ORMDL3在类风湿关节炎中的作用及机制研究

批准号:
31771451
项目类别:
面上项目
资助金额:
60.0 万元
负责人:
刘贇
依托单位:
学科分类:
C0602.基因表达及非编码序列调控
结题年份:
2021
批准年份:
2017
项目状态:
已结题
项目参与者:
孙霞、邱文青、戈哲、李陶陶、金泽霖、蒙伟达、徐值娇、刘佩茹
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中文摘要
类风湿关节炎是一个全身性自身免疫性疾病,遗传在其发病中起到非常重要的作用。全基因组关联分析(GWAS)已经发现了100多个和类风湿关节炎发生有关联的遗传位点,但是对于这些基因区段导致疾病产生的分子机理机制仍然知之甚少。我们的前期工作通过生物信息大数据分析发现并确认了类风湿关节炎风险基因ORMDL3,并发现增强子对其潜在的表达调控。本项目拟在此基础上运用分子、细胞、遗传以及免疫等手段探索ORMDL3在类风湿关节炎发病中的作用:1)体外实验研究增强子区段基因型、转录因子对ORMDL3表达调控的分子机制;2)体内实验研究临床样品中增强子基因型对转录因子结合及类风湿关节炎病人ORMDL3表达的影响;3)细胞及小鼠模型,研究ORMDL3对免疫炎症及类风湿关节炎发生的生理机制。本项目的研究对揭示类风湿关节炎发生的机理机制具有重要意义,并可为其将来的诊治提供一个潜在的新靶点。
英文摘要
Rheumatoid arthritis (RA) is an autoimmune disease. Genome-wide association studies (GWASs) have identified more than 100 loci associated with RA, but for most cases, functionally affected genes and their underlying molecular mechanisms contributing to these associations are unknown. By performing an integrative analysis incorporating multiple “omics” data, we identified a RA risk gene ORMDL3 and a potential mechanism regulating its expression. Through molecular, cellular, genetic and immunological approaches, this project aims to investigate 1) whether genetic variants in the enhancer regulate transcription factor binding and ORMDL3 expression in vitro; 2) the regulations of ORMDL3 expression in RA patients in vivo; 3) the functional mechanisms of ORMDL3 on regulation of immune system, as well as the development of RA in a mouse model. This project bears substantial significance to reveal the mechanism of RA development, and may provide a potential target for its future prediction and treatment.
类风湿关节炎是一个全身性自身免疫性疾病,遗传在其发病中起到非常重要的作用。全基因组关联分析(GWAS)已经发现了100多个和类风湿关节炎发生有关联的遗传位点,但是对于这些基因区段导致疾病产生的分子机理机制仍然知之甚少。本项目我们通过生物信息大数据分析,结合分子、细胞、遗传以及免疫等手段,揭示了RA风险基因ORMDL3增强子区rs56199421的T等位基因促进转录因子junD的结合,从而导致ORMDL3的高表达,进而增加RA发生的风险。此机制可能在类风湿关节炎的发病中起到重要作用,并为RA将来的诊治提供一个潜在的新靶点。
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Altered DNA methylation pattern reveals epigenetic regulation of Hox genes in thoracic aortic dissection and serves as a biomarker in disease diagnosis.
DNA甲基化模式的改变揭示了胸主动脉夹层中Hox基因的表观遗传调控,并可作为疾病诊断的生物标志物
DOI:10.1186/s13148-021-01110-9
发表时间:2021-06-08
期刊:Clinical epigenetics
影响因子:5.7
作者:Liu P;Zhang J;Du D;Zhang D;Jin Z;Qiu W;Zhou X;Dong S;Zhou M;Zhao H;Zhang W;Ma J;Sun S;Fu W;Liu Y;Wang L
通讯作者:Wang L
DNA Methylation of the MHC Region in Rheumatoid Arthritis: Perspectives and Challenges
类风湿关节炎中 MHC 区域的 DNA 甲基化:前景和挑战
DOI:10.3899/jrheum.191404
发表时间:2020-11
期刊:Journal of Rheumatology
影响因子:3.9
作者:Wenqing Qiu;Yun Liu
通讯作者:Yun Liu
Genotype-dependent epigenetic regulation of DLGAP2 in alcohol use and dependence
DLGAP2 在酒精使用和依赖中的基因型依赖性表观遗传调节
DOI:10.1038/s41380-019-0588-9
发表时间:2019-11
期刊:Molecular Psychiatry
影响因子:11
作者:Meng W.;Sjöholm LK.;Kononenko O.;Tay N.;Zhang D.;Sarkisyan D.;Geske JR.;Ing A.;Qiu W.;Watanabe H.;Almamoun R.;Frieling H.;Bleich S.;Cui D.;Biernacka JM.;Mayfield RD.;Dang Y.;Karpyak VM.;Schumann G.;Bakalkin G.;Ekström TJ.;Rüegg J.;Liu Y.
通讯作者:Liu Y.
DNA methylation in human diseases.
人类疾病中的DNA甲基化
DOI:10.1016/j.gendis.2018.01.002
发表时间:2018-03
期刊:Genes & diseases
影响因子:6.8
作者:Jin Z;Liu Y
通讯作者:Liu Y
Determination of local chromatin interactions using a combined CRISPR and peroxidase APEX2 system
使用 CRISPR 和过氧化物酶 APEX2 组合系统测定局部染色质相互作用
DOI:10.1093/nar/gkz134
发表时间:2019-05-21
期刊:NUCLEIC ACIDS RESEARCH
影响因子:14.9
作者:Qiu, Wenqing;Xu, Zhijiao;Liu, Yun
通讯作者:Liu, Yun
自闭症相关基因DLGAP2的鉴定及致病机制研究
- 批准号:82171837
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:60万元
- 批准年份:2021
- 负责人:刘贇
- 依托单位:
人类淋巴母细胞系中基因与DNA甲基化上位效应对基因表达作用的研究
- 批准号:31471212
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:80.0万元
- 批准年份:2014
- 负责人:刘贇
- 依托单位:
妊娠糖尿病对子代基因组甲基化水平的影响
- 批准号:81370728
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:70.0万元
- 批准年份:2013
- 负责人:刘贇
- 依托单位:
国内基金
海外基金
