生境胁迫效应在圆口铜鱼遗传层面表现的分子诊断与研究

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项目介绍
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基本信息

  • 批准号：
    51109145
  • 项目类别：
    青年科学基金项目
  • 资助金额：
    24.0万
  • 负责人：
    李伟涛
  • 依托单位：
    水利部中国科学院水工程生态研究所
  • 学科分类：
    E1009.生态环境风险控制
  • 结题年份：
    2014
  • 批准年份：
    2011
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2012-01-01 至2014-12-31

项目摘要

近年来，水利工程建设和运行导致的生态问题备受环保部门和环保人士的广泛关注。随着雅砻江下游5极水电开发的进行，在保证"西电东送"的同时，其导致的生境破碎、水环境改变等生境胁迫也逐渐对鱼类产生了重大的影响，而全面、系统的诊断其对物种遗传多样性的影响并没有开展。本项目选择受水利工程影响很大的急流生境鱼类- - 圆口铜鱼为研究对象，将高度变异的微卫星 DNA 和进化速率最快的线粒体 D-loop区序列等"中性"标记数据与适应环境压力变化的"非中性"MHC 基因标记结合起来，全面诊断水利工程建设与运行下圆口铜鱼群体遗传多样性水平，并使用 IBD 模型和 SPASS 相关性原理，结合分子标记诊断体系获得数据、二滩水库运行的水文资料和因水环境因子改变的数据，综合分析水利工程建设和运行对圆口铜鱼遗传多样性的影响及其响应机制，将对金沙江流域和西南诸河水利开发中此类型鱼类的物种保护具有普遍借鉴意义。

结项摘要

本项目从水利工程建设引起的大坝阻隔引起的生境破碎胁迫对圆口铜鱼在遗传层面影响特征研究入手，选取雅砻江下游二滩水电站上、下游江段为研究区域，所取得的研究结果有：（1）建立了以高度变异的微卫星DNA和相对保守的线粒体序列数据等中性标记与适应环境压力变化的非中性MHC基因标记相结合的分子标记体系；（2）利用分子标记体系评估了圆口铜鱼遗传结构及其遗传多样性（3）使用IBD模型等手段分析获得分子诊断数据，分析水利工程阻隔对圆口铜鱼的影响。.本研究到目前为止共发表学术论文5篇，其中SCI收录5篇。

项目成果

期刊论文数量（7）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
Development of twenty-nine polymorphic microsatellite loci from largemouth bronze gudgeon (Coreius guichenoti)
大口古铜鱼 (Coreius guichenoti) 29 个多态性微卫星位点的开发
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2014
  • 期刊：
    Journal of Genetics
  • 影响因子：
    1.5
  • 作者：
    Meihua Xiong;Shuxiang Yan;Shao Ke;Weitao Li;Fang Shi;Bin Zhu;Nian Xu
  • 通讯作者：
    Nian Xu
Ten polymorphic microsatellite loci developed from Triplophysa anterodorsalis
前背三毛虫开发的十个多态性微卫星位点
  • DOI：
    10.1007/s12041-013-0309-0
  • 发表时间：
    2016-12
  • 期刊：
    Journal of Genetics
  • 影响因子：
    1.5
  • 作者：
    Weitao Li;Zhixin Ren;Meihua Xiong;Bin Zhu;Yanfu Que
  • 通讯作者：
    Yanfu Que
The complete mitochondrial genome of Sinibrama taeniatus (Cyprinidae: Cultrinae)
Sinibrama taeniatus（鲤科：Cultrinae）完整线粒体基因组
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    Mitochondrial DNA,
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    Weitao Li;Ke Shao;Meihua Xiong;Shuxiang Yan;Xiaolin Liao;Yanfu Que
  • 通讯作者：
    Yanfu Que
Development and characterization of twelve novel polymorphicbr /microsatellite loci in the Percocypris pingi
十二种新型多态性的开发和表征
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2014
  • 期刊：
    Conservation Genet Resour
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    Lei Pan;Zhixin Ren;Yanfu Que;Meihua Xiong;Xiaolin Liao;Nian Xu;Dongmei Xu;Ke Shao;Bin Zhu
  • 通讯作者：
    Bin Zhu
Isolation and characterization of microsatellite loci in Jinshaia sinensis
金沙鱼微卫星位点的分离与表征
  • DOI：
    10.1007/s12686-012-9710-x
  • 发表时间：
    2012-07
  • 期刊：
    CONSERVATION GENETICS RESOURCES
  • 影响因子：
    1.1
  • 作者：
    Shao, Ke;Shi, Fang;Tang, Huiyuan;Xiong, Meihua;Li, Weitao;Zhu, Bin
  • 通讯作者：
    Zhu, Bin

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    李伟涛

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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