用于研究膜蛋白中柔性残基的固体NMR新方法

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

项目摘要

Structural analyses of membrane proteins (MPs) are hotspots and challenges for the researches of proteins nowadays. Solid-state NMR (ssNMR) has special advantages in structural analyses of MPs in native-like lipid-bilayer environments and its spectral line-width is not limited by the weight of MPs. As a consequence, ssNMR is regarded as a very prospective technique for elucidating the structures of MPs. However, ssNMR which is mainly based on dipolar couplings, is difficult to analyze the structures of flexible residues in MPs effectively, and thus restricts the understanding of its functions involving in signal conduction, molecular transport and ligand recognition. In this project, we will develop new ssNMR methods simultaneously based on J-couplings and dipolar couplings, in order to achieve the structural analysis of flexible residues and promote the studies of these function-related sites in MPs. The implement of this project will be able to enhance the ability of SSNMR to study MPs.
膜蛋白的结构分析是蛋白质研究的热点和难题。固体NMR可在接近天然环境的磷脂膜中研究膜蛋白,且分辨率不受膜蛋白分子量大小的限制,因此它被认为是研究膜蛋白结构的非常有前景的分析技术。但是,当前固体NMR方法主要是基于D-耦合作用,难以有效地对膜蛋白的柔性残基进行结构分析,进而阻碍了人们对柔性残基在膜蛋白中参与的信号传导、分子转运、配体识别等功能的研究。本项目拟设计同时基于J-耦合和D-耦合的固体NMR新方法,目的是实现膜蛋白中柔性残基的结构分析、促进人们对其在膜蛋白中相关功能的研究。本项目的顺利实施将提高固体NMR研究膜蛋白的能力。

结项摘要

固体NMR难以对膜蛋白的柔性残基进行有效地分析。主要原因是缺乏针对柔性残基特点的、稳定的偶极重耦方法。本项目利用模拟结合实验的方法,设计了两种全新的15N-13C异核偶极重耦方法。第一种方法是具有频率选择性的DBP,能够选择性地建立15N-13Cα相关或15N-13C'相关,建立蛋白质的信号归属;第二种方法是宽带DBP方法(Bro-DBP),比当前经典的TEDOR方法更灵活更高效,可用于膜蛋白的定量实验。新发展的两种DBP方法实现了快速重耦,有利于膜蛋白中核磁信号弛豫较快的柔性残基的研究;同时,DBP方法形式简单、性能稳定、设置简便,具有较好的实用性。

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Heating and temperature gradients of lipid bilayer samples induced by RF irradiation in MAS solid-state NMR experiments
MAS 固态 NMR 实验中射频辐射引起的脂质双层样品的加热和温度梯度
  • DOI:
    10.1002/mrc.4450
  • 发表时间:
    2016-09-01
  • 期刊:
    MAGNETIC RESONANCE IN CHEMISTRY
  • 影响因子:
    2
  • 作者:
    Wang,Jing;Zhang,Zhengfeng;Yang,Jun
  • 通讯作者:
    Yang,Jun
A robust heteronuclear dipolar recoupling method comparable to TEDOR for proteins in magic-angle spinning solid-state NMR
一种与 TEDOR 相当的稳健异核偶极重偶联方法,适用于魔角旋转固态 NMR 中的蛋白质
  • DOI:
    10.1016/j.jmr.2017.10.012
  • 发表时间:
    2017-12-01
  • 期刊:
    JOURNAL OF MAGNETIC RESONANCE
  • 影响因子:
    2.2
  • 作者:
    Zhang,Zhengfeng;Li,Jianping;Yang,Jun
  • 通讯作者:
    Yang,Jun

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其他文献

固体核磁共振研究淀粉样蛋白纤维的进展
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    波谱学杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    张正逢;杨俊
  • 通讯作者:
    杨俊

其他文献

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张正逢的其他基金

超高速魔角旋转下测量全质子化膜蛋白中1H-1H长程距离的固体NMR新方法
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2020
  • 资助金额:
    62 万元
  • 项目类别:
    面上项目
适用于膜蛋白的高效固体NMR新方法研究
  • 批准号:
    21775161
  • 批准年份:
    2017
  • 资助金额:
    64.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目

相似国自然基金

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知道了

AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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