依据进化经济学理论，利用多自主体multiagent-based模拟，本项目系统地发展了诺贝尔经济学奖得主克鲁格曼的“两个本性”(two nature) 学说为“三个本性”，即自然禀赋、交通与区位、人力资本与信息设施作为三次地理要素，引导了产业的三次发展和国土分异。模拟分析，中国国土分异，胡焕庸具有锁定特征，城市发展，具有明显的路径依赖特点。在这个基础上，模拟分析三个本性催生了区域空间结构依次出现独立单元、中心腹地结构和枢纽网络结构。.项目对中国国土的具体研究发现，中国存在一个菱形的中心腹地结构，也发现了未来中国枢纽网络结构将在胡焕庸线以东完整发展。在第三本性作用下，中国的R&D活动及其投入促进了区域的收敛性，利用第三本性是中国进一步发展的关键。.项目对第三本性作用下区域发展做了管理学分析，提出了中国国土空间发展，下一步的战略应该是发展研发枢纽城市。项目通过案例分析提出了研发枢纽城市发展的区域战略管理模式，并且辨识了我国适合发展研发枢纽的城市及其专业化方向。.项目还针对主体功能区管理战略自主开发了多区域CGE模拟系统，发现了主体功能区管理模式的优点和风险，并且模拟提出了三种主体功能区治理政策的结果。