地衣共生系统中地衣细菌群落结构及其功能研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31600100
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    21.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0106.微生物与环境互作
  • 结题年份:
    2019
  • 批准年份:
    2016
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2017-01-01 至2019-12-31

项目摘要

Non-photoautotrophic bacteriobionts (Lichen bacteria) are increasingly regarded as the integral lichen symbionts in addition to the photobionts and mycobionts, which complement the nitrogen budget of lichen thallus. Our previous study has shown that lichen secondary compounds play key roles in the formation of bacteriobiont community. This important discovery uncovers many new scientific problems: ①The composition of bacteriobiont communities in chlorolichens and cyanolichens, which both have no lichen secondary compound. ②The effect on distribution of bacteriobionts in lichen thallus by lichen secondary compounds. ③The differences of selectivity for Lichen bacteria among lichen secondary compounds. In order to thoroughly clarify the correlation between lichen secondary compounds and Lichen bacteria, the microbial communities and their potential biological activities in medicinal lichen, we will study these scientific questions above mentioned by the technologies of metagenomic shotgun sequencing, Illumina MiSeq for envirenmental bacteria 16S rDNA, isolation and culture, molecular identification, TLC, and HPLC. These studies will systematically elucidate the role and function of lichen bacterial communities in lichen ecosystems.
越来越多的证据表明地衣共生系统中除了共生真菌、光合共生物以外,还包括为地衣体提供氮素营养的非光合共生细菌(地衣细菌)。我们的前期研究首次证明了共生真菌以累积次生代谢产物为共生细菌提供碳源的方式,控制着地衣共生细菌群落的构成。这一重要自然现象的发现提出了许多有关地衣次生代谢产物与地衣细菌群落相互关系的新课题:①无地衣次生代谢产物的绿藻地衣和蓝细菌地衣中共生细菌的群落构成;②地衣次生代谢产物对共生细菌在地衣体中分布状况的影响;③不同地衣次生代谢产物对地衣细菌的选择作用有何异同;本项目拟应用宏基因组学技术、环境细菌16S rDNA高通量基因测序技术、细菌的分离培养与分子鉴定技术、以及薄层色谱和高效液相色谱等技术就上述科学问题展开研究,以期分析地衣次生代谢产物与地衣细菌的相互关系,以及药用地衣中微生物群落及其潜在生物活性功能,系统地阐明地衣细菌群落在地衣生态系统中作用和功能。

结项摘要

地衣体是一个复杂的微生态共生系统,课题组前期研究表明地衣共生真菌产生次生代谢产物为共生细菌提供碳源,并影响着共生细菌群落。本项目继续通过细菌高通量测序技术、分离培养与鉴定技术等对地衣共生系统中地衣细菌群落结构及其功能展开深入研究,结果表明:地衣中存在着各种自由生活的地衣共生细菌,地衣共生细菌并没有与共生真菌和光合共生物(绿藻和蓝藻)形成专性共生关系,地衣次生代谢产物作为主因子,地理位置环境、共生藻类型、基质等作为次因子,调控着地衣共生细菌群落的构成。地衣共生细菌群落中以α-变形菌纲根瘤菌目为最优势的目,主要功能为固氮作用;放线菌纲作为地衣共生细菌的次优势种群,对其他共生者具有保护功能;地衣中还存在大量兼具纤维素降解、苯酚降解、溶磷能力和固氮能力的非光合细菌。药用地衣树花属微生物中真菌类型以子囊菌、散囊菌为主,细菌类型中变形菌、酸杆菌等较为丰富,地衣微生物主要参与固碳、固氮等生态功能。地衣细菌中还存在大量未分类种群,通过多相分类方法对地衣细菌新种进行了鉴定,并结合基因组测序对其次生代谢产物进行初步研究。本项目通过研究地衣细菌的种类和潜在的生物学功能,深入探讨地衣细菌群落与宿主的关系,为探讨地衣细菌在地衣共生系统中分布和功能提供了重要的实验数据。项目资助发表SCI论文1篇。培养了4名硕士生。

项目成果

期刊论文数量(1)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Subtercola lobariae sp nov., an actinobacterium of the family Microbacteriaceae isolated from the lichen Lobaria retigera
Subtercola lobariae sp nov.,从地衣 Lobaria retigera 中分离出的微杆菌科放线菌
  • DOI:
    10.1099/ijsem.0.001753
  • 发表时间:
    2017-05-01
  • 期刊:
    INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY
  • 影响因子:
    2.8
  • 作者:
    Si, Hong-Li;Shi, Fei-Xiang;Zhao, Zun-Tian
  • 通讯作者:
    Zhao, Zun-Tian

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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