染色体19q13.3围绕DNA修复基因亚区域的肺癌基因组关联研究

批准号:
81072384
项目类别:
面上项目
资助金额:
30.0 万元
负责人:
尹娇杨
依托单位:
学科分类:
H3010.非传染病流行病学
结题年份:
2013
批准年份:
2010
项目状态:
已结题
项目参与者:
王慧文、马业罡、祁荣、王春红、宋铁华
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中文摘要
采用HapMap tag SNPs间接策略及目前国际多采用的两阶段研究设计:进行中国东北地区汉族群体肺癌病例-对照区域性基因组关联分析:聚焦在染色体19q13.3亚区域ERCC1到ERCC2 70kb范围的4个基因:ERCC1、ASE-1、RAI及ERCC2, 全面考虑其完整基因的常见变异及特异组合的常见单体型(域)/双体型,及其与吸烟等环境因素相互作用与肺癌的关联,重点在于构建染色体19q13.3亚区域肺癌易感性连锁不平衡精细图谱(未见报道)及关联验证,进一步精细定位:与肺癌发生强烈相关联的主要易感性基因的DNA序列范围及效应器,并将中国汉族群体与丹麦高加索群体相对比:是否具有同样的与肺癌(癌症)发生紧密相关的古老单体型(域)或"年轻"的、具有群体特异性的单体型(域)。为进一步的功能研究、临床化疗药物抵抗的相关性研究及中国人肺癌的发生、预防、诊断、治疗策略提供理论基础和科学依据。
英文摘要
为精细定位中国人(亚洲人/黄种人)染色体19q13.3相关四个基因(ERCC2, PPP1R13L, CD3EAP and ERCC1)亚区域潜在的肺癌病因及关联序列,项目(批准号:81072384)执行了中国群体肺癌病例-对照chr19q13.3涉及此四个相关基因亚区域的基因组关联分析。采用 HapMap tag SNPs 间接策略, 逐一分析各个基因及总体基因联合分析,初步定位可能的风险序列范围,进一步采用精细制图策略,执行了此染色体亚区域横跨71.654kb范围的精细图谱研究,对于单一位点五种遗传模型分析提示:7个紧密相邻的SNPs(PPP1R13L rs1970764, rs1005165, CD3EAP rs967591, rs735482, rs1007616, rs62109563, and ERCC1 rs3212965)显示了与肺癌发生风险有意义的相关联;基因-基因-环境相互作用MDR模型分析提示:吸烟持续性和ERCC2、PPP1R13及ERCC1 htSNPs遗传变异高序相互作用的效应是肺癌发生风险的强烈预报器;首次对中国群体(亚洲人/黄种人)此亚区特异性高风险双体型复制研究提示:高加索群体验证报道的癌症相关高风险双体型的部分组成成份:PPP1R13L rs1970764 和CD3EAP rs967591的变异等位基因可能是中国群体(亚洲人/黄种人)中肺癌发生的风险因素,但因其高风险双体型在中国群体(亚洲人/黄种人)的罕见,不可能是该人种的肺癌风险因素;中国群体(亚洲人/黄种人)chr19q13.3相关四个基因亚区域的精细图谱研究提示:增强肺癌易感性效应器的中心区域定位于:围绕从PPP1R13L intron8 rs1970764到CD3EAP 3' near gene rs62109563的23.173kb范围。项目首次在国际上系统研究及定位绘制完成了中国人(亚洲人/黄种人)染色体19q13.3相关四个基因亚区域的肺癌(癌症)易感性连锁不平衡/精细图谱。目前,本项目研究成果已发表Carcinogenesis,Mutat Res,Environ Mol Mutagen,Lung Cancer等国际SCI期刊论文7篇(累积SCI影响因子约:22.611)。
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HapMap-based study of a region encompassing ERCC1 and ERCC2 related to lung cancer susceptibility in a Chinese population
基于 HapMap 的 ERCC1 和 ERCC2 区域与中国人群肺癌易感性相关的研究
DOI:10.1016/j.mrfmmm.2011.05.003
发表时间:2011-08-01
期刊:MUTATION RESEARCH-FUNDAMENTAL AND MOLECULAR MECHANISMS OF MUTAGENESIS
影响因子:2.3
作者:Yin, Jiaoyang;Vogel, Ulla;Song, Tiehua
通讯作者:Song, Tiehua
DOI:10.1016/j.gene.2012.04.072
发表时间:2012-07
期刊:Gene
影响因子:3.5
作者:Jiaoyang Yin;Chunhong Wang;D. Liang;U. Vogel;L. Yue;Jian Liu;R. Qi;Xiaoling Sun
通讯作者:Jiaoyang Yin;Chunhong Wang;D. Liang;U. Vogel;L. Yue;Jian Liu;R. Qi;Xiaoling Sun
DOI:10.1093/carcin/bgp107
发表时间:2009-07
期刊:Carcinogenesis
影响因子:4.7
作者:Jiaoyang Yin;U. Vogel;Yegang Ma;R. Qi;Huiwen Wang
通讯作者:Jiaoyang Yin;U. Vogel;Yegang Ma;R. Qi;Huiwen Wang
HapMap-based study identifies risk sub-region on chromosome 19q13.3 in relation to lung cancer among Chinese
基于 HapMap 的研究确定了染色体 19q13.3 上与中国人肺癌相关的风险亚区域
DOI:10.1016/j.canep.2013.09.016
发表时间:2013-12-01
期刊:CANCER EPIDEMIOLOGY
影响因子:2.6
作者:Yin, Jiaoyang;Vogel, Ulla;Ma, Jian
通讯作者:Ma, Jian
A specific diplotype defined by PPP1R13L rs1970764, CD3EAP rs967591 and ERCC1 rs11615 and lung cancer risk in a Chinese population
PPP1R13L rs1970764、CD3EAP rs967591 和 ERCC1 rs11615 定义的特定双倍型与中国人群的肺癌风险
DOI:10.1016/j.lungcan.2012.01.001
发表时间:2012-06-01
期刊:LUNG CANCER
影响因子:5.3
作者:Yin, Jiaoyang;Vogel, Ulla;Li, Xinxin
通讯作者:Li, Xinxin
中国人染色体19q13.2-3区域DNA修复等基因单核苷酸多态及其单体型与肺癌发生风险研究
- 批准号:30571016
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:8.0万元
- 批准年份:2005
- 负责人:尹娇杨
- 依托单位:
国内基金
海外基金
