甜菜黑色焦枯病毒卫星RNA与复制酶结合的关键区域定位

批准号:
31100115
项目类别:
青年科学基金项目
资助金额:
23.0 万元
负责人:
张永亮
依托单位:
学科分类:
C0107.病毒学
结题年份:
2014
批准年份:
2011
项目状态:
已结题
项目参与者:
李大伟、曹修岭、刘敏、张晓峰
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中文摘要
卫星RNA依赖于辅助病毒方能进行复制,并在许多植物病毒与寄主的相互作用中发挥重要作用,但目前尚无关于卫星RNA如何对辅助病毒复制酶(RNA dependent RNA polymerase, RdRp)进行识别、结合的研究报道。本研究将在已有工作的基础上,以在我国首先发现的甜菜黑色焦枯病毒(Beet black scorch virus, BBSV)卫星RNA为材料,对BBSV RdRp如何识别卫星RNA并支持其有效复制进行深入的研究。拟通过将复制能力发生变化的各种卫星RNA突变体分别与RdRp进行体外结合,分析各突变位点对RdRp识别结合能力的影响,并对卫星RNA中与RdRp结合的关键区域进行精确定位。所获得的结果将有助于认识辅助病毒如何支持卫星RNA的复制,进而了解卫星RNA参与病毒-寄主复杂互作体系的机制。
英文摘要
所有已知的植物病毒卫星RNA(sat-RNA)均依赖辅助病毒才能被有效复制,目前关于辅助病毒的复制酶(RdRp)如何与sat-RNA相互作用的信息仍非常有限。本研究以甜菜黑色焦枯病毒(Beet black scorch virus, BBSV)sat-RNA为材料,对BBSV RdRp 如何识别sat-RNA 并支持其有效复制进行深入的研究,并尝试解析BBSV/sat-RNA共侵染本生烟后,sat-RNA上出现siRNA降解热点的原因。首先通过原核表达纯化出有活性的RdRp(P82),凝胶阻滞(EMSA)检测结果表明纯化的P82能够正常结合sat-RNA,并且sat-RNA突变后,P82对突变的sat-RNA的结合能力要弱于野生型sat-RNA,以上结果与BBSV不能够有效的带动突变的sat-RNA进行复制相一致;此外,我们的结果证明sat-RNA上产生siRNA的热点区域不依赖于沉默通路中RdR6基因,而主要与辅助病毒BBSV的存在相关,以上结果表明BBSV RdRp不仅是维持sat-RNA活性所必需,还暗示着RdRp-sat-RNA的互作与sat-RNA来源的siRNA基因组分布特点存在着相关性,这为更全面的理解辅助病毒与sat-RNA的互作提供了有价值的信息。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
Validation of reference genes for gene expression studies in virus-infected Nicotiana benthamiana using quantitative real-time PCR.
使用定量实时 PCR 验证病毒感染的本塞姆氏烟草基因表达研究的参考基因
DOI:10.1371/journal.pone.0046451
发表时间:2012
期刊:PloS one
影响因子:3.7
作者:Liu D;Shi L;Han C;Yu J;Li D;Zhang Y
通讯作者:Zhang Y
The Complete Genome Sequence of Southern rice black-streaked dwarf virus Isolated from Vietnam
越南分离的南方水稻黑条矮缩病毒全基因组序列
DOI:10.5423/ppj.nt.03.2012.0035
发表时间:2012-12
期刊:Plant Pathology Journal
影响因子:2.3
作者:Thi-Sau Dinh1;Cuiji Zhou;Xiuling Cao;Chenggui Han;Jialin Yu;Dawei Li;Yongliang Zhang
通讯作者:Yongliang Zhang
N-terminal basic amino acid residues of Beet black scorch virus capsid protein play a critical role in virion assembly and systemic movement.
甜菜黑焦病病毒衣壳蛋白N端碱性氨基酸残基在病毒体组装和系统运动中发挥关键作用
DOI:10.1186/1743-422x-10-200
发表时间:2013-06-20
期刊:Virology journal
影响因子:4.8
作者:Zhang X;Zhao X;Zhang Y;Niu S;Qu F;Zhang Y;Han C;Yu J;Li D
通讯作者:Li D
DOI:10.1016/j.jbiotec.2013.08.008
发表时间:2013-10
期刊:Journal of biotechnology
影响因子:4.1
作者:Kun Zhang;Shaofang Niu;D. Di;Lindan Shi;Deshui Liu;Xiuling Cao;H. Miao;Xianbing Wang;Chenggui Han;Jialin Yu;Dawei Li;Yongliang Zhang
通讯作者:Kun Zhang;Shaofang Niu;D. Di;Lindan Shi;Deshui Liu;Xiuling Cao;H. Miao;Xianbing Wang;Chenggui Han;Jialin Yu;Dawei Li;Yongliang Zhang
BSR1免疫受体介导抗大麦条纹花叶病毒的分子机制解析
- 批准号:32320103003
- 项目类别:国际(地区)合作与交流项目
- 资助金额:206万元
- 批准年份:2023
- 负责人:张永亮
- 依托单位:
Reticulon家族蛋白在甜菜黑色焦枯病毒复制中的作用机理
- 批准号:31872637
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:59.0万元
- 批准年份:2018
- 负责人:张永亮
- 依托单位:
甜菜黑色焦枯病毒复制酶小亚基p23的亚细胞定位及其致病机制分析
- 批准号:31470253
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:84.0万元
- 批准年份:2014
- 负责人:张永亮
- 依托单位:
国内基金
海外基金
