 合成的反义核糖体 siRNA 通过核 RNAi 途径沉默前 rRNA
  • DOI:
    10.1038/nsmb.3376
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    Nature Structural & Molecular Biology
  • 影响因子:
    16.8
  • 作者:
    Xufei Zhou;Xuezhu Feng;Hui Mao;Mu Li;Fei Xu;Kai Hu;光寿红
  • 通讯作者:
    光寿红

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其他文献

秀丽线虫细胞核内小干扰RNA调控基因表达的机制研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    中国科学技术大学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    冯雪竹;光寿红
  • 通讯作者:
    光寿红

其他文献

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piRNA的产生与作用机制
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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