SWR1-ERECTA-MIR398模块调控拟南芥珠被发育的机理研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31700279
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    22.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0207.植物生殖与发育
  • 结题年份:
    2020
  • 批准年份:
    2017
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2018-01-01 至2020-12-31

项目摘要

Integument development is directly related to ovule morphogenesis and ovule sterility. Previous studies have shown that ERECTA(ER) signaling pathway controls the development of integument and ovule morphogenesis, but the downstream function genes are not identified and the molecular mechanism of this signaling pathways in the regulation of ovule development is unclear. Chromatin remodeling complex SWR1 regulates gene transcription by changing the function of chromosome conformation. It plays key roles in the different development stages of the plants and regulates the response of plants to environment. However, whether SWR1 are implicated in the regulation of integument development and ovule morphogenesis is unknown and the regulatory mechanism is elusive. ARP6 is a subunit of SWR1 complex. Through arp6 enhancer mutant screening and molecular cloning, we found that ER mutation is responsible for the enhanced integument developmental defects in arp6 mutagenic line. Our preliminary data showed that SWR1 genetically interacted with the ER-MPK6 signaling pathway to regulate integument development and ovule morphogenesis. We have identified the downstream components MIR398C under the coordination regulation of ARP6 and ER signaling pathways. This project aimed to identify how ARP6-ER signaling pathways co-regulate the expression of MIR398C and illuminate the molecular mechanisms of integument development regulated by SWR1-ER-MIR398 module. The SWR1 chromatin remodeling complex is highly conserved among different organisms. The output of this research will shed light on the developmental mechanisms of different development systems.
珠被发育对胚珠形态建成和胚珠的育性直接相关。前人研究显示ERECTA (ER)信号通路调控珠被的发育和胚珠形态建成,但该信号通路激活的下游基因还未知、调控珠被发育的分子机制也还不清楚。SWR1具有通过改变染色体构象调控基因转录的功能,在植株不同发育阶段和植物应答环境过程中都起重要作用,但是SWR1是否参与珠被发育和胚珠形态建成还未见报道,其调控机制如何实现还不清楚。本项目前期通过SWR1成员ARP6增强子筛选和基因克隆,揭示SWR1与ER-MPK6信号通路在遗传学上互作,共同调控珠被发育和胚珠形态建成,初步鉴定SWR1与ER信号通路共同调控珠被发育的下游基因MIR398C。本项目将进一步研究SWR1与ER信号通路共同调控MIR398C的分子机理,以期揭示SWR1-ER-MIR398模块调控珠被发育的分子机制。SWR1在不同物种间高度保守,该研究成果可为不同发育系统的发育机理的解析提供借鉴。

结项摘要

雌配子体是植物受精的场所,但数量较少且深埋于母体组织,其发育机理是植物学研究领域的重点和难点之一。染色质重塑是基因表达调控的重要方式之一,可以在生长发育的特定时期特异性地调节关键基因的表达。染色质重塑复合物SWR1可以在染色体的特定位点把组蛋白二聚体H2A-H2B中的H2A替换为变体H2A.Z,从而改变核小体结构并激活或抑制基因的转录。但是染色质重塑复合物SWR1的功能和作用机制仍然不清楚。本项目综合利用细胞生物学、分子生物学、生物化学和遗传学的手段,研究了染色质重塑复合物SWR1与ER-MPK信号途径相互作用共同调控胚囊和珠被的发育。我们进一步发现,染色质重塑复合物SWR1与ER信号途径通过抑制MIR398基因的转录调控拟南芥雌配子体和珠被的同步生长和发育。本研究系统阐明了SWR1与ER信号通路共同调控的下游基因MIR398C,建立信号调控网络,为解答染色质重塑复合物SWR1调控珠被发育的分子机制等关键科学问题,提供了重要的参考和理论依据。本项目原目标,全部完成。本项目共发表 SCI 收录论文6篇,其中第二标注 SCI论文2篇,Tropical Plant Biology,第三标注SCI论文3篇,包括 New Phytologist 2篇,BMC Genomics 1 篇,第四标注SCI论文1篇,Plant Journal。

项目成果

期刊论文数量(4)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Genome-wide investigation of calcium-dependent protein kinase gene family in pineapple: evolution and expression profiles during development and stress
菠萝钙依赖性蛋白激酶基因家族的全基因组研究:发育和应激过程中的进化和表达谱
  • DOI:
    10.1186/s12864-020-6501-8
  • 发表时间:
    2020-01
  • 期刊:
    BMC Genomics
  • 影响因子:
    4.4
  • 作者:
    Zhang Man;Liu Yanhui;He Qing;Chai Mengnan;Huang Youmei;Chen Fangqian;Wang Xiaomei;Liu Yeqiang;Cai Hanyang;Qin Yuan
  • 通讯作者:
    Qin Yuan
ATP binding cassette transporters ABCG1 and ABCG16 affect reproductive development via auxin signalling in Arabidopsis
ATP 结合盒转运蛋白 ABCG1 和 ABCG16 通过生长素信号传导影响拟南芥的生殖发育
  • DOI:
    10.1111/tpj.14690
  • 发表时间:
    2020-02-17
  • 期刊:
    PLANT JOURNAL
  • 影响因子:
    7.2
  • 作者:
    Liu, Liping;Zhao, Lihua;Qin, Yuan
  • 通讯作者:
    Qin, Yuan
HBI1 acts downstream of ERECTA and SWR1 in regulating inflorescence architecture through the activation of the brassinosteroid and auxin signaling pathways
HBI1 作用于 ERECTA 和 SWR1 下游,通过激活油菜素类固醇和生长素信号通路来调节花序结构
  • DOI:
    10.1111/nph.16840
  • 发表时间:
    2020-09-01
  • 期刊:
    NEW PHYTOLOGIST
  • 影响因子:
    9.4
  • 作者:
    Cai, Hanyang;Chai, Mengnan;Qin, Yuan
  • 通讯作者:
    Qin, Yuan
Genome-Wide Classification and Evolutionary and Functional Analyses of the VQ Family
VQ 家族的全基因组分类以及进化和功能分析
  • DOI:
    10.1007/s12042-019-09224-4
  • 发表时间:
    2019-06-01
  • 期刊:
    TROPICAL PLANT BIOLOGY
  • 影响因子:
    2
  • 作者:
    Cai, Hanyang;Zhang, Man;Qin, Yuan
  • 通讯作者:
    Qin, Yuan

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水稻Xa21基因启动子序列分析及其在不同条件下的表达特征
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    牟少亮;刘志钦;赖燕;蔡汉阳;何水林;MOU Shao-lianga,b,LIU Zhi-qina,b,LAI Yana,b,CAI Ha
  • 通讯作者:
    MOU Shao-lianga,b,LIU Zhi-qina,b,LAI Yana,b,CAI Ha
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  • 通讯作者:
    何水林

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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