蛋白质上甲硫氨酸的可逆氧化修饰及其在细胞信号转导中的功能

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    21877096
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    67.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    B0702.生物分子的化学生物学
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2022-12-31

项目摘要

Protein post-translational modifications are the chemical foundations in the regulation of cell signaling pathway. Take protein phosphorylation as an example, it is widely adapted in various cell signaling pathways. In aerobic organisms, the reversible oxidation of protein-bound cysteine and methionine plays a key role in cellular redox signaling. The molecular mechanism of the reversible oxidation of cysteine in cell signaling is relatively clear. However, the molecular mechanism of the reversible oxidation of methionine in cell signaling is largely unknown. From the chemistry perspective, the reversible oxidation of methionine brings a big impact on protein structure. Besides, previous studies showed that reversible methionine oxidation of actin regulates its dynamic assembly process. Herein, we proposed to develop chemical biology strategies to study the reversible oxidation of protein-bound methionine and its functions in cell signaling. In more specific, we proposed to develop chemical biology probes to specifically label methionine or its oxidized product, and then quantitatively study the functions of reversible oxidation of methionine on key proteins that play roles in cell signaling; we also proposed to apply chemoproteomic technologies to identify redox-sensitive methionine residues and uncover their functions in cell signaling.
蛋白质翻译后修饰是细胞信号转导调控的重要化学基础。以蛋白质磷酸化为代表的可逆翻译后修饰过程在细胞信号通路调控中被广泛应用。在耗氧生物中,蛋白质上半胱氨酸和甲硫氨酸的可逆氧化修饰在氧化还原信号转导中扮演着重要作用。半胱氨酸的可逆氧化修饰在细胞信号转导过程中的调节机制研究较为明确,而甲硫氨酸的相关研究非常匮乏。从化学的角度上看,甲硫氨酸可逆氧化修饰,给蛋白质的结构带来了巨大的影响。且已有的研究表明,甲硫氨酸的可逆氧化修饰调控细胞微丝蛋白的动态组装。基于此,本研究拟发展系列化学生物学工具,研究甲硫氨酸在蛋白质上的可逆氧化并鉴定其在细胞信号转导中的新功能。通过发展甲硫氨酸和其氧化产物的特异性反应探针,定量地研究信号转导通路中重要蛋白上甲硫氨酸的可逆氧化修饰;结合化学蛋白质组学技术,鉴定在氧化还原信号转导通路中的氧化敏感的甲硫氨酸位点,并鉴定其在信号转导中的功能。

结项摘要

蛋白质翻译后修饰是细胞信号转导调控的重要化学基础。以蛋白质磷酸化为代表的可逆翻译后修饰过程在细胞信号通路调控中被广泛应用。在耗氧生物中,蛋白质上半胱氨酸和甲硫氨酸的可逆氧化修饰在氧化还原信号转导中扮演着重要作用。本项目利用化学生物学方法,根据甲硫氨酸的氧化还原性及其相关的蛋白质翻译后修饰的生化特性,取得系列研究进展。项目系统地综述了近年来发展的甲硫氨酸化学选择性修饰方法及其在多肽,蛋白质和蛋白质组标记中的系列应用和前景,并开展了氧氮环丙烷试剂的系列生物学应用;实现了甲硫酰化赖氨酸修饰的精准在体合成,并N端甲硫氨酸可被高效修饰的生化原理,发现了细胞中存在新型氨酰化赖氨酸泛素化修饰,并探索了新修饰的生物学功能和书写酶;开发了嵌合体翻译系统,以接近天然氨基酸的编码效率,高效、高特异地引入蛋白质精准修饰,并构建了依赖非天然氨基酸生长的合成微生物,通过工程改造Cation-Pi相互作用开发了亲和力显著提升的超级读码蛋白。.

项目成果

期刊论文数量(5)
专著数量(0)
科研奖励数量(1)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Directed-evolution of translation system for efficient unnatural amino acids incorporation and generalizable synthetic auxotroph construction.
用于有效非天然氨基酸掺入和可推广的合成营养缺陷型构建的翻译系统的定向进化
  • DOI:
    10.1038/s41467-021-27399-x
  • 发表时间:
    2021-12-02
  • 期刊:
    Nature communications
  • 影响因子:
    16.6
  • 作者:
    Zhao H;Ding W;Zang J;Yang Y;Liu C;Hu L;Chen Y;Liu G;Fang Y;Yuan Y;Lin S
  • 通讯作者:
    Lin S
Chemoselective Methionine Bioconjugation on a Polypeptide, Protein, and Proteome
多肽、蛋白质和蛋白质组上的化学选择性蛋氨酸生物缀合
  • DOI:
    10.1021/acs.biochem.9b00789
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    Biochemistry
  • 影响因子:
    2.9
  • 作者:
    Jia Zang;Yulin Chen;Wenxuan Zhu;Shixian Lin
  • 通讯作者:
    Shixian Lin
Probing the role of Aurora kinase A threonylation with site-specific lysine threonylation
通过位点特异性赖氨酸苏酰化探讨 Aurora 激酶 A 苏酰化的作用
  • DOI:
    10.1021/acschembio.1c00682
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    ACS Chemical Biology
  • 影响因子:
    4
  • 作者:
    Jia Zang;Yulin Chen;Chao Liu;Shixian Lin
  • 通讯作者:
    Shixian Lin

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其他文献

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林世贤的其他基金

蛋白质翻译后修饰定点展示系统的开发及其应用
  • 批准号:
    91953113
  • 批准年份:
    2019
  • 资助金额:
    60.0 万元
  • 项目类别:
    重大研究计划

相似国自然基金

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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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