表观遗传变异和基因组变异不同，具有可逆性和细胞特异性，发生在肿瘤起始细胞（肿瘤干细胞）中的表观遗传变异可能是肿瘤发生中起驱动作用的表观遗传变异，但肿瘤干细胞可能只占肿瘤细胞群体中很小的比例（也可能很大）。课题初期研究发现：采用目前细胞表面标记物分选的肿瘤干细胞，在患者之间无论在数目和表型上都有非常大异质性，且目前的方法都只能富集肿瘤干细胞，而不能保证100%纯度的肿瘤干细胞。而该课题的核心科学问题是大量的表观遗传变异是否在肿瘤发生过程中起驱动作用。因此，我们继续从以下两个方面开展研究：1）正常细胞分化过程中DNA甲基化重编程的基本规律；2）肿瘤微环境能否通过非基因组变异的方式促进肿瘤发生；研究取得了良好进展，主要研究结果发表于Cell、Cancer Cell等核心期刊。揭示表观遗传信息在胚胎发育过程中遗传规律；以及低氧微环境促进肿瘤发生中的新机制，为进一步肿瘤早诊、预测和靶向治疗提供了理论依据。