红壤中氮素代谢微生物多样性与相关土壤酶来源的生物信息学解析

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    40871125
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    45.0万
  • 负责人：
    曹慧
  • 依托单位：
    南京农业大学
  • 学科分类：
    D0709.基础土壤学
  • 结题年份：
    2011
  • 批准年份：
    2008
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2009-01-01 至2011-12-31

项目摘要

土壤微生物是自然界中氮素循环的重要推动者，其分泌的氮素代谢相关酶直接参与土壤氮素的形态转化。本项目选择红壤为典型研究区域，以参与氮素代谢的关键微生物类群为研究对象，通过构建氨单加氧酶（amoA）、硝酸还原酶（nirK）、氧化二氮还原酶（nosZ）和固氮酶（nifH）基因文库，采用PCR-RFLP方法进行酶切分型；通过功能基因序列测定与蛋白质序列比对，研究其系统发育特征，阐明红壤中氮素代谢微生物的主要类群；采用荧光原位杂交技术，研究红壤中氮素代谢微生物的数量与分布；通过提取、纯化与分离红壤中的氮素代谢相关酶蛋白，包括脲酶、蛋白酶、硝酸还原酶、亚硝酸还原酶和羟基还原酶，采用N-端氨基酸序列测定方法，结合GeneBank蛋白质数据库，对土壤酶蛋白来源进行生物信息学解析。预期结果将深化对红壤氮素代谢相关微生物多样性认识，为研究土壤氮素代谢相关微生物及其生态功能开辟一条新的思路。

结项摘要

项目成果

期刊论文数量（7）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
培养方法对土壤可培养细菌多样性的影响.
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    土壤学报，2009，46（6）：1097~1101（通讯作者）
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
  • 通讯作者：
Analysis of nifH Gene Diversity in Red Soil Amended with Manure in Jiangxi, South China. The Journal of Microbiology，2009，47（2）：135~141
江西粪肥红壤nifH基因多样性分析。
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
  • 通讯作者：
Rice?to?vegetables：short-versus?long-term impact of land use?change?on?the?indigenous?soil?microbial?community. Microbial?Ecology，2011，62：474~485
从水稻到蔬菜，土地利用变化对本土土壤微生物群落的短期影响与长期影响。
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
  • 通讯作者：
Cloning and functional characterization of a novel endo-β-1,4-glucanase gene from a soil-derived metagenomic library. Appl Microbiol Biotechnol.，2011，89:1083~1092
来自土壤源性宏基因组文库的新型内切β-1,4-葡聚糖酶基因的克隆和功能表征。
  • DOI：
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  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
  • 通讯作者：
元蛋白质组学：研究土壤微生物生态功能的一种新方法
  • DOI：
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  • 发表时间：
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  • 作者：
  • 通讯作者：

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    曹慧
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  • 作者：
    曹慧
  • 通讯作者：
    曹慧

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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