IgG抗体成熟模式的生物信息学研究
批准号：
30500107
项目类别：
青年科学基金项目
资助金额：
28.0 万元
负责人：
曹志伟
依托单位：
学科分类：
物理生物学
结题年份：
2008
批准年份：
2005
项目状态：
已结题
项目参与者：
石忆湘、李淼新、徐昊、俞鸿、魏武、张国庆
项目摘要
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项目成果
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中文摘要
本项目紧紧围绕IgG抗体成熟模式，综合利用生物信息学模式识别、计算生物学分子模拟，以及数学建模方法，结合抗体组学、结构生物学等海量信息进行系统性研究。研究内容包括：IgG基因片断重排的统计规律、基因突变到IgG抗体蛋白质多肽的偏好性，特定抗原刺激下的IgG抗体V区突变的规律等，建立相关数理统计和分子模拟模型，发现抗原刺激下的IgG抗体自然选择的模式。本研究不但能对分子免疫学实验提供理论指导，使其更具有针对性，而且对抗体药物的开发有潜在理论和应用价值。此外，作为一类重要而特殊的蛋白质，研究抗原刺激下抗体的成熟模式必将对深刻理解蛋白质结构和功能的关系、蛋白－蛋白相互作用的本质，揭示蛋白质进化规律具有重大意义。
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Ab-origin: an enhanced tool to identify the sourcing gene segments in germline for rearranged antibodies.
Ab-origin：一种增强工具，用于识别重排抗体种系中的来源基因片段
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DOI：
10.1186/1471-2105-9-s12-s20
发表时间：
2008-12-12
期刊：
BMC bioinformatics
影响因子：
3
作者：
[Wang X, Wu D, Zheng S, Sun J, Tao L, Li Y, Cao Z]
通讯作者：
Cao Z
Prediction of antibiotic resistance proteins from sequence-derived properties irrespective of sequence similarity
无论序列相似性如何，根据序列衍生的特性预测抗生素抗性蛋白
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DOI：
--
发表时间：
--
期刊：
影响因子：
--
作者：
[]
通讯作者：
Modular co-evolution of metabolic networks.
代谢网络的模块化协同进化
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DOI：
10.1186/1471-2105-8-311
发表时间：
2007-08-27
期刊：
BMC BIOINFORMATICS
影响因子：
3
作者：
[Zhao, Jing, Ding, Guo-Hui, Tao, Lin, Yu, Hong, Yu, Zhong-Hao, Luo, Jian-Hua, Cao, Zhi-Wei, Li, Yi-Xue]
通讯作者：
Li, Yi-Xue
DOI：
--
发表时间：
--
期刊：
影响因子：
作者：
[]
通讯作者：
Genome sequencing and comparative analysis of Saccharomyces cerevisiae strain YJM789
酿酒酵母YJM789菌株基因组测序及比较分析
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DOI：
10.1073/pnas.0701291104
发表时间：
2007-07-31
期刊：
PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA
影响因子：
11.1
作者：
[Wei, Wu, McCusker, John H., Steinmetz, Lars M.]
通讯作者：
Steinmetz, Lars M.
共 10 条
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