选取核基因ITS和ETS进行了分子系统学研究，囊括蒲儿根属（Sinosenecio群和蒲儿根群）41种中的37种（90%）。在此基础上，为解决Sinosenecio群与LCP复合体其他属之间系统发育关系，选取7个叶绿体片段（matK-5'trnKUUU-3'rpS16、5'rpS16-trnQUUG-psbK、psbK-psbI-trnSGCU-trnCGCA-petN、ycf3-trnSGGA-rpS4、trnTUGU-trnLUAA-trnLUAA-trnFGAA-ndhJ、ndhC-trnVUAC、trnLUAG-rpL32-ndhF）对该复合体的植物中的126种（138居群）进行了系统发育分析。主要研究结果如下：.（1）Sinosenecio群是广义款冬亚族的成员。该群并非单系，在13个成员中，由分布于四川盆地西侧7种（即雨农蒲儿根、肾叶蒲儿根、橐吾状蒲儿根、圆叶蒲儿根、四川蒲儿根、莲座蒲儿根和艺林蒲儿根）组成的单系得到了ITS、ETS和叶绿体片段分析的强烈支持；分布于四川盆地东侧5种（即仙客来蒲儿根、川鄂蒲儿根、毛柄蒲儿根、单头蒲儿根和紫毛蒲儿根）彼此近缘，其单系性质得到了ETS和叶绿体片段资料的支持，叶绿体片段的分析显示，这一支为LCP复合体的基部类群；分布于大娄山脉的革叶蒲儿根，其系统位置在不同分析中有一定变化，系统位置未能确定。根据上述结果，蒲儿根属的范围应进一步缩小至仅含分布于四川盆地西侧的7种。（2）蒲儿根群为广义款冬亚族中狗舌草亚族的成员，与羽裂菊属和狗舌草属最为近缘。该群并非单系，其成员可分为两群，其中18种（Sinosenecio 48-1）与羽裂菊属的成员关系密切，聚成一单系群；其余6种（即广西蒲儿根、江西蒲儿根、九华山蒲儿根、白背蒲儿根、岩生蒲儿根和武夷山蒲儿根）聚成另一支（Sinosenecio 48-2）。在狗舌草亚族内，上述两支的单系性质都受到了强烈支持，但它们之间的系统发育关系并不确定。在ITS分析中，两者以很低的支持率聚成一支，而ETS分析显示，两者与狗舌草属一支一起形成三岐分支。根据上述结果，Sinosenecio 48-1的18种（很可能也包括未纳入本研究的4种，即光果蒲儿根、假光果蒲儿根、承经蒲儿根和三脉蒲儿根）应并入羽裂菊属，而其余6种的处理（划入羽裂菊属或独立成属）有待获得更多数据之后进行分析。