神经限制性沉默因子REST对逆转录转座子LINE-1转座的表观遗传学调控

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31301063
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    24.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0602.基因表达及非编码序列调控
  • 结题年份:
    2016
  • 批准年份:
    2013
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2014-01-01 至2016-12-31

项目摘要

Retrotransposon LINE-1 is major driving force in genome evolution. As reported, the transposition and insertion of LINE-1 could potentially cause various diseases including cancers and its methylation status has been actively investigated as a diagnostic and prodiagonistic biomarker. Despite the scientific and clinical significance of LINE-1 research our knowledge of the mechanisms controlling LINE-1 transposition and methylation remains very limited. REST is a master transcription repressor and epigenetic factor capable to modulate the expression of thousands of genes and crucial in many physiological and pathological processes. We have recently made a conditional REST knockout mouse allelle and uncovered a key role of REST in epigenetic control of adult neural stem cell fates and the progression of neurogenesis. Importantly consistent with an earlier bioinformatic studies, our preliminary results suggest LINE-1 could potentially be REST target genes. In this proposed study, we will utilize the conditional REST knockout allele and robust quiescent neural stem cell culture systems we have developed. We aim to elucidate the epigenetic mechanisms of REST and its corepressor complexes in modulating the dynamic expression, transposition and methylation of LINE-1 in neural regeneratin and neural cells. For pathological conditions, we choose to dissect the epigenetics underlying how HDAC inhibitors(VPA/TSA) and REST control the activity of LINE-1 both in established tumor cell lines and in primary cancer cells. This proposed study has the potential to shed much needed light on the epigenetic control of LINE-1 activity and to elucidate how LINE-1 and REST may be implicated in relevant pathogenesis and/or therapy. Eventually we hope that our studies can provide novel insights and thinking in disease diagonistics and treatments.
逆转录转座子LINE-1是介导基因组进化的主要动力,转座引起的突变能导致癌症等疾病,而其甲基化状态正成为疾病诊断和疗效的生物标记物。虽然LINE-1研究的科学和临床意义重大,但我们对其调控机制知之甚少。REST是重要的转录和表观遗传分子,影响数千个基因的表达,已有数据提示LINE-1及相关转座子序列是潜在的REST靶基因。结合神经干细胞静息培养体系和条件性REST基因敲除小鼠模型,我们希望解析在神经再生和神经细胞中REST及其抑制复合体对LINE-1表达、转座和甲基化动态的表观遗传调控。在癌组织和细胞系中阐明HDAC抑制剂(VPA/TSA)和REST对LINE-1及相关序列的调控。结合多学科方法学和技术体系,本研究将为神经相关疾病和癌症中LINE-1的调控提供可能的机理,并提示LINE-1和REST在疾病发生和治疗中的可能机制,为诊断治疗提供新的理论基础和策略。

结项摘要

项目成果

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脑胶质瘤个体化治疗指导系统的探索
  • 批准号:
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  • 项目类别:
    面上项目

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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