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凝聚相固氮酶催化分子氮还原过程的组合QM/MM计算研究

批准号：
20673087
项目类别：
面上项目
资助金额：
32.0 万元
负责人：
曹泽星
依托单位：
厦门大学
学科分类：
化学理论与方法
结题年份：
2009
批准年份：
2006
项目状态：
已结题
项目参与者：
许雪飞、夏飞、谢湖均、金夕、巫瑞波、陈星、黄斌
关键词：
固氮酶分子氮还原QM/MM方法

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项目成果

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中文摘要
固氮酶是一类极为重要的金属酶，自然界为数不多含固氮酶的几类菌每年承担了自然界约1亿吨氮的生物还原。本项目试图通过组合QM/MM计算，对凝聚相固氮酶催化分子氮还原过程进行模拟研究。主要内容包括：固氮酶凝聚相QM/MM计算模型的建立与优化；蛋白质环境对不同氧化-还原-自旋态辅酶中心和中间体结构与稳定性的影响；可能质子-电子转移机理；分子氮还原成氨过程的QM/MM能量学；放氢与氮还原的关系等。项目的开展有助于认识固氮酶生物固氮的活性本质，为化学模拟生物固氮研究提供理论依据。
英文摘要
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Theoretical Studies on Structures and Electronic Spectra of Linear Carbon Chains C2nH+ (n=1-5)
直链碳链C2nH(n=1-5)结构及电子能谱的理论研究
DOI： --
发表时间： --
期刊： International Journal of Quantum Chemistry
影响因子： 2.2
作者： [Zhang, Jinglai, Li, Junfeng, Li, Yonghong, Cao, Zexing, Chen, Xing]
通讯作者： Chen, Xing
QM/MM study of catalytic methyl transfer by the N5‐glutamine SAM‐dependent methyltransferase and its inhibition by the nitrogen analogue of coenzyme
DOI： 10.1002/jcc.20793
发表时间： 2008-02
期刊： Journal of Computational Chemistry
影响因子： 3
作者： [Ruibo Wu;Z. Cao]
通讯作者： Ruibo Wu;Z. Cao
Combined quantum mechanics/molecular mechanics study on the reversible isomerization of glucose and fructose catalyzed by Pyrococcus furiosus phosphoglucose isomerase.
DOI： 10.1021/ja710633c
发表时间： 2008-05
期刊： Journal of the American Chemical Society
影响因子： 15
作者： [Ruibo Wu;Hujun Xie;Z. Cao;Y. Mo]
通讯作者： Ruibo Wu;Hujun Xie;Z. Cao;Y. Mo
Defect-induced chemisorption of nitrogen oxides on (10,0) single-walled carbon nanotubes: Insights from density functional calculations.
DOI： 10.1063/1.3226572
发表时间： 2009-09
期刊： The Journal of chemical physics
影响因子： --
作者： [Shaobin Tang;Z. Cao]
通讯作者： Shaobin Tang;Z. Cao
共 26 条
    酶催化高毒有机磷化合物降解机制与活性调控的QM/MM多尺度模拟研究
    • 批准号：
      22373078
    • 项目类别：
      面上项目
    • 资助金额：
      50万元
    • 批准年份：
      2023
    • 负责人：
      曹泽星
    • 依托单位：
      厦门大学
    碳基小分子催化定向转化及外场与表界面效应的多尺度全程模拟研究
    • 批准号：
      21933009
    • 项目类别：
      重点项目
    • 资助金额：
      300.0万元
    • 批准年份：
      2019
    • 负责人：
      曹泽星
    • 依托单位：
      厦门大学
    酶催化二氧化碳捕获与还原转化的量子-经典力学研究
    • 批准号：
      21873078
    • 项目类别：
      面上项目
    • 资助金额：
      66.0万元
    • 批准年份：
      2018
    • 负责人：
      曹泽星
    • 依托单位：
      厦门大学
    呋喃类生物燃料热解自由基激发态及其与分子氧反应过程的理论研究
    • 批准号：
      21673185
    • 项目类别：
      面上项目
    • 资助金额：
      66.0万元
    • 批准年份：
      2016
    • 负责人：
      曹泽星
    • 依托单位：
      厦门大学
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