酿酒酵母Hsp90-Cpr7-Cns1折叠复合物组装及功能调控机制的结构生物学基础

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31770788
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    60.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0501.结构生物学
  • 结题年份:
    2021
  • 批准年份:
    2017
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2018-01-01 至2021-12-31

项目摘要

The proper folding is the physical basic for protein function. Hsp90 (heat shock protein of 90 kDa) is a ubiquitous molecular chaperone in eukaryotes, required for the maturation and stability of hundreds of diverse client proteins. The versatility of Hsp90 can be attributed to the variety of co-chaperone proteins that modulate the role of Hsp90 in many cellular processes. However, it remains largely unknown how co-chaperones interact with Hsp90 or how they interact with clients. Hsp90-Cpr7-Cns1 is one of ternary folding complex constituted by Hsp90 and its co-chaperones from saccharomyces cerevisiae. In this project, we plan to solve the 3D structure of the folding complex Hsp90-Cpr7-Cns1 and illuminate the mechanism of how the ternary complex assembly and how it facilitates the folding of the clients. We also plan to reveal the structural basis of the functional difference between the homologous co-chaperones Cpr6 and Cpr7.
蛋白质的正确折叠是其正确行使生理功能的基本物质保障,热休克蛋白90(Hsp90)负责了细胞中大量未成熟蛋白及不稳定蛋白质的折叠工作。多年来,对Hsp90折叠系统的研究虽已积累了很多发现,但其协助顾客蛋白完成折叠的分子机理至今仍不清楚。Hsp90通过与多种不同辅分子伴侣形成折叠复合物,实现针对不同顾客蛋白的折叠功能,酿酒酵母Hsp90-Cpr7-Cns1折叠复合物就是其中之一。在本项目中,申请人拟综合运用结构生物学、生物化学和细胞生物学技术手段,阐明Hsp90-Cpr7-Cns1折叠复合物的组装机制及其协助顾客蛋白完成折叠的分子机制;我们还希望通过结构-功能关系比较揭示高度同源的Cpr6和Cpr7两种辅分子伴侣之间功能差异的结构生物学基础。同时,鉴于人源Hsp90折叠复合物的相关研究工作相对滞后,上述工作的开展将为深入理解人类Hsp90重折叠组装系统的分子机制提供重要参考。

结项摘要

我们综合运用结构生物学、生物化学及细胞生物学技术手段,尝试阐明Hsp90-Cpr7-Cns1折叠复合物的组装机制及该复合物形成对Hsp90二聚体结构和功能的影响,揭示该复合物协助顾客蛋白完成折叠组装的分子机制。但是,通过体外实验验证,我们发现Cns1、Cpr7和Hsp90虽然存在于同一个大复合物中,但两两之间的相互作用较弱,无法形成稳固的复合物并获得晶体。因此推测存在其它蛋白介导了Cns1、Cpr7和Hsp90之间的相互作用。Hsp90 蛋白和Cpr7 及Cns1 的体外Pull-down实验未能得到完整复合物,关键辅助因子的缺失造成了Hsp90-Cpr7-Cns1折叠复合物无法顺利组装。针对上述难点,我们搭建了基于噬菌体表面展示技术的抗体筛选平台,抗体容量达到1010,通过该平台尝试筛选能特异性结合Hsp90-Cpr7-Cns1折叠复合物及Cpr6 蛋白的高特异性Fab抗体及Nanobody抗体,但最终仍然没能通过抗体结合获得三元复合物,也未能稳定Cpr6蛋白质构象,提高Cpr6 蛋白晶体衍射分辨率。在原有计划任务陷入困境的同时,我们及时拓展了对其他分子伴侣复合物的结构与功能关系研究,先后完成了新月柄杆菌β滑动钳蛋白与分子伴侣结合机制、金黄色葡萄球菌HptRSA传感器复合物的胞内-胞外信号转导结构机制等研究任务。发表标注项目资助的SCI论文6篇,培养了4名优秀的结构生物学后备人才,较好的完成了课题计划任务目标。

项目成果

期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Functional and structural characterization of a novel catechol-O -methyltransferase from Schizosaccharomyces pombe
裂殖酵母新型儿茶酚-O-甲基转移酶的功能和结构表征
  • DOI:
    10.1002/iub.1977
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    IUBMB Life
  • 影响因子:
    4.6
  • 作者:
    Qing Wang;Maikun Teng;Xu Li
  • 通讯作者:
    Xu Li
Caulobacter crescentus β sliding clamp employs a noncanonical regulatory model of DNA replication
Caulobactercrescentus β 滑动夹采用非规范的 DNA 复制调节模型。
  • DOI:
    10.1111/febs.15138
  • 发表时间:
    2019-11-29
  • 期刊:
    FEBS JOURNAL
  • 影响因子:
    5.4
  • 作者:
    Jiang, Xuguang;Zhang, Linjuan;Li, Xu
  • 通讯作者:
    Li, Xu
Interface switch mediates signal transmission in a two-component system.
接口开关介导二元系统中的信号传输。
  • DOI:
    10.1073/pnas.1912080117
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
  • 影响因子:
    11.1
  • 作者:
    Wang Mingxing;Guo Qiong;Zhu Kongfu;Fang Bo;Yang Yifan;Teng Maikun;Li Xu;Tao Yuyong
  • 通讯作者:
    Tao Yuyong
Antibiotic binding releases autoinhibition of the TipA multidrug-resistance transcriptional regulator.
抗生素结合释放 TipA 多重耐药转录调节因子的自身抑制。
  • DOI:
    10.1074/jbc.ra120.016295
  • 发表时间:
    2020-12-18
  • 期刊:
    The Journal of biological chemistry
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Jiang X;Zhang L;Teng M;Li X
  • 通讯作者:
    Li X
A newly identified photolyase from Arthrospira platensis possesses a unique methenyltetrahydrofolate (MTHF) chromophore‐binding pattern
一种新鉴定的来自节旋藻的光裂合酶具有独特的次甲基四氢叶酸发色团结合模式。
  • DOI:
    10.1002/1873-3468.13657
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    FEBS Letters
  • 影响因子:
    3.5
  • 作者:
    Hui Yan;Kongfu Zhu;Maikun Teng;Xu Li
  • 通讯作者:
    Xu Li

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  • 通讯作者:
    刘洪林
Structure-based de novo prediction of zinc-binding sites in proteins of unknown function
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  • DOI:
    10.1093/bioinformatics/btr133
  • 发表时间:
    2011-05
  • 期刊:
    Evolutionary Bioinformatics
  • 影响因子:
    2.6
  • 作者:
    赵伟;徐蒙;梁治;丁博;牛立文;刘海燕;滕脉坤
  • 通讯作者:
    滕脉坤

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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