组蛋白去甲基化酶KDM4D的晶体结构测定和功能研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    30870494
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    34.0万
  • 负责人：
    陈忠周
  • 依托单位：
    中国农业大学
  • 学科分类：
    C0501.结构生物学
  • 结题年份：
    2011
  • 批准年份：
    2008
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2009-01-01 至2011-12-31

项目摘要

组蛋白去甲基化酶参与到基因转录调控、异染色质形成、基因印记和X 染色体失活等，如KDM4家族（原名为jmjd2）的异常表达引发多种肿瘤的发生。自2004年首次发现组蛋白去甲基化酶以来，这领域已成为世界上最热的课题之一，但目前所解出的结构还是非常少的。.本项目将从蛋白质晶体学角度研究KDM4D结构及其功能的关系。与类似的结构相结合，深入分析KDM4家族选择性识别底物的关键因素并通过突变来提高KDM4D的催化活性。探讨KDM4家族中同源性很高的催化核心结构域KDM4D为什么只对三甲基H3K9有活力，而对三甲基H3K36没有活力? 在上述基础上，通过复合物结构的研究寻找合适的抑制剂和药物前体，进而为癌症的治疗奠定坚实的基础。.本项目是从分子水平上探讨KDM4家族蛋白选择性识别甲基化组蛋白的结构基础，对研究染色质的调控和蛋白质的表达、药物的设计和癌症的治疗具有重要的意义。

结项摘要

项目成果

期刊论文数量（4）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
Structural insights into a novel histone demethylase PHF8
新型组蛋白去甲基化酶 PHF8 的结构见解
  • DOI：
    10.1038/cr.2010.8
  • 发表时间：
    2010-01
  • 期刊：
    Cell Research
  • 影响因子：
    44.1
  • 作者：
    Yu, Lin;Gong, Weimin;Chen, Zhongzhou;Wang, Yang;Huang, Shuo;Wang, Jianjun;Deng, Zengqin;Zhang, Qi;Wu, Wei;Zhang, Xingliang;Liu, Zhao
  • 通讯作者：
    Liu, Zhao
人PHF8蛋白的原核表达、纯化与结晶
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    基础医学与临床
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    余琳;刘音;黄硕;陈忠周;汪洋
  • 通讯作者：
    汪洋
UHRF1结合甲基化组蛋白的结构研究
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    生物物理学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    邓增钦;刘钊;张琦;陈忠周
  • 通讯作者：
    陈忠周
Crystallization and Preliminary Crystallographic Analysis of Histone Demethylase PHF
组蛋白去甲基化酶 PHF 的结晶及初步晶体学分析
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    生物物理学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    Lin Yu;Yang Wang;Zhongzhou Chen
  • 通讯作者：
    Zhongzhou Chen

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其他文献

Structure-function analysis reveals a novel mechanism for regulation of histone demethylase LSD2/AOF1/KDM1b
结构功能分析揭示了组蛋白去甲基化酶LSD2/AOF1/KDM1b调节的新机制
  • DOI：
    10.1038/cr.2012.177
  • 发表时间：
    2012-12
  • 期刊：
    Cell Research
  • 影响因子：
    44.1
  • 作者：
    陈忠周
  • 通讯作者：
    陈忠周

其他文献

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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