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淀粉样肽聚集机制的计算机模拟研究
结题报告
批准号:
10674029
项目类别:
面上项目
资助金额:
32.0 万元
负责人:
韦广红
依托单位:
学科分类:
A2014.凝聚态物理新兴与交叉领域
结题年份:
2009
批准年份:
2006
项目状态:
已结题
项目参与者:
梁崇文、宋维、郭治
国基评审专家1V1指导 中标率高出同行96.8%
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中文摘要
淀粉样肽是一类在一定条件下发生异常折叠、聚集而形成不溶于水的淀粉样纤维的多肽或蛋白质。淀粉样纤维沉积是许多人类疾病的重要特征。研究表明,淀粉样肽的聚集导致了细胞毒性,而具有毒性的聚集体很可能是淀粉样纤维以及在聚集早期形成的寡聚体。由于淀粉样肽聚集跟多种疾病有关,从而成为当今科学研究中的前沿课题之一。然而,由于淀粉样纤维的形成过程非常复杂,涉及到各种各样的淀粉样形貌和低聚体中间态,所以其形成机制尚不清楚。本课题将用有效搜索蛋白质构象空间的方法- - Activation Relaxation Technique和并行温度分子动力学模拟,分别结合简化的蛋白质模型及全原子蛋白质模型来研究淀粉样肽的聚集问题。通过分析聚集过程中形成的寡聚体的结构特征、寡聚体的组装路径、淀粉样纤维的生长模式、氨基酸序列以及温度对聚集的影响等,来认识和探索淀粉样纤维形成的分子机制。
英文摘要
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Effects of the RGTFEGKF Inhibitor on the Structures of the Transmembrane Fragment 70-86 of Glycophorin A: An All-Atom Molecular Dynamics Study
RGTFEGKF 抑制剂对血型糖蛋白 A 跨膜片段 70-86 结构的影响:全原子分子动力学研究
DOI:--
发表时间:--
期刊:
影响因子:--
作者:
通讯作者:
The (-strand-loop-(-strand conformation is marginally populated in (2-microglobulin (20-41) peptide in solution as revealed by replica exchange molecular dynamics simulations
复制品交换分子动力学模拟显示,溶液中的 (2-微球蛋白 (20-41) 肽中存在少量的 (-链-环-(-链构象)
DOI:--
发表时间:--
期刊:
影响因子:--
作者:
通讯作者:
DOI:10.4161/pri.1.1.3969
发表时间:2007-01
期刊:Prion
影响因子:2.3
作者:Guanghong Wei;N. Mousseau;P. Derreumaux
通讯作者:Guanghong Wei;N. Mousseau;P. Derreumaux
Self-assembly of the (2-microglobulin NHVTLSQ peptide using coarse-grained protein model reveals (-barrel species
使用粗粒蛋白模型自组装 (2-微球蛋白 NHVTLSQ 肽) 揭示了 (-桶物种
DOI:--
发表时间:--
期刊:
影响因子:--
作者:
通讯作者:
天然无序蛋白液—液相分离和液—固相变机理的计算模拟研究
  • 批准号:
    12374208
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    52.00万元
  • 批准年份:
    2023
  • 负责人:
    韦广红
  • 依托单位:
固有无序蛋白液-液相分离微观机制的分子模拟研究
  • 批准号:
    22ZR1406800
  • 项目类别:
    省市级项目
  • 资助金额:
    0.0万元
  • 批准年份:
    2022
  • 负责人:
    韦广红
  • 依托单位:
ALS相关蛋白低复杂度结构域多肽自组装和相分离的分子模拟研究
  • 批准号:
    --
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    62万元
  • 批准年份:
    2020
  • 负责人:
    韦广红
  • 依托单位:
天然小分子化合物抑制固有无序蛋白聚集的微观机理研究
  • 批准号:
    11674065
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    70.0万元
  • 批准年份:
    2016
  • 负责人:
    韦广红
  • 依托单位:
纳米颗粒调控淀粉样肽聚集的物理机制研究
  • 批准号:
    11274075
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    78.0万元
  • 批准年份:
    2012
  • 负责人:
    韦广红
  • 依托单位:
多肽自组装的多尺度分子模拟研究(四)
  • 批准号:
    91227102
  • 项目类别:
    重大研究计划
  • 资助金额:
    75.0万元
  • 批准年份:
    2012
  • 负责人:
    韦广红
  • 依托单位:
淀粉样肽与生物膜相互作用的分子动力学模拟研究
  • 批准号:
    11074047
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    37.0万元
  • 批准年份:
    2010
  • 负责人:
    韦广红
  • 依托单位:
国内基金
海外基金