新农药创制研究是一项十分复杂的系统工程，农药的分子设计是其最核心的技术，而农药活性小分子与作用靶酶之间的选择性相互作用研究是获得高活性先导结构的关键。本项目将根据文献报道的烟草PPO与除草剂复合物的晶体结构，采用同源模建方法构建不同作物与杂草的PPO三维结构模型，并进一步采用分子对接、分子动力学、DFT/QSAR、3D-QSAR等方法研究探针分子与PPO之间的选择性相互作用，在深入理解授-受体相互作用规律的基础上开展虚拟筛选研究，以发现结构新颖的PPO抑制剂，并通过对抑制剂的结构进行优化和修饰，设计合成高效、高选择性、安全低毒的新型除草剂，力争找到1~2个具有进一步修饰与开发潜力的高活性除草剂先导结构。