淀粉样肽聚集机制的计算机模拟研究

淀粉样肽是一类在一定条件下发生异常折叠、聚集而形成不溶于水的淀粉样纤维的多肽或蛋白质。淀粉样纤维沉积是许多人类疾病的重要特征。研究表明，淀粉样肽的聚集导致了细胞毒性，而具有毒性的聚集体很可能是淀粉样纤维以及在聚集早期形成的寡聚体。由于淀粉样肽聚集跟多种疾病有关，从而成为当今科学研究中的前沿课题之一。然而，由于淀粉样纤维的形成过程非常复杂，涉及到各种各样的淀粉样形貌和低聚体中间态，所以其形成机制尚不清楚。本课题将用有效搜索蛋白质构象空间的方法- - Activation Relaxation Technique和并行温度分子动力学模拟,分别结合简化的蛋白质模型及全原子蛋白质模型来研究淀粉样肽的聚集问题。通过分析聚集过程中形成的寡聚体的结构特征、寡聚体的组装路径、淀粉样纤维的生长模式、氨基酸序列以及温度对聚集的影响等，来认识和探索淀粉样纤维形成的分子机制。