基于eDNA宏条形码技术解析氨氮污染的群落效应及其机制

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    41807482
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    25.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    D0708.生态毒理学
  • 结题年份:
    2021
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2021-12-31

项目摘要

With the increasing impacts of human activities on the global nitrogen cycle, the adverse ecological effects of ammonia pollution on aquatic ecosystem has been attracted more attentions from public and scientists. However, previous studies paid more attention to the direct toxic of ammonia on individual and sub individual level, ignoring the bio-interactions. In this study, a new genetic tool (eDNA metabarcoding) was created to explore the ecological effect and interference mechanism of ammonia on field microcosm experiments. Both direct and indirect effects of ammonia on various ecological groups were analyzed by eDNA metabarcoding. The ecological networks of microcosm were constructed by eDNA and machine learning approach. Explore the interference mechanism of ammonia`s ecological effect via integrating ecological networks and direct effect of ammonia. This study also provides novelty insights and a useful methodology for the ecological effects of other pollutants via the eDNA metabarcoding technology.
随着人类活动对全球氮循环的改变,氨氮污染已经对天然水生生态系统产生严重危害,氨氮的生态效应也备受关注。基于野外的群落调查表明氨氮对水生生态群落的影响明显被低估,这是因为以往对氨氮生态效应的研究主要基于实验室生物毒性测试,而忽略了物种间相互作用的影响,难以准确评估氨氮污染产生的实际生态效应。本项目拟通过野外微宇宙实验,利用新型环境DNA宏条形码技术,研究氨氮对微宇宙各生态类群的直接毒性和间接作用,解析氨氮污染的群落效应及其机制。首先,应用eDNA宏条形码技术全面系统地研究氨氮对微宇宙各生态类群的直接影响;其次,基于eDNA和机器学习构建微宇宙生态网络,研究氨氮对生态网络中各生态类群的间接作用;最后,综合氨氮的直接影响和间接作用,解析氨氮群落效应的干扰机制。本研究也为利用eDNA宏条形码技术研究其他污染物的生态效应提供有益的借鉴和方法学参照。

结项摘要

城市化和工业化的快速发展导致大量有毒有害物质进入环境,严重威胁生态安全和人类健康。基于野外的群落调查表明污染物对水生生物的影响被明显低估,这是由于以往对污染的研究主要基于实验室单物种毒性测试,忽略了物种间相互作用。本项目通过野外微宇宙实验,利用新型环境DNA宏条形码技术,研究氨氮等污染物对微宇宙各生态类群的影响。研究1)建立和优化了环境DNA 精准生物监测方法。研发了环境DNA一体化过滤器,实现了痕量环境DNA的高浓度富集和水生生物的高通量识别。2)原位微宇宙实验模拟典型环境污染物(氨氮和铜)的长期低剂量暴露,利用环境DNA研究个体层面、群落层面的毒性效应。发现环境DNA识别出大量形态学无法检测到的“敏感”和“耐受”物种,实验室毒性实验发现的“受影响”物种中有超过一半能被野外实验所验证。污染物的毒性作用能显著改变生物间的相互作用。随污染物浓度的不断增加,生态系统的生物网络的复杂性在逐渐下降,从循环的“环形”逐渐转变为不可逆的线性。环境DNA调查显示,氨氮显著改变了太湖流域浮游动物群落组成,氨氮主要抑制水体中的大型浮游动物枝角类和桡足类,导致水体轮虫比例增加,在氨氮胁迫降低后,软体动物群落得到有效恢复,轮虫的比例下降。3) 基于环境DNA的水生态健康评价。基于环境DNA数据计算生物指数,利用机器学习模型分析环境DNA指数的季节差异以及与水质的相关性,筛选出能指示环境质量的环境DNA指数形成完全基于环境DNA的水生态健康评估方法。本研究基于野外微宇宙体系和eDNA宏条形码技术研究污染的群落效应,弥补了传统实验室毒性测试的不足,也为利用eDNA宏条形码技术研究其他污染物的生态效应提供有益的借鉴和方法学参照。

项目成果

期刊论文数量(5)
专著数量(0)
科研奖励数量(2)
会议论文数量(0)
专利数量(5)
浮游动物 DNA 宏条形码标志基因比较研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    生态毒理学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    高旭;杨江华;张效伟
  • 通讯作者:
    张效伟
eDNA metabarcoding in zooplankton improves the ecological status assessment of aquatic ecosystems
浮游动物的 eDNA 元条形码可改善水生生态系统的生态状况评估
  • DOI:
    10.1016/j.envint.2019.105230
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    Environment International
  • 影响因子:
    11.8
  • 作者:
    Yang Jianghua;Zhang Xiaowei
  • 通讯作者:
    Zhang Xiaowei
浮游动物DNA宏条形码多样性监测采样方法研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    环境监控与预警
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    张靖雯;杨江华;张效伟
  • 通讯作者:
    张效伟
Environmental DNA Metabarcoding Supporting Community Assessment of Environmental Stressors in a Field-Based Sediment Microcosm Study
环境 DNA 元条形码支持现场沉积物微观研究中环境压力​​源的社区评估
  • DOI:
    10.1021/acs.est.8b04903
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    Environmental Science & Technology
  • 影响因子:
    11.4
  • 作者:
    Yang Jianghua;Jeppe Katherine;Pettigrove Vincent;Zhang Xiaowei
  • 通讯作者:
    Zhang Xiaowei

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi || "--"}}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year || "--" }}
  • 期刊:
    {{ item.journal_name }}
  • 影响因子:
    {{ item.factor || "--"}}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

其他文献

免疫磁珠法分选小鼠肝脏Kupffer细胞及其特性观察
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    皖南医学院学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    杨江华
  • 通讯作者:
    杨江华
氯化钆对日本血吸虫病肉芽肿期肝脏调节性T细胞产生的抑制作用
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    中国人兽共患病杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    杨江华
  • 通讯作者:
    杨江华
Gadolinium chloride inhibits Schistosoma japonicum-induced hepatic injury and immunopatholog
氯化钆抑制日本血吸虫引起的肝损伤及免疫病理学
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    The Journal of Parasitology
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    杨江华
  • 通讯作者:
    杨江华
Kupffer细胞对日本血吸虫病肉芽肿期CD4+CD25+T细胞的影响
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    中国血吸虫病防治杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    杨江华
  • 通讯作者:
    杨江华
Kupffer细胞在血吸虫病肝纤维化中的作用
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    中国血吸虫病防治杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    杨江华
  • 通讯作者:
    杨江华

其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi || "--" }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year || "--"}}
  • 期刊:
    {{ item.journal_name }}
  • 影响因子:
    {{ item.factor || "--" }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}
empty
内容获取失败,请点击重试
重试联系客服
title开始分析
查看分析示例
此项目为已结题,我已根据课题信息分析并撰写以下内容,帮您拓宽课题思路:

AI项目思路

AI技术路线图

杨江华的其他基金

鱼类eDNA的赋存形态及环境持久性研究
  • 批准号:
    42377277
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    49 万元
  • 项目类别:
    面上项目

相似国自然基金

{{ item.name }}
  • 批准号:
    {{ item.ratify_no }}
  • 批准年份:
    {{ item.approval_year }}
  • 资助金额:
    {{ item.support_num }}
  • 项目类别:
    {{ item.project_type }}

相似海外基金

{{ item.name }}
{{ item.translate_name }}
  • 批准号:
    {{ item.ratify_no }}
  • 财政年份:
    {{ item.approval_year }}
  • 资助金额:
    {{ item.support_num }}
  • 项目类别:
    {{ item.project_type }}
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了

AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
关闭
close
客服二维码