基于组学的田鼠巴贝虫分泌蛋白预测分析及其诊断抗原免疫高通量筛选

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81601784
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    18.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H2203.寄生虫与感染
  • 结题年份:
    2019
  • 批准年份:
    2016
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2017-01-01 至2019-12-31

项目摘要

Babesia microti is a kind of protozoa transmitted by ticks and can parasitize in the erythrocytes of human beings or other mammals and cause babesiosis. Babesiosis is an emerging parasitic disease which is seriously threatening the public health. The identification of B. microti by morphology is difficult, meanwhile the molecular diagnosis is restricted in application on field. Relatively, serological diagnostics are the most convenient diagnostic tools to be carried out. But, so far, the antigens applied in serological diagnosis of babesiosis were insufficient. What’s more, the sensitivities and specificities of antigens of B. microti currently used are limited. Secreted proteins of parasites can contact with the immune system of the hosts directly and regulate the immune reactions of hosts at different infection stages. So the secreted proteins can be the immunologically important antigens or other targets. The researches on omics of B. microti are deficient and need to be improved. Based on the reasons above, this research is carried on by the following steps: 1) downloading the database of B. microti from Pubmed and PiroplasmaDB to complete the original database of B. microti; 2) making use of the bioinformatics methods, such as softwares of SignalP4.1 Server, TMHMM Server v.2.0 and big-PI Predictor etc. to predict the signal peptides, transmembranes regions and GPI-anchored respectively and construct a local database of secreted proteins of B. microti ; 3) applying the high-throughput systems combined by In-fusion cloning, Wheat germ cell-free expression system and protein chips to hight-hroughput screening and analysis the candidates from secreted proteins database and carrying on further evaluations of these candidates in diagnosis of babesiosis on fields. By the studies above, some antigens and drug candidates will be screened and identified. It will improve the prevention and treatment of babesiosis.
田鼠巴贝虫是寄生于人或其它哺乳动物红细胞内一重要蜱媒原虫,可引起巴贝虫病并严重威胁人类健康。田鼠巴贝虫形态学鉴定困难,分子生物学诊断受现场应用限制,血清学诊断相对方便快捷,然其诊断抗原有限,敏感性与特异性尚不能满足实际诊断需要。虫体分泌蛋白与宿主免疫系统直接接触、影响宿主免疫调节,是免疫学上重要的抗原与靶点,目前田鼠巴贝虫组学研究基础薄弱,本研究通过1) Pubmed和梨浆虫PiroplasmaDB等公共数据库整理田鼠巴贝虫原始数据库;2) 采用SignalP4.1 Server、TMHMM Server v.2.0、Big-PI Predictor等生物信息学软件预测分析信号肽、跨膜区和GPI锚定点等构建田鼠巴贝虫分泌蛋白本地数据库;3) 无缝克隆、麦胚无细胞蛋白表达系统和蛋白芯片等高通量技术筛选鉴定若干关键候选分子;评价其应用于巴贝虫病现场血清学诊断意义,为巴贝虫病诊断和治疗提供靶标。

结项摘要

田鼠巴贝虫是寄生于人或其它哺乳动物红细胞内一重要蜱媒原虫,可引起巴贝虫病并严重威胁人类健康。田鼠巴贝虫形态学鉴定困难,分子生物学诊断受现场应用限制,血清学诊断相对方便快捷,然其诊断抗原有限,敏感性与特异性尚不能满足实际诊断需要。虫体分泌蛋白与宿主免疫系统直接接触、影响宿主免疫调节,是免疫学上重要的抗原与靶点,目前田鼠巴贝虫组学研究基础薄弱,本研究通过Pubmed和梨浆虫PiroplasmaDB等公共数据库整理田鼠巴贝虫原始数据库;结合SignalP4.1 Server、TMHMM Server v.2.0、Big-PI Predictor等生物信息学软件预测分析信号肽、跨膜区和GPI锚定点等构建田鼠巴贝虫分泌蛋白本地数据库;并据此筛选出204个序列扩增得到200个序列,对于扩增得到的序列再进行In-fusion无缝克隆、麦胚无细胞蛋白表达系统表达得到169个蛋白,通过蛋白芯片高通量技术筛选应用不同感染时期BALB/C小鼠血清筛选高效克隆表达的B.microti蛋白。通过蛋白芯片筛选得到10个高度免疫反应候选分子(5.9%,10/169),其中大多数(80%,8/10)以前没有被鉴定过,而这些候选分子有可能成为巴贝虫病诊断候选抗原或药物靶标、免疫靶标等候选分子。. 由于本实验室缺乏临床发热病人血清资源等不足,对于以上蛋白芯片筛选蛋白除了进行感染不同时期小鼠血清评价其诊断效能外对其免疫功能进行了评价。本课题选取其中一个蛋白(BmSP44)用大肠杆菌融合表达系统进行克隆表达,成功表达得到该蛋白,纯化后该蛋白约24kD,ELISA结果表明感染田鼠巴贝虫1-4周小鼠血清均可被该蛋白识别,结果与蛋白芯片结果一致。BmSP44主动免疫小鼠4周后,攻击感染田鼠巴贝虫,经外周血血涂片或荧光定量PCR两种方法监测巴贝虫虫浓度,结果表明该蛋白可诱导一定的免疫保护力,免疫组小鼠感染田鼠巴贝虫后其体重、体温和血红蛋白含量较对照组无明显改变。田鼠巴贝虫感染血涂片经体外间接荧光抗体IFA试验结果表明,该蛋白BmSP44主要分布在巴贝虫胞质中,与其分泌蛋白属性相符,也为该蛋白诱导免疫保护作用的体外实验证据,而其免疫小鼠体内相应细胞因子与抗体动态变化正在检测中。

项目成果

期刊论文数量(2)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
国内外巴贝虫病流行现状与研究进展
  • DOI:
    10.16250/j.32.1374.2018293
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    中国血吸虫病防治杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    周霞;王慧;薛靖波;夏尚;周晓农
  • 通讯作者:
    周晓农
Immunomics analysis of Babesia microti protein markers by high-throughput screening assay
通过高通量筛选试验对田鼠巴贝虫蛋白标记物进行免疫组学分析
  • DOI:
    10.1016/j.ttbdis.2018.07.004
  • 发表时间:
    2018-09-01
  • 期刊:
    TICKS AND TICK-BORNE DISEASES
  • 影响因子:
    3.2
  • 作者:
    Zhou,Xia;Huang,Ji-Lei;Zhou,Xiao-Nong
  • 通讯作者:
    Zhou,Xiao-Nong

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其他文献

连花定喘片治疗支气管哮喘的疗效
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
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  • 作者:
    周霞;石慧;马瑞晓;翟振国
  • 通讯作者:
    翟振国

其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
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          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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