海冰细菌Colwellia sp.硫氧还蛋白(Trx)的基因克隆与功能分析
项目介绍
AI项目解读
基本信息
- 批准号:31100037
- 项目类别:青年科学基金项目
- 资助金额:20.0万
- 负责人:
- 依托单位:
- 学科分类:C0103.微生物组学与代谢
- 结题年份:2014
- 批准年份:2011
- 项目状态:已结题
- 起止时间:2012-01-01 至2014-12-31
- 项目参与者:侯艳华; 马梅荣; 张宇; 张炳照; 刘通; 吴阳; 蔺一飞;
- 关键词:
项目摘要
硫氧还蛋白(Thioredoxin,Trx)是一类小分子多功能蛋白,一般都具有高度保守的活性位点(WC[G/P]PC),它通过还原靶蛋白中的二硫键参与酶活性调节、转录因子、各种胁迫应答和调控、信号传导等,在生物抗逆系统中起着重要的作用。前期研究结果表明,Trx可能在南极微生物适应极端环境中发挥重要作用。为此,本研究拟以南极海冰细菌Colwellia sp.为材料,在获得Trx全长基因序列的基础上,首先通过生物信息学方法分析Trx基因结构,推测Trx关键的活性位点,并预测其功能,进而采用定点突变、转基因、RT-PCR和Western 杂交等手段对其生物活性和功能进行系统研究,以期从全新的角度和更深的层次认识海冰细菌Trx的功能、活性位点与功能之间的关系,以及Trx在微生物低温适应性中的作用,进一步完善南极微生物低温适应性的分子机制,同时也为抗寒冷和抗冰冻生物遗传育种提供新的基因。
结项摘要
本研究从海冰细菌中克隆出硫氧还蛋白(Trx)全长基因(PsTrx),利用生物信息学方法对PsTrx基因进行了分析和预测。该基因大小为327 bp,编码108个氨基酸,推测其关键活性位点为Cys33和Cys36,含4个α-螺旋和5个β-折叠。利用定点突变技术进一步验证Trx蛋白关键活性位点。将PsTrx基因转入E.coli BL21中,实现了异源表达。重组蛋白经Ni-NTA亲和层析纯化,通过SDS-PAGE和Western blot对蛋白进行了检测和验证。在纯化基础上,对重组蛋白的生化活性进行了系统研究。利用FQ-PCR技术分析Trx基因表达特征,其中9%盐度下的Trx表达量是对照组的2.5倍;结合转基因菌株表征分析,探讨了Trx基因在海冰细菌耐盐机制中所起的作用。同时对与Trx相关的TrxR和GST基因进行了克隆、表达以及活性研究。本研究进一步完善海冰微生物极端环境适应机制,为抗逆生物遗传育种提供了新基因。在项目资助下正式发表论文8篇,其中SCI收录论文6篇,培养研究生5名。
项目成果
期刊论文数量(7)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(1)
专利数量(0)
Optimization of Cold-Active Lipase Production from Psychrophilic Bacterium Moritella sp 2-5-10-1 by Statistical Experimental Methods
统计实验方法优化嗜冷菌 Moritella sp 2-5-10-1 生产冷活性脂肪酶
- DOI:10.1271/bbb.120104
- 发表时间:2013-01-01
- 期刊:BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY
- 影响因子:1.6
- 作者:Wang, Quanfu;Zhang, Chunyu;Guan, Xiangyu
- 通讯作者:Guan, Xiangyu
Molecular cloning, expression and enzymatic characterization of glutathione S-transferase from Antarctic sea-ice bacteria Pseudoalteromonas sp ANT506
南极海冰细菌假交替单胞菌 ANT506 谷胱甘肽 S-转移酶的分子克隆、表达和酶学表征
- DOI:10.1016/j.micres.2013.06.012
- 发表时间:2014-01-01
- 期刊:MICROBIOLOGICAL RESEARCH
- 影响因子:6.7
- 作者:Shi, Yonglei;Wang, Quanfu;Lu, Yi
- 通讯作者:Lu, Yi
Molecular cloning, expression, purification and characterization of thioredoxin from Antarctic sea-ice bacteria Pseudoalteromonas sp. AN178
南极海冰细菌假交替单胞菌硫氧还蛋白的分子克隆、表达、纯化和表征。
- DOI:10.1007/s11033-013-2771-4
- 发表时间:2013-09
- 期刊:Molecular Biology Reports
- 影响因子:2.8
- 作者:Wang Quanfu;Hou Yanhua;Qu Junjie;Hong Yanyan;Lin Yifei;Han Xiao
- 通讯作者:Han Xiao
Purification and biochemical characterization of a cold-active lipase from Antarctic sea ice bacteria Pseudoalteromonas sp NJ 70
南极海冰细菌 Pseudoalteromonas sp NJ 70 冷活性脂肪酶的纯化和生化表征
- DOI:10.1007/s11033-012-1796-4
- 发表时间:2012-09-01
- 期刊:MOLECULAR BIOLOGY REPORTS
- 影响因子:2.8
- 作者:Wang, Quanfu;Hou, Yanhua;Yan, Peisheng
- 通讯作者:Yan, Peisheng
产低温脂肪酶深海菌株的筛选、鉴定及酶学性质研究
- DOI:--
- 发表时间:2012
- 期刊:食品研究与开发
- 影响因子:--
- 作者:王全富;侯艳华;蔺一飞;李富超
- 通讯作者:李富超
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其他文献
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