前期的研究表明在TEL-AML1相关白血病（acute lymphoblastic leukemia, ALL）发病中，TEL-AML1融合基因的形成是始动因素，将正常造血细胞转变成前白血病干细胞（pre-leukemic stem cell, pre-LSC），Pre-LSC遇到第二次突变演变成白血病干细胞（LSC），提示这个过程有两次异常重编程过程，但是这些重编程的特点和调控机制还不清楚。本项目的研究回答了上述科学问题。首先通过靶向功能实验，我们证实了只有造血干细胞（hematopoietic stem cell）才可能是TEL-AML1相关白血病的起源细胞，而非B-祖细胞。TEL-AML1将HSC起始异常重编程为pre-LSC。Microarray 分析提示pre-LSC的分化阶段在HSC 和pro-B祖细胞之间。接着重点研究了再次重编程的特点，将功能实验证实的HSC自我更新所需基因和B-细胞发育所需基因编成一个程序（命名为HSCB program），用生物信息学分析方法比较分析了该程序在正常脐带血和TEL-AML1相关白血病细胞群的呈现特点。在正常细胞群中（根据免疫表型分离纯化），各自聚集但彼此分开，证实了HSCB程序能很好代表其转录组。有趣的是，ALL中不同细胞群都松散地聚集，并最为靠近早期淋巴祖细胞。因此提示①免疫表型不再能反映ALL细胞的成熟程度。② 各个细胞群中LSC的自我更新程序是从HSC中保留而来，而非从造血祖细胞转化而来。进一步研究证实LSC自我更新程序的保留是由于这些基因不能被甲基化所致。. 因此，我们发现了一个新的ALL发病学机制，一些ALL（如TEL-AML1相关白血病）是“干细胞”疾病，而非传统观点所认为的“B-祖细胞”疾病。干细胞的各种程序因表观遗传调控失常得以保留。