一种新型耐热非特异性核酸酶的作用机制及功能进化研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31100583
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    23.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0505.蛋白质、多肽与酶生物化学
  • 结题年份:
    2014
  • 批准年份:
    2011
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2012-01-01 至2014-12-31

项目摘要

非特异性核酸酶能非特异性地降解几乎所有形式的核酸,用途广泛。来自小肠肠炎耶尔森菌的非特异性核酸酶,不仅具有非特异性,而且具有热稳定性(100℃加热20min,仍有酶活)及广泛的适用性(超级耐酸碱、耐冷热,耐化学物质),目前国内外没有关于其的相关报道。本项目将首先明确Y.e.p核酸酶的核苷酸序列,然后通过基因工程手段构建Y.e.p核酸酶高产菌株;另外本项目将阐明重组Y.e.p核酸酶的作用机制;分析Y.e.p核酸酶的耐热机制,在此基础上展开Y.e.p核酸酶的功能进化研究,期望为Y.e.p非特异性核酸酶的工业化应用提供理论基础。

结项摘要

来自小肠肠炎耶尔森菌的核酸酶,不仅具有非特异性,而且具有热稳定性及广泛的适用性,目前国内外没有关于其的相关报道,鉴于其广阔的应用前景和广泛的适用性,本项目对其进行了相关研究。主要内容包括: Y.e.p 非特异性核酸酶高产菌株构建;Y.e.p 非特异性核酸酶酶学性质研究;Y.e.p 非特异性核酸酶的定点突变研究。研究结果如下:(1)利用已知Y.e.e非特异性核酸酶基因(YE2923)的侧翼序列,做同源分析及蛋白质序列比对,找到保守序列,设计兼并引物,扩增出Y.e.p非特异性核酸酶片段,从而明确了Y.e.p非特异性核酸酶的核苷酸序列及氨基酸序列;(2)利用大肠杆菌原核表达系统,构建了Y.e.p非特异性核酸酶高产菌株,质粒载体pET24a转入BL21 StarTM(DE3) PlysS表达效果最好;(3)利用单因素及曲面响应法优化诱导条件,最佳条件下蛋白表达量达到 1.5 mg/mL;(4)利用Ni-NTA亲和层析柱纯化获得重组蛋白纯度大于90%;(5)通过对重组Y.e.p核酸酶酶学性质研究,确定了其最适作用温度55 ℃,最适作用pH为7.0,20mM MgCl2作为激活剂;(6)通过稳定性研究确定 MgCl2,BSA,30%及以下浓度的甘油可以作为该重组核酸酶保藏的稳定剂;且该酶的热稳定性及酸碱稳定性相当好,耐各种化学试剂(2-8mMSDS,120 mM EDTA,2-10mM的盐酸胍);(7)对重组核酸酶的作用方式进行了研究,结果表明Y.e.p核酸酶对 dsDNA、ssDNA、λ-DNA、质粒和RNA具有降解效果,且降解率达到100%,说明此酶属于非特异性核酸酶,且同时具有内切和外切的作用方式;(8)通过对Y.e.p核酸酶的定点突变研究发现E202A,I203F,D264E这三个位点的氨基酸改变能引起酶活的变化及热稳定性变化,由此推测Glu202, Ile203 and Asp264可能是影响Y.e.p非特异性核酸酶酶活和热稳定性的关键氨基酸残基;(9)通过对Y.e.p核酸酶活性位点、盐桥和二硫键的定点突变研究,改变活性位点氨基酸、破坏盐桥和二硫键组成,发现Y.e.p非特异性核酸酶的酶活和热稳定性急剧下降,说明活性位点对维持Y.e.p核酸酶的酶活,盐桥和二硫键对维持Y.e.p核酸酶的热稳定性具有重要作用。

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
核酸酶定向进化技术研究进展
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    杭州师范大学学报(自然科学版)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    李珍华;章志量;方秀娟;李燕琼;石陆娥
  • 通讯作者:
    石陆娥
Bioinformatics analysis of a non-specific nuclease from Yersinia enterocolitica subsp. palearctica
小肠结肠炎耶尔森氏菌亚种非特异性核酸酶的生物信息学分析。
  • DOI:
    10.1016/j.compbiolchem.2013.09.003
  • 发表时间:
    2013-12
  • 期刊:
    Computational Biology and Chemistry
  • 影响因子:
    3.1
  • 作者:
    石陆娥
  • 通讯作者:
    石陆娥
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  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    Biotechnology & Biotechnological Equipment, 28(3)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    方秀娟;唐振兴;李珍华;章志量;石陆娥
  • 通讯作者:
    石陆娥

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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