m6A识别蛋白YTHDC1与FIP1L1相互作用调控可选择性多聚腺苷酸化的机制研究

批准号:
32000450
项目类别:
青年科学基金项目
资助金额:
24.0 万元
负责人:
陈留涛
依托单位:
学科分类:
基因表达及非编码序列调控
结题年份:
2023
批准年份:
2020
项目状态:
已结题
项目参与者:
陈留涛
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中文摘要
N6-甲基腺嘌呤(m6A)和可选择性多聚腺苷酸化(APA)在基因表达调控上扮演重要功能,近来研究表明m6A与APA调控密切相关,但是具体的调控机制仍不清楚。我们前期已证明m6A识别蛋白YTHDC1可以调控APA,YTHDC1与3'末端加工核心蛋白FIP1L1存在直接作用,并且发现YTHDC1与FIP1L1的互作方式具有明显“相分离”的特征。据此,我们推测m6A识别蛋白YTHDC1可能与FIP1L1以“相分离”互作的模式调控APA。本项目欲通过基因编辑、体外蛋白表达与纯化、超分辨显成像、APA与iCLIP高通量测序等技术研究YTHDC1与FIP1L1”相分离“互作调控APA的规律,鉴定“相分离”相互作用的关键位点,明确两者”相分离“调控APA的分子机制。本项目首次从“相分离”的角度解析转录终止调控的机制,为研究APA的分子机制提供了全新的方向。
英文摘要
Both N6-methyl adenine (m6A) and APA play an important role in gene expression regulation, and recent studies have shown that m6A is closely related to APA regulation, but the specific regulatory mechanism is still obscure. We have previously proved that m6A reader YTHDC1 can regulate APA, YTHDC1 interacts directly with 3 'end processing factor FIP1L1 in a way of phase separation. We speculate that m6A reader YTHDC1 and FIP1L1 may regulate APA in a phase separation mode. Applied with gene editing, in vitro protein expression and purification, super-resolution imaging, high-throughput sequencing of APA and iCLIP, this project aims to analyze the role of phase separation between YTHDC1 and FIP1L1 on regulation of APA, identification the key interacting sites, and clarify the molecular mechanism of phase separation regulating APA. This is the first project studies the mechanism of transcription termination from the angle of phase separation, which shed a light on novel direction for studying the molecular mechanism of APA.
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U1 snRNP proteins promote proximal alternative polyadenylation sites by directly interacting with 3' end processing core factors.
U1 snRNP 蛋白通过直接与 3â2 末端加工核心因子相互作用来促进近端选择性多聚腺苷酸化位点
DOI:10.1093/jmcb/mjac054
发表时间:2022-12-26
期刊:Journal of molecular cell biology
影响因子:5.5
作者:
通讯作者:
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113197
发表时间:2023-09
期刊:Cell reports
影响因子:8.8
作者:Susu Liu;Runze Wu;Liutao Chen;Ke Deng;Xin Ou;Xin Lu;Mengxia Li;Chao Liu;Shangwu Chen-Shangwu-Ch
通讯作者:Susu Liu;Runze Wu;Liutao Chen;Ke Deng;Xin Ou;Xin Lu;Mengxia Li;Chao Liu;Shangwu Chen-Shangwu-Ch
Nuclear m6A reader YTHDC1 suppresses proximal alternative polyadenylation sites by interfering with the 3′ processing machinery
核 m 6 A 阅读器 YTHDC1 通过干扰 3 加工机制来抑制近端选择性多聚腺苷酸化位点
DOI:10.15252/embr.202254686
发表时间:2022-09-12
期刊:EMBO REPORTS
影响因子:7.7
作者:Chen, Liutao;Fu, Yonggui;Xu, Anlong
通讯作者:Xu, Anlong
m6A识别蛋白YTHDC1/YTHDC2调控可选择性多聚腺苷酸化的机制研究
- 批准号:2020A151501293
- 项目类别:省市级项目
- 资助金额:10.0万元
- 批准年份:2020
- 负责人:陈留涛
- 依托单位:
国内基金
海外基金
