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生物信息学与最优化方法

批准号：
10631070
项目类别：
重点项目
资助金额：
125.0 万元
负责人：
章祥荪
依托单位：
中国科学院数学与系统科学研究院
学科分类：
连续优化
结题年份：
2010
批准年份：
2006
项目状态：
已结题
项目参与者：
邓乃扬、李国君、吴凌云、李珍萍、经玲、吴建良
关键词：
生物信息学运筹学数据挖掘系统生物学最优化方法

项目摘要

结项摘要

项目成果

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中文摘要
生物信息学是当前国际上生命科学和数学、信息科学交叉的研究热点和前沿领域。由于生物的进化过程是一个遗传优化的过程，所以优化模型在生命现象的数学模型建立中起到了主要作用，最优化算法与数据挖掘方法相结合在生物信息学的研究中具有举足轻重的地位。本项目主要应用优化方法及其他数据挖掘方法包括组合数学、图论、支持向量机等研究当前生物信息学中最受关注的若干重要问题，如系统生物学（基因调控网络）、蛋白质组学、蛋白质结构与功能预测、DNA序列中操纵子识别、祖先功能基因组预测等，建立适合生物信息学特点的数学模型，设计能满足大规模生物信息处理的高效算法，为有效地解决生物信息学领域的问题提供强有力的支持。通过研究中提出的对优化理论和算法的挑战性问题，提炼出优化理论问题，例如NP-难问题的近似理论，复杂系统的运筹学模型，启发式算法以及支持向量机、人工神经网络的有关理论问题。
英文摘要
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会议论文列表
专利列表
Editorial
社论
DOI： 10.1016/s1361-3723(20)30046-4
发表时间： 2020-05-27
期刊： Computer Fraud & Security
影响因子： --
作者： [Mansfield-Devine S]
通讯作者： Mansfield-Devine S
Remarks on Network Community Properties
网络社区属性备注
DOI： 10.1007/s11424-008-9140-8
发表时间： 2008-11
期刊： 系统科学与复杂性学报(英文版)
影响因子： --
作者： [Qiu, Yuqing, Wang, Jiguang, Wang, Ruisheng, Zhang, Xiangsun]
通讯作者： Zhang, Xiangsun
Self-organizing map approaches for the haplotype assembly problem
单倍型组装问题的自组织图谱方法
DOI： 10.1016/j.matcom.2009.01.021
发表时间： 2009-06
期刊： Mathematics and Computers in Simulation
影响因子： 4.6
作者： [Chen, Luonan, Wu, Ling-Yun, Wang, Rui-Sheng, Zhang, Xiang-Sun, Li, Zhenping]
通讯作者： Li, Zhenping
Modularity optimization in community detection of complex networks
DOI： 10.1209/0295-5075/87/38002
发表时间： 2009-08
期刊： EPL (Europhysics Letters)
影响因子： --
作者： [X. Zhang;R. Wang;Y. Wang;J. Wang;Y. Qiu;L. Wang;L. Chen]
通讯作者： X. Zhang;R. Wang;Y. Wang;J. Wang;Y. Qiu;L. Wang;L. Chen
共 43 条
    复杂网络中的优化问题及其在系统生物学中的应用
    第10届运筹学及其应用国际研讨会
    第9届运筹学及其应用国际研讨会
    从生物分子网络中挖掘功能模块和生物通路的模型与算法研究
    国内基金
    海外基金