汉族人群阿尔茨海默病重要候选基因的关联研究
批准号:
81171209
项目类别:
面上项目
资助金额:
60.0 万元
负责人:
谭兰
依托单位:
学科分类:
神经退行性变及相关疾病
结题年份:
2015
批准年份:
2011
项目状态:
已结题
项目参与者:
郁金泰、宋敬卉、郑雪平、张伟、孙丽、钟晓玲、邢姚姚、王会福
中文摘要
近期,4项国际全基因组关联研究(GWAS)在高加索人群中新发现6个重要基因CLU,CR1,PICALM,BIN1,EXOC3L2及MTHFD1L与AD关联。然而,汉族人群AD的遗传背景仍不清楚,并且GWAS本身亦存在不足。本项目拟在前期建立的汉族人AD遗传资源库的基础上,采用候选基因研究策略,首先小规模的对CR1,PICALM,BIN1,EXOC3L2及MTHFD1L基团进行突变分析,全面构建汉族人各基因区域的单倍型图谱,并进行初步关联分析;然后通过大规模群体关联研究,探测各候选基因多态性与AD的关联关系,结合病人的临床特征进行基因型-临床表型分析,结合APOE和CLU基因分型,进行易感基因之间的交互效应分析,全面构建AD的基因-临床风险预测模型。本研究的完成在理论上可确定与汉族人AD显著关联的易感基因和位点,并为AD发病机制的阐明,早期预测、诊断以及寻找药物设计靶点提供新思路和理论依据。
英文摘要
本项目历时4年,在前期建立的汉族人阿尔茨海默病遗传资源库基础上,应用基因测序、PCR-LDR、QRT-PCR等试验技术,建立DNA 直接测序技术检测AD关键候选基因突变的技术平台。首次对CR1,PICALM,BIN1,EXOC3L2 及MTHFD1L 基因所有重要功能区进行突变筛查,共得到CR1 19个功能性SNPs,PICALM 16个功能性SNPs,BIN1 44个功能性SNPs,EXOC3L2 25个功能性的SNPs,MTHFD1L基因220个功能性的SNPs。研究首次明确了CR1,PICALM,BIN1,EXOC3L2 及MTHFD1L 基因在汉族人群中的突变特点,并全面构建了汉族人单倍型图谱。进一步的大样本研究明确了以上基因与汉族人AD易感关联,发现位于BIN1外显子的错义突变(P318L)与LOAD的发病相关。BIN1基因rs67327804和rs1060743位点的单体型提高了1.4倍的LOAD的发病风险。同时,AD组外周血中BIN1基因mRNA和蛋白水平明显增高,且与AD患者MMSE评分存在相关性。在CR1基因中,位于外显子的两个错义突变(rs11680648: Thr/Ala,和rs6691117: Ile/Val)显著地提高了LOAD的发病风险,且ATG单体型显著地提高了LOAD的发病风险。PICALM的16个变异位点并没有发现其与AD的发病风险相关。虽然EXOC3L2和MTHFD1L的变异位点对AD的发病风险的作用方向一致,但大样本验证均未发现其提高AD的发病风险。另外,结合ApoE,CLU 基因分型进行基因型-临床表型分析发现BIN1基因rs1137845在中提高了APOEε4携带者LOAD发病风险。CR1基因rs11680648在APOEε4非携带者中与LOAD的发病相关,从而全面构建AD 的基因-临床风险预测模型。本项目发表学术论文18篇,其中17篇均被SCI收录,影响因子大于5分的8篇,1篇被CSCD收录。本项目还受邀在美国神经病学年会、亚洲大洋洲神经病学会议等国内外会议上发言并获得3项国际学术奖励。培养博士2名,硕士5名。部分研究成果荣获山东省科技进步二等奖2项,山东省医学科技二等奖1项,山东省研究生科技创新成果一等奖1项。本项目已在山东半岛地区多家大型三甲医院中推广应用,提高了应用单位AD的早期预警诊疗水平,取得了显著的社会效益。
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Missense variants in CR1 are associated with increased risk of Alzheimer#39;s disease in Han Chinese
CR1 错义变异与阿尔茨海默病风险增加相关
DOI:
--
发表时间:
2014
期刊:
Neurobiology of Aging
影响因子:
4.2
作者:
[Meng-Shan Tan, Fu-Rong Sun, Dan Miao, Lan Tan]
通讯作者:
Lan Tan
DOI:
--
发表时间:
2012
期刊:
Journal of Molecular Neuroscience
影响因子:
作者:
[Cui, Wei-Zhen, Wu, Zhong-Chen, Zhang, Qun, Tan, Lan, ]
通讯作者:
DOI:
--
发表时间:
2014
期刊:
Molecular Neurobiology
影响因子:
作者:
[Teng Jiang, Ping Wang, Lei Cao, Lan Tan, ]
通讯作者:
Association of TOMM40 polymorphisms with late-onset Alzheimer#39;s disease in a Northern Han Chinese population.
TOMM40 多态性与迟发性阿尔茨海默病的关联
DOI:
--
发表时间:
2013
期刊:
NeuroMolecular Medicine
影响因子:
3.5
作者:
[Hui-Fu Wang, Qiu-Yan Liu, Wei Zhang, Lan Tan]
通讯作者:
Lan Tan
DOI:
--
发表时间:
2012
期刊:
Brain Research
影响因子:
作者:
[Liu, Qiu-Yan, Ma, Xiao-Ying, Ding, Hua-Min, Tan, Lan, ]
通讯作者:
共 35 条
MS4A6A调控TREM2参与阿尔茨海默病发生的作用和机制研究
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批准号:--
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项目类别:面上项目
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资助金额:52万元
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批准年份:2022
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负责人:谭兰
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依托单位:
IL33/ST2调控小胶质细胞功能参与阿尔茨海默病tau病理的机制研究
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批准号:81971032
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项目类别:面上项目
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资助金额:55.0万元
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批准年份:2019
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负责人:谭兰
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依托单位:
TREM1和汉族人群阿尔茨海默病的关联分析及其致病机制研究
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批准号:81771148
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项目类别:面上项目
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资助金额:54.0万元
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批准年份:2017
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负责人:谭兰
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依托单位:
BIN1的表观遗传调控及其介导tau病理参与阿尔茨海默病的机制研究
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批准号:81571245
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项目类别:面上项目
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资助金额:57.0万元
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批准年份:2015
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负责人:谭兰
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依托单位:
血清miRNA表达谱和miRNA基因及其靶位点多态性与阿尔茨海默病的关系研究
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批准号:81371406
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项目类别:面上项目
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资助金额:70.0万元
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批准年份:2013
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负责人:谭兰
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依托单位:
国内基金
海外基金