水稻直播栽培以其低成本、操作简便的优点日益受到人们的重视。而低温条件下具有很高的发芽力是水稻直播栽培的前提，许多现有高产、优质的品种在低温条件下发芽力低下，不能进行直播栽培，因此急需获得耐低温发芽的种质资源，探讨其耐低温发芽的分子机制。本项目拟利用极强耐低温发芽的水稻品种USSR5及其不耐低温发芽的近等基因系U-NIL-5为材料，系统分析两者在低温萌发过程中内源激素含量、对激素的敏感性、淀粉酶活性、同功酶类型、碳代谢、氮代谢、蛋白表达（2D-电泳）等方面的差异，以阐明耐低温发芽的生理机制；同时利用U-NIL-5与USSR5杂交，构建10000株以上的F2次级分离群体，设计、开发新的SSR和Indel标记，精细定位qLTG-5，然后利用与目标基因紧密连锁的分子标记筛选BAC/PAC克隆，确定侯选基因，结合生理分析结果，探讨侯选基因在耐低温萌发中的生理功能。