胃高分化与低分化腺癌分化差异的P53、PTEN等关键基因分子机理探索研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81272445
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    65.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H1813.肿瘤诊断
  • 结题年份:
    2016
  • 批准年份:
    2012
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2013-01-01 至2016-12-31

项目摘要

Gastric adenocarcinoma is a major and common type of gastric malignant cancer in the world. The pathological definition in well-differentiated and poorly-differentiated gastric adenocarcinoma is highly correlated to therapeutic response, diagnostics and recurrence. However, the systematic study of associated mechanism in between biological and clinical characterization is still ambiguous. Our prior observation showed that 7 (mainly factor is TP53) and 11 (mainly factors are TP53, PTEN and RB) gene panels were significantly involved in poorly- and well-differentiated gastric adenocarcinoma, respectively, through RNA in situ hybridization (RISH) and bioinformatic analysis. Gastric adenocarcinoma is also regulated by environmental factors (epigenetics), which was observed by Poeta ML and our laboratory. Therefore, we would like to initially apply DNA methylation microarray to systematically decipher the molecular mechanism either in epigenetic, risk assessment, or expression aspects. The following pathway analysis (expression chip), key genes/factors validation (qPCR, sequencing, phosphorylation, SNP and blotting) and small RNA detection, would be applied in this study to decode the functional mechanism of differentiated gastric phenotype, which is allied to efficacy, prognosis and recurrence.
胃腺癌是常见恶性肿瘤胃癌的主要类型。高分化和低分化胃腺癌临床特点及预后差异很大,两者具有不同的生物学特征,但目前这种分化差异的机制研究很少。我们前期研究通过生物信息学方法分析高低分化两组胃腺癌中15个重要的肿瘤相关基因的表达,发现低分化胃腺癌组,有7个基因显著异常,关键因素为TP53。高分化胃腺癌组显著异常的基因却为11个,关键因素为TP53、PTEN、RB的基因子集。结合Poeta ML等的研究,推论基因型及甲基化变化可能与胃腺癌分化差异机制相关。本研究结合前期研究基础,拟采用高通量甲基化芯片技术筛选胃高/低分化腺癌甲基化水平差异显著的基因,再进行甲基化和表达量的验证;对差异显著的基因进行测序,得到与胃高/低分化腺癌相关的风险基因型;综合甲基化芯片、表达和基因型的结果,对包括P53、PTEN在内的关键基因参与的信号通路进行分析及分子生物学研究,探索胃腺癌诊断- - 分化程度差异的分子机理

结项摘要

胃癌是全球性的恶性疾病的一种,尤其是在发展中国家的我国,发病率相对比较高。在胃腺癌中,低分化胃腺癌具有发病率高,发病年龄小,恶性程度较高,死亡率高的特点。在目前,针对于胃癌的表观遗传学中DNA甲基化的研究较少,且大部分为单个或几个基因甲基化水平的研究,尚未建立相关的人低分化胃癌的甲基化谱,且基于表观遗传学的机理研究较少。因此,为探索低分化胃腺癌相关的表观遗传学机制,课题收集临床胃腺癌与胃正常组织样本,两种类型的组织取自同一患者,运用高通量甲基化芯片技术筛选低分化胃腺癌与胃正常组织样本两者差异的甲基化位点,并分析与甲基化调控明显相关的基因。随后与已经报道的低分化胃腺癌相关的表达谱芯片进行比较,找出相关的基因BMP3和P2RY1。鉴于BMP3与1,25-二羟维生素D3在成骨和骨分化中的作用和之前的研究基础,研究1,25-二羟维生素D3对参与BMP3基因的影响,继而在分子水平探索其与胃癌相关的分子机制和生物学功能。其中P2RY1是细胞膜蛋白受体,ADP及其类似物可以激活该受体。近期的研究发现P2RY1与肿瘤的发生发展密切相关。位于细胞膜上的P2RY1受体在接受细胞外信号刺激后,激活下游相关信号通路,发挥相应生物学功能,继而对癌细胞的增殖、分化、凋亡等产生一系列影响。运用分子生物学方法对P2RY1在低分化胃腺癌细胞的发生发展过程中的作用与相关分子机制及其生物学功能的调控进行探索研究。

项目成果

期刊论文数量(13)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Sustainable inflammation transforms hepatic cells by causing oxidative stress injury and potential epithelial-mesenchymal transition.
持续的炎症通过引起氧化应激损伤和潜在的上皮间质转化来改变肝细胞。
  • DOI:
    10.3892/ijo.2016.3580
  • 发表时间:
    2016-09
  • 期刊:
    INTERNATIONAL JOURNAL OF ONCOLOGY
  • 影响因子:
    5.2
  • 作者:
    Lu Kun;Liu Guoyan;Yang Ling;Liu Fan;Gao Libin;Shi Jingxian;Deng Xiaoling;Li Qifu;Xu Donghui;Shi Songlin
  • 通讯作者:
    Shi Songlin
Analysis of genetic polymorphisms associated with leukoaraiosis in the southern Chinese population: A case-control study.
中国南方人群脑白质疏松症相关基因多态性分析:病例对照研究
  • DOI:
    10.1097/md.0000000000003857
  • 发表时间:
    2016-08
  • 期刊:
    Medicine
  • 影响因子:
    1.6
  • 作者:
    Huang WQ;Ye HM;Li FF;Yi KH;Zhang Y;Cai LL;Lin HN;Lin Q;Tzeng CM
  • 通讯作者:
    Tzeng CM
应用微阵列比较基因组杂交技术分析罕见甲状腺弥漫硬化变异型乳头状癌与典型乳头状癌的染色体变异
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    中华实验外科杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    顾龙;陈小曼;曾骥孟;孙诚谊
  • 通讯作者:
    孙诚谊
A Novel CCM2 Gene Mutation Associated with Familial Cerebral Cavernous Malformation.
与家族性脑海绵状血管瘤相关的新型 CCM2 基因突变
  • DOI:
    10.3389/fnagi.2016.00220
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Frontiers in aging neuroscience
  • 影响因子:
    4.8
  • 作者:
    Huang WQ;Lu CX;Zhang Y;Yi KH;Cai LL;Li ML;Wang H;Lin Q;Tzeng CM
  • 通讯作者:
    Tzeng CM
Structure, Function, and Pathogenesis of SHP2 in Developmental Disorders and Tumorigenesis
SHP2在发育障碍和肿瘤发生中的结构、功能和发病机制
  • DOI:
    10.2174/1568009614666140717105001
  • 发表时间:
    2014-01-01
  • 期刊:
    CURRENT CANCER DRUG TARGETS
  • 影响因子:
    3
  • 作者:
    Huang, Wen-Qing;Lin, Qing;Tzeng, Chi-Meng
  • 通讯作者:
    Tzeng, Chi-Meng

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其他文献

生物样本信息资源库的国内外研究进展
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    中国医药生物技术
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    李怡;张换敬;刘国彦;叶辉铭;林青;曾骥孟
  • 通讯作者:
    曾骥孟
环状RNA CircPGC在胃癌组织中低表达及其促进胃癌细胞迁移
  • DOI:
    10.3760/cma.j.issn.1001-9030.2019.07.016
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    中华实验外科杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    张宇海;洪裕玲;庄洵荣;李龙;刘磊;石松林;刘国彦
  • 通讯作者:
    刘国彦

其他文献

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NPM通过PRDX6-ROS作用轴促进结肠炎发展的作用与机制研究
  • 批准号:
    81870388
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    2018
  • 资助金额:
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  • 项目类别:
    面上项目

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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