海冰细菌Colwellia sp.硫氧还蛋白(Trx)的基因克隆与功能分析

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31100037
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    20.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0103.微生物组学与代谢
  • 结题年份:
    2014
  • 批准年份:
    2011
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2012-01-01 至2014-12-31

项目摘要

硫氧还蛋白(Thioredoxin,Trx)是一类小分子多功能蛋白,一般都具有高度保守的活性位点(WC[G/P]PC),它通过还原靶蛋白中的二硫键参与酶活性调节、转录因子、各种胁迫应答和调控、信号传导等,在生物抗逆系统中起着重要的作用。前期研究结果表明,Trx可能在南极微生物适应极端环境中发挥重要作用。为此,本研究拟以南极海冰细菌Colwellia sp.为材料,在获得Trx全长基因序列的基础上,首先通过生物信息学方法分析Trx基因结构,推测Trx关键的活性位点,并预测其功能,进而采用定点突变、转基因、RT-PCR和Western 杂交等手段对其生物活性和功能进行系统研究,以期从全新的角度和更深的层次认识海冰细菌Trx的功能、活性位点与功能之间的关系,以及Trx在微生物低温适应性中的作用,进一步完善南极微生物低温适应性的分子机制,同时也为抗寒冷和抗冰冻生物遗传育种提供新的基因。

结项摘要

本研究从海冰细菌中克隆出硫氧还蛋白(Trx)全长基因(PsTrx),利用生物信息学方法对PsTrx基因进行了分析和预测。该基因大小为327 bp,编码108个氨基酸,推测其关键活性位点为Cys33和Cys36,含4个α-螺旋和5个β-折叠。利用定点突变技术进一步验证Trx蛋白关键活性位点。将PsTrx基因转入E.coli BL21中,实现了异源表达。重组蛋白经Ni-NTA亲和层析纯化,通过SDS-PAGE和Western blot对蛋白进行了检测和验证。在纯化基础上,对重组蛋白的生化活性进行了系统研究。利用FQ-PCR技术分析Trx基因表达特征,其中9%盐度下的Trx表达量是对照组的2.5倍;结合转基因菌株表征分析,探讨了Trx基因在海冰细菌耐盐机制中所起的作用。同时对与Trx相关的TrxR和GST基因进行了克隆、表达以及活性研究。本研究进一步完善海冰微生物极端环境适应机制,为抗逆生物遗传育种提供了新基因。在项目资助下正式发表论文8篇,其中SCI收录论文6篇,培养研究生5名。

项目成果

期刊论文数量(7)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(1)
专利数量(0)
Optimization of Cold-Active Lipase Production from Psychrophilic Bacterium Moritella sp 2-5-10-1 by Statistical Experimental Methods
统计实验方法优化嗜冷菌 Moritella sp 2-5-10-1 生产冷活性脂肪酶
  • DOI:
    10.1271/bbb.120104
  • 发表时间:
    2013-01-01
  • 期刊:
    BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY
  • 影响因子:
    1.6
  • 作者:
    Wang, Quanfu;Zhang, Chunyu;Guan, Xiangyu
  • 通讯作者:
    Guan, Xiangyu
Molecular cloning, expression and enzymatic characterization of glutathione S-transferase from Antarctic sea-ice bacteria Pseudoalteromonas sp ANT506
南极海冰细菌假交替单胞菌 ANT506 谷胱甘肽 S-转移酶的分子克隆、表达和酶学表征
  • DOI:
    10.1016/j.micres.2013.06.012
  • 发表时间:
    2014-01-01
  • 期刊:
    MICROBIOLOGICAL RESEARCH
  • 影响因子:
    6.7
  • 作者:
    Shi, Yonglei;Wang, Quanfu;Lu, Yi
  • 通讯作者:
    Lu, Yi
Molecular cloning, expression, purification and characterization of thioredoxin from Antarctic sea-ice bacteria Pseudoalteromonas sp. AN178
南极海冰细菌假交替单胞菌硫氧还蛋白的分子克隆、表达、纯化和表征。
  • DOI:
    10.1007/s11033-013-2771-4
  • 发表时间:
    2013-09
  • 期刊:
    Molecular Biology Reports
  • 影响因子:
    2.8
  • 作者:
    Wang Quanfu;Hou Yanhua;Qu Junjie;Hong Yanyan;Lin Yifei;Han Xiao
  • 通讯作者:
    Han Xiao
Purification and biochemical characterization of a cold-active lipase from Antarctic sea ice bacteria Pseudoalteromonas sp NJ 70
南极海冰细菌 Pseudoalteromonas sp NJ 70 冷活性脂肪酶的纯化和生化表征
  • DOI:
    10.1007/s11033-012-1796-4
  • 发表时间:
    2012-09-01
  • 期刊:
    MOLECULAR BIOLOGY REPORTS
  • 影响因子:
    2.8
  • 作者:
    Wang, Quanfu;Hou, Yanhua;Yan, Peisheng
  • 通讯作者:
    Yan, Peisheng
产低温脂肪酶深海菌株的筛选、鉴定及酶学性质研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    食品研究与开发
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    王全富;侯艳华;蔺一飞;李富超
  • 通讯作者:
    李富超

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其他文献

其他文献

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王全富的其他基金

谷氧还蛋白PsGrx在南极海冰细菌极端生境适应中的功能研究
  • 批准号:
    41876149
  • 批准年份:
    2018
  • 资助金额:
    62.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目

相似国自然基金

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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