基因功能SNPs与DNA甲基化对精神分裂症易感性的协同影响

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    81071091
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    32.0万
  • 负责人：
    张红星
  • 依托单位：
    新乡医学院
  • 学科分类：
    H1005.精神分裂症及精神病性障碍
  • 结题年份：
    2013
  • 批准年份：
    2010
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2011-01-01 至2013-12-31

项目摘要

精神分裂症是一种重性精神疾病，双生子与寄养子研究及大量遗传关联分析均表明遗传因素参与精神分裂症的发生，但同卵双生同病率只有48%；存在不少迟发患者；且多数患者可以通过治疗缓解症状。表观遗传机制被认为是可以更好解释这些特征的理想理论。甲基化修饰是表观遗传最常见、最重要的类型。本课题拟借助Illumina的高通量分析平台，应用以Infinium技术为基础的全基因组芯片，采用POOL方法进行全基因组功能SNPs筛选，同时进行全基因组甲基化状态检测，筛选阳性甲基化位点，继而应用GoldenGate技术定制低密度芯片进行大样本基因阳性SNPs和阳性甲基化位点检测，分析多态位点、甲基化位点、多态位点与甲基化位点与精神分裂症之间的关联，以期得到精神分裂症的多基因易感发病模式、表观遗传发病模式及二者协加作用的遗传易感性发病模式，将为精神分裂症病因学研究揭开新的一页，为治疗学研究提供新的思路。

结项摘要

精神分裂症是一种重性精神疾病，双生子与寄养子研究及大量遗传关联分析均表明遗传因素参与精神分裂症的发生，但同卵双生同病率只有48%；存在不少迟发患者；且多数患者可以通过治疗缓解症状。表观遗传机制被认为是可以更好解释这些特征的理想理论。甲基化修饰是表观遗传最常见、最重要的类型。本课题借助Illumina的高通量分析平台，应用以Infinium技术为基础的全基因组芯片，分为三步进行，首先纳入首发精神分裂症患者与健康对照各600例，一方面通过采用Pooling DNA的方法进行全基因组功能SNPs筛选，同时进行全基因组甲基化状态检测，筛选甲基化程度差异位点，通过差异SNPs与甲基化差异位点联合分析，初步获得了SNPs与甲基化水平差异位点、差异SNPs与差异甲基化位点定位信息（共基因或物理距离较近）。. 进一步在32例首发偏执型精神分裂症患者及32例匹配的健康对照个体进行全基因组DNA甲基化位点检测进行验证甲基化水平差异信息，GenomeStudio Methylation Module v1.8进行了初步数据分析，以Beta值计算CpG 位点的甲基化程度，以病例与对照Beta差值绝对值大于0.15导出实验结果，按t检验DiffScore绝对值大于13，即相当于p值<0.05来过滤分析得出差异位点。检出低甲基化差异位点78个，高甲基化差异位点116个。其中女性患者病例与女性对照差异位点低甲基化56个，高甲基化45个；男性患者病例与男性对照差异位点低甲基化61个，高甲基化42个。男性与女性均表现出甲基化程度差异的位点有21个，变化一致的位点有11个。. 结合32例首发偏执型精神分裂症患者与全基因组Pooling DNA甲基化筛选结果，以参与生物学过程通路为依据，差异分布的关联SNP主要集中在：神经发育、离子通道、氧化应激与免疫调节等通路。结合相关文献资料、上述实验结果及基因生物学功能，选择了这四条通路上16个基因22个SNP位点和28个甲基化位点，应用golden-gate定制芯片在480例首发偏执型患者及480例对照中进行DNA甲基化位点及SNPs重验工作。发现NNAT、RANBP2、RELN及MYTL1等基因的甲基化状态显著存在显著性。与前期结果一致。. 表观遗传与遗传因素共同参与精神分裂症的发病，且主要表现与神经发育及神经功能维持相关基因。

项目成果

期刊论文数量（12）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
地卓西平马来酸盐精神分裂症模型大鼠神经调节蛋白-1基因前额叶皮质与外周表达关系
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2012
  • 期刊：
    中华精神科杂志
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    李红;张红星;李文强;李巍;吕路线
  • 通讯作者：
    吕路线
精神分裂症患者外周血神经调节蛋白1基因mRNA的表达变化的验证性研究
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2011
  • 期刊：
    中华医学遗传学杂志
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    张红星;李文强;张海三;张燕;赵靖平;吕路线
  • 通讯作者：
    吕路线
association study of myelin transcription factor 1-like polymorphism with schizophrenia in Han Chinese population.
中国汉族人群髓磷脂转录因子1样多态性与精神分裂症的关联研究
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2012
  • 期刊：
    Genes, Brain and Behavior
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    Lv L;Wang X;Zhao J;Lin J;Song X;Yang Y;Jiang C, , ,;Yang G;Xiao B
  • 通讯作者：
    Xiao B
Association study of RELN polymorphisms with schizophrenia in Han Chinese population
中国汉族人群RELN多态性与精神分裂症的关联研究
  • DOI：
    10.1016/j.pnpbp.2011.04.007
  • 发表时间：
    2011-08-01
  • 期刊：
    PROGRESS IN NEURO-PSYCHOPHARMACOLOGY & BIOLOGICAL PSYCHIATRY
  • 影响因子：
    5.6
  • 作者：
    Li, Wenqiang;Song, Xueqin;Lv, Luxian
  • 通讯作者：
    Lv, Luxian
Association of ZNF804A polymorphisms with schizophrenia and antipsychotic drug efficacy in a Chinese Han population
中国汉族人群ZNF804A多态性与精神分裂症及抗精神病药物疗效的关联
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    Psychiatry Research
  • 影响因子：
    11.3
  • 作者：
    Xiao, Bo;Zhao, Jingyuan;Lu, Tianlan;Zhang, Dai;Yue, Weihua;Li, Wenqiang;Zhang, Hongxing;Lv, Luxian;Song, Xueqin;Yang, Yongfeng;Li, Wei;Yang, Ge;Jiang, Chengdi
  • 通讯作者：
    Jiang, Chengdi

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其他文献

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  • DOI：
    --
  • 发表时间：
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    张红星
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  • DOI：
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  • 通讯作者：
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    --
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  • 影响因子：
    --
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电针通过SCF/c-kit通路对功能性消化不良模型 大鼠Cajal间质细胞以及Cx43表达的影响
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  • 发表时间：
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    --
  • 作者：
    张晓明;辛玉;康朝霞;徐派的;张红星
  • 通讯作者：
    张红星

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电休克刺激对SD大鼠脑中枢神经系统可塑性的影响
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  • 项目类别：
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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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