丝/苏氨酸蛋白激酶对结核分枝杆菌磷酸葡糖胺变位酶Tb_GlmM磷酸化修饰反应的分子调控机制研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31700697
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    24.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0505.蛋白质、多肽与酶生物化学
  • 结题年份:
    2020
  • 批准年份:
    2017
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2018-01-01 至2020-12-31

项目摘要

Phosphoglucosamine mutase (GlmM) is responsible for the formation of UDP-N-acetylglucosamine, an important precursor component of cell wall structure, in the human pathogenic bacterium Mycobacterium tuberculosis. Mycobacterium tuberculosis GlmM (Tb_GlmM) is essential for mycobacteria viability, and exists only in prokaryotes, which makes Tb_GlmM an ideal target for development of new anti-tuberculosis drugs. Our recent studies indicated that Tb_GlmM was phosphorylated in vivo, and the phosphorylation state of Tb_GlmM was crucial for maintaining the fully catalytic ability of enzyme. Site-directed mutagenesis of Tb_GlmM showed that a reversible phosphorylation in Ser102 played a pivotal role in regulating Tb_GlmM catalytic ability. At the molecular level, the reversible phosphorylation in Ser102 was tightly regulated by various serine/threonine protein kinases (STPKs), however, the exact regulatory mechanism was unclear. The aim of this project is to further clarify the molecular mechanism that is critical for regulating Tb_GlmM phosphorylation in a physiological manner. The research includes following contents: To identify the specific STPKs which are responsible for Tb_GlmM phosphorylation in vivo and illustrate its possible effects on Tb_GlmM phosphorylation; To identify all the phosphorylation sites on Tb_GlmM and further clarify the effects of each phosphorylation site on regulate Tb_GlmM phosphorylation state and enzyme activity; To determine the phenotypic properties in Mycobacterium tuberculosis H37Ra strains with different Tb_GlmM phosphorylation states. According to the analysis results, the molecular mechanism of Tb_GlmM phosphorylation which regulated by STPKs will be revealed. The study will provide the more evidence for theory on enzyme modification in prokaryote, and also provide a new way for development of Tb_GlmM enzyme inhibitors, as new antituberculosis drugs.
结核分枝杆菌磷酸葡糖胺变位酶Tb_GlmM是参与细胞壁合成的关键酶,为结核分枝杆菌生长所必需,是理想的抗结核药物作用新靶标。本课题组前期研究发现Tb_GlmM第102位保守丝氨酸残基的磷酸化修饰是酶活化的关键。进一步分析提示该保守丝氨酸的磷酸化受到多种丝/苏氨酸蛋白激酶STPKs的调控,但具体机制不明。因此本课题将重点探讨STPKs对Tb_GlmM磷酸化反应的调控,具体内容包括:从蛋白水平确定生理状态下作用于Tb_GlmM的靶STPKs及其作用效应;从分子水平鉴定STPKs作用位点及各磷酸化位点对Tb_GlmM磷酸化状态及酶活性的影响;从菌体水平观察Tb_GlmM不同磷酸化位点的磷酸化状态对细菌生长的影响。通过以上结果系统阐明生理状态下STPKs调控Tb_GlmM磷酸化反应的分子机制。本课题研究结果不仅丰富了原核生物酶修饰与调控的理论知识,也为GlmM抑制剂的定向设计研发提供了新方向。

结项摘要

结核分枝杆菌磷酸葡糖胺变位酶Tb_GlmM是参与细胞壁合成的关键酶,为理想的抗结核药物作用靶标。磷酸化是生物体最重要的蛋白共价修饰方式,是蛋白的功能“开关”,干预蛋白磷酸化过程已成为药物研发的重要策略。研究发现Tb_GlmM存在磷酸化修饰,且磷酸化修饰是维持酶活性的关键因素,因此,本课题对Tb_GlmM蛋白磷酸化机制进行深入探讨。特异性磷酸丝/苏氨酸抗体检测发现,Tb_GlmM同时存在丝氨酸和苏氨酸残基的磷酸化修饰,但质谱检测未鉴定出Tb_GlmM磷酸化位点,考虑可能由于Tb_GlmM蛋白整体磷酸化水平较低,且不同生理状态下Tb_GlmM磷酸化水平及位点不同导致。序列比对发现Tb_GlmM第102位丝氨酸残基(Ser102)高度保守,该位点突变导致酶活性完全丧失。体外激酶反应发现Tb_GlmM可发生自我磷酸化,Ser102位点突变后,蛋白磷酸化水平无明显改变,但自我磷酸化现象消失,证明Tb_GlmM中Ser102的磷酸化修饰反应为自我磷酸化,Ser102的自我磷酸化是维持酶活性的关键。对Tb_GlmM截短蛋白分析发现,蛋白C端79个氨基酸残基可能参与催化Ser102的自磷酸化反应。Ser102自我磷酸化机制的阐明为Tb_GlmM抑制剂的定向设计研发提供了理论基础。Tb_GlmM中存在多个磷酸化位点,除Ser102,其他位点磷酸化均需激酶参与,文献报道丝/苏氨酸蛋白激酶(STPKs)可能参与GlmM的初始磷酸化过程。为寻找催化Tb_GlmM磷酸化发生的激酶,我们成功表达了11种结核分枝杆菌STPKs的胞内结构域,并验证了激酶活性。然而利用Phos-tag凝胶、ADP-Glo Kinase Assay、Pull-down多种分析方法,均未发现STPKs与Tb_GlmM之间发生相互作用,提示在结核分枝杆菌中Tb_GlmM的初始磷酸化由其他激酶催化,仍需进一步寻找可能的相关激酶。

项目成果

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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