马铃薯现代细胞遗传学体系的建立及其在相关研究中的应用

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31560302
  • 项目类别:
    地区科学基金项目
  • 资助金额:
    43.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0602.基因表达及非编码序列调控
  • 结题年份:
    2019
  • 批准年份:
    2015
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2016-01-01 至2019-12-31

项目摘要

Potato is the world’s fouth most important food crop. Compared with other crops, the modern cytogenetics and chromosomal identifications of potato and its relatives have not been fully established, which restricted the studies of chromosomal engineering, polyploid evolutions, and inhibited the establishment of genetic materials as well as the applications of wild germplasms of potato. In this project, we will utilize the published potato tandem repeated sequences and find more subtelomeric or paracentromeric repeated sequences to establish the chromosomal identifications and cytogenetic systems of potato and its relatives by the fluorescent in situ hybridyzation (FISH) and chromosome painting techniques. We will identify every chromosome of potato in one chromosomal spread and connect the nominations of chromosomal identification system with genetic map by BAC-FISH using BAC clones with known linkage positions. The purposes of this project are to utilize the tool-kit to the comparative genomic studies of potato and its relatives, the alloployploid evolutions of potato.
马铃薯是世界第四大粮食作物,由于马铃薯有通过无性繁殖、非纯系、多倍体和基因组结构复杂等特点,相对其他主要粮食作物,有关马铃薯现代细胞遗传学和比较基因组学研究相对落后。本项目将利用已报道的马铃薯的重复序列,寻找更多的染色体亚端粒和近着丝粒重复序列,采用荧光原位杂交(FISH)和染色体涂色技术,建立马铃薯染色体辨认图,把其每一条染色体一次性准确无误地辨认出来,同时结合BAC-FISH技术,建立染色体细胞遗传图和遗传连锁图的联系和统一它们的命名。并利用该染色体识别工具,推广到A、B、E和P基因组野生近缘种染色体研究中;以及进行马铃薯同源多倍体减数分裂染色体行为研究。该项目的完成不仅可建立马铃薯现代细胞遗传学体系,而且将增进我们对马铃薯不同基因组染色体结构的了解,促进马铃薯同源多倍体进化等相关研究。

结项摘要

马铃薯是世界第四大粮食作物,由于马铃薯有通过无性繁殖、非纯系、多倍体和基因组结构复杂等特点,相对其他主要粮食作物,有关马铃薯现代细胞遗传学和比较基因组学研究相对落后。本项目通过生物信息学方法找到马铃薯9个不同的串联重复序列,利用荧光原位杂交(FISH)和染色体涂色技术,观察了这些串联重复序列在二倍体马铃薯染色体上的分布和特点;建立了马铃薯染色体辨认图,将马铃薯每一条染色体一次性准确无误地辨认出来,同时结合BAC-FISH技术,建立了染色体细胞遗传图和遗传连锁图的联系和统一它们的命名。并利用该染色体识别工具,推广到A、B、E和P基因组野生近缘种染色体研究中;比较了串联重复序列在不同基因组的分布差异和染色体结构变化。并利用本项目建立的染色体精确识别的工具,研究了马铃薯同源多倍体减数分裂染色体行为,发现栽培马铃薯四倍体存在减数分裂染色体配对和分离异常现象,证实同源多倍体马铃薯基因组不稳定性。此外,将本染色体精确识别的工具应用到马铃薯多倍体育种,建立了一种快速、准确的基因组倍性鉴定技术,获得多个人工合成细胞嵌合体和同源四倍体马铃薯新材料。该项目的完成增进了我们对马铃薯不同基因组染色体结构的了解,建立了马铃薯染色体精确辨认的工具,对促进马铃薯同源多倍体进化和倍性育种有意义。

项目成果

期刊论文数量(2)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Karyotyping and identifying all the chromosomesof allopolyploid Brassica juncea using multi-color FISH
异源多倍体芥菜所有染色体的核型分析及多色FISH鉴定
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    The Crop Journal
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Zhijun Xu;Bei Xie;Tian Wu;Xiaoxia Xin;Lingyu Mang;Guangxuan Tan;Zhiyong Xiong
  • 通讯作者:
    Zhiyong Xiong
Haplotype-phased genome and evolution of phytonutrient pathways of tetraploid blueberry
四倍体蓝莓的单倍型相基因组和植物营养素途径的进化
  • DOI:
    10.1093/gigascience/giz012
  • 发表时间:
    2019-03-01
  • 期刊:
    GIGASCIENCE
  • 影响因子:
    9.2
  • 作者:
    Colle, Marivi;Leisner, Courtney P.;Edger, Patrick P.
  • 通讯作者:
    Edger, Patrick P.

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其他文献

姜粉及其有效成分对丙烯酰胺生成的影响及动力学研究
  • DOI:
    10.13684/j.cnki.spkj.2017.08.045
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    食品科技
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    阴永泼;李冰;李琳;熊志勇;卞华伟
  • 通讯作者:
    卞华伟
基于单向差值扩展的彩色图像可逆数据隐藏
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    光电子.激光
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    --
  • 作者:
    熊志勇;王江晴
  • 通讯作者:
    王江晴
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  • DOI:
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  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    现代电子技术
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    熊志勇;蓝水平;蒋天发
  • 通讯作者:
    蒋天发
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  • DOI:
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  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    光电子.激光
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    熊志勇;王江晴
  • 通讯作者:
    王江晴
基于差值直方图平移的彩色图像可逆信息隐藏
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    四川大学学报(工程科学版)
  • 影响因子:
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  • 作者:
    熊志勇;王江晴
  • 通讯作者:
    王江晴

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熊志勇的其他基金

马铃薯细胞嵌合体引起生物量增加的成因与发生机制研究
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  • 批准年份:
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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