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外泌体的单颗粒多参数荧光原位成像分析方法设计及应用研究
结题报告
批准号:
U2004197
项目类别:
联合基金项目
资助金额:
51.0 万元
负责人:
张开翔
依托单位:
学科分类:
化学测量学
结题年份:
2023
批准年份:
2020
项目状态:
已结题
项目参与者:
张开翔
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中文摘要
尿液外泌体作为重要的疾病标志物,可以为泌尿系统肿瘤的诊断和预后提供关键的生物信息。然而,目前针对尿液外泌体的分析方法主要局限于整体平均法,检测的稳定性易受外泌体总浓度波动影响。为精准分析尿液外泌体携带的分子信息,本项目拟结合团队在微流控芯片、荧光原位成像和单外泌体分析等领域的工作基础,发展基于序列化探针识别和核酸链交换信号扩增(Sequential-SABER)的单外泌体多参数荧光原位成像策略,用于尿液外泌体的分析研究。相比整体平均法,单外泌体异质性分析可以挖掘群体信息中少量肿瘤外泌体的个体异质性特征,减少由于外泌体总浓度波动造成的分析检测数据不稳定。本项目计划通过分析超过100例临床膀胱癌患者尿液样品中单外泌体水平的十余种关键蛋白表达,利用t-SNE聚类分析揭示尿液外泌体之间的个体差异,探索尿液外泌体异质性特征与临床膀胱癌的相关性,为单外泌体分析用于临床检测的研究提供理论基础和实验依据。
英文摘要
As an important biomarker, urine exosomes could provide key biological information for the diagnosis and prognosis of urinary tumors. However, the current methods for urine exosomes analysis are mainly limited to bulk test. Because of the fluctuations of overall exosomes concentration in urine samples, the bulk test strategy usually lacks stability for clinical applications. In order to accurately analyze the biological information carried by urine exosomes, this project plans to combine the team's research expertise in the fields of microfluidic chips, fluorescence in situ imaging and single exosomes analysis to develop a sequential-SABER based strategy for analysis of urine exosome heterogeneity. Comparing with the overall analysis method, single exosomal heterogeneity analysis can investigate the characteristics of the small portion of tumor exosomes in the whole exosome population, which can improve the detection stability. In this project, we plan to analyze the expression of more than 10 key proteins on individual urine exosomes in clinical urine samples and applied for testing of more than 100 bladder cancer patients. Besides, the t-SNE analysis method would be used to reveal the differences between individual urine exosomes in those clinical samples. We think this project would provide a theoretical and experimental basis for the applications of single exosomes heterogeneity analysis in clinical use.
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专利列表
Visualizing Single-Nucleotide Variations in a Nuclear Genome Using Colocalization of Dual-Engineered CRISPR Probes
使用双工程 CRISPR 探针的共定位可视化核基因组中的单核苷酸变异
DOI:10.1021/acs.analchem.2c01208
发表时间:2022
期刊:Analytical Chemistry
影响因子:7.4
作者:Yan Liang;Sixuan Wu;Wenshuai Han;Jinjin Wang;Chenlu Xu;Jinjin Shi;Zhenzhong Zhang;Hua Gao;Kaixiang Zhang;Jinghong Li
通讯作者:Jinghong Li
DOI:10.1021/acssensors.2c01683
发表时间:2023-02
期刊:ACS sensors
影响因子:8.9
作者:Junli Zhang;Mengting Guan;Chihong Ma;Y. Liu;Min Lv;Zhenzhong Zhang;Hua Gao;Kaixiang Zhang
通讯作者:Junli Zhang;Mengting Guan;Chihong Ma;Y. Liu;Min Lv;Zhenzhong Zhang;Hua Gao;Kaixiang Zhang
DOI:10.1016/j.talanta.2023.125125
发表时间:2023-08
期刊:Talanta
影响因子:6.1
作者:Chihong Ma;Qin Zhou;Jinjin Shi;Hua Gao;Di Huang;Huimin Xue;Han Wang;Zhenzhong Zhang;Sen Yang;Junli Zhang;Kaixiang Zhang
通讯作者:Chihong Ma;Qin Zhou;Jinjin Shi;Hua Gao;Di Huang;Huimin Xue;Han Wang;Zhenzhong Zhang;Sen Yang;Junli Zhang;Kaixiang Zhang
DOI:10.1021/acsnano.3c05799
发表时间:2023-10
期刊:ACS nano
影响因子:17.1
作者:Junli Zhang;Mengting Guan;Min Lv;Yingying Liu;Hongling Zhang;Zhenzhong Zhang;Kaixiang Zhang
通讯作者:Junli Zhang;Mengting Guan;Min Lv;Yingying Liu;Hongling Zhang;Zhenzhong Zhang;Kaixiang Zhang
DOI:10.1038/s41467-023-40085-4
发表时间:2023-07-27
期刊:NATURE COMMUNICATIONS
影响因子:16.6
作者:Wang, Danyu;Liu, Jingwen;Duan, Jie;Yi, Hua;Liu, Junjie;Song, Haiwei;Zhang, Zhenzhong;Shi, Jinjin;Zhang, Kaixiang
通讯作者:Zhang, Kaixiang
基于RNA腺苷脱氨酶的核酸探针构建及体内基因突变原位成像研究
  • 批准号:
    22377110
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    50万元
  • 批准年份:
    2023
  • 负责人:
    张开翔
  • 依托单位:
近端结合CRISPR探针构建及细胞核基因点突变直接成像研究
  • 批准号:
    21904119
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    25.0万元
  • 批准年份:
    2019
  • 负责人:
    张开翔
  • 依托单位:
国内基金
海外基金