基于“组学”策略系统解析原发性胆汁性肝硬化疾病相关基因位点的作用机理研究

批准号:
81373188
项目类别:
面上项目
资助金额:
70.0 万元
负责人:
李永哲
依托单位:
学科分类:
H1107.自身免疫性疾病
结题年份:
2017
批准年份:
2013
项目状态:
已结题
项目参与者:
王江山、张宁、罗晓芳、乔琳、孙菲、吴子燕
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中文摘要
原发性胆汁性肝硬化(PBC)是一种与自身免疫有关的慢性进行性胆汁淤积性肝脏疾病,是以破坏肝内小叶及中等大小胆管为主的器官特异性自身免疫性肝病。终末期PBC患者不可避免地出现肝功能衰竭和肝硬化等严重并发症。PBC的发病机制尚未阐明。现有的一系列证据提示其是自身免疫与遗传易感性双重作用的结果,而遗传因素在PBC的发病环节中起了至关重要的作用。虽然GWAS研究发现了约23个PBC相关基因,然其致病位点及作用机制尚不清楚。为了系统的解析PBC疾病相关基因位点的作用机制,本项目采用"组学"策略对PBC相关SNP的转录因子、靶基因及细胞特异性表达进行系统性分析,具体的研究手段包括:MassArray ipex基因分型、Sanger测序、免疫共沉淀(CHIP)、流式细胞术等实验技术及相应的生物信息学分析,以确定PBC相关SNP调节靶基因表达水平的作用方式及其发挥作用的细胞类型,这对了解PBC的发病过程。
英文摘要
Primary biliary cirrhosis (PBC) is a chronic autoimmune cholestatic liver disease, with the manifestation of destruction of intrahepatic lobular and medium size bile duct. It is an organ-specific autoimmune liver disease. With the processing of PBC, the final PBC patients will inevitably appear the serious complications of liver failure and cirrhosis. Its pathogenesis has not been clearly elucidated. Evidences suggesting that it is a complex disease with both autoimmune and genetic factors involved. It cannot be ignored that the genetic factors' crucial role in the pathogenesis of PBC. The GWAS study had found about 23 PBC-related genes; however, the disease-related loci and its mechanism are still unclear. In order to systemically analyze the mechanism of the PBC disease-related loci, the project uses an "Omics" strategy to resolve the relevant SNP transcription factor, target genes and cell-specific expression, whose specific research methods mainly include MassArray iPEX, Sanger sequencing, immune co-precipitation (CHIP), flow cytometry and related bioinformatics analysis. It is extremely vital for our understanding of PBC pathogenesis, assessment of disease risk and drug development.
原发性胆汁性肝硬化(PBC)是一种与自身免疫有关的慢性进行性胆汁淤积性疾病。虽然目前PBC的发病机制尚不清晰,但普遍认为其是一种多基因共同作用的复杂疾病。遗传因素在PBC的发病中起了至关重要的作用。GWAS研究发现了数十个PBC相关基因,但其致病位点及作用机理尚不清晰。为系统的解析PBC相关位点的作用机理,本项目确证了IL12A、IL7R、HELZ2及LYN和中国汉族人群的PBC相关性。其中IL12A、HELZ2及LYN首次发现和中国汉族人群的PBC相关。并进一步探究了IL12A相关SNP的作用机制,发现IL12A相关的SNP位于增强子区域,可上调IL12A基因的表达。IL7R相关的SNP位点位于基因的启动子区,可调节IL7R基因的转录。通过3C及捕获测序技术,进一步阐明了不同染色体的调控元件之间的相关作用。本实验发现HLA区域的相互作用最为密集。本项目的开展为进一步阐明PBC的发病机制提供了思路,对PBC的早期诊断及治疗提供了线索。
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Evaluation of the Clinical Performance of a Novel Chemiluminescent Immunoassay for Detection of Anticardiolipin and Anti-Beta2-Glycoprotein 1 Antibodies in the Diagnosis of Antiphospholipid Syndrome.
新型化学发光免疫分析检测抗心磷脂和抗 Beta2-糖蛋白 1 抗体在抗磷脂综合征诊断中的临床性能评估
DOI:10.1097/md.0000000000002059
发表时间:2015-11
期刊:Medicine
影响因子:1.6
作者:Zhang S;Wu Z;Li P;Bai Y;Zhang F;Li Y
通讯作者:Li Y
Histopathological diagnostic value of the IgG4+/IgG+ ratio of plasmacytic infiltration for IgG4-related diseases: a PRISMA-compliant systematic review and meta-analysis.
浆细胞浸润的 IgG4( )/IgG( ) 比率对 IgG4 相关疾病的组织病理学诊断价值 符合 PRISMA 的系统评价和荟萃分析
DOI:10.1097/md.0000000000000579
发表时间:2015-03
期刊:Medicine
影响因子:1.6
作者:Deng C;Li W;Chen S;Zhang W;Li J;Hu C;Wen X;Zhang F;Li Y
通讯作者:Li Y
Evaluation of the clinical relevance of anti-annexin-A5 antibodies in Chinese patients with antiphospholipid syndrome
中国抗磷脂综合征患者抗膜联蛋白 A5 抗体的临床相关性评估
DOI:10.1007/s10067-016-3510-8
发表时间:2017-02
期刊:Clinical Rheumatology
影响因子:3.4
作者:Zhang Shulan;Wu Ziyan;Li Jing;Wen Xiaoting;Li Liubing;Zhang Wen;Zhao Jiuliang;Zhang Fengchun;Li Yongzhe
通讯作者:Li Yongzhe
Evaluation of the diagnostic potential of antibodies to beta2-glycoprotein 1 domain 1 in Chinese patients with antiphospholipid syndrome.
β2-糖蛋白 1 结构域 1 抗体对中国抗磷脂综合征患者的诊断潜力评估
DOI:10.1038/srep23839
发表时间:2016-04-07
期刊:Scientific reports
影响因子:4.6
作者:Zhang S;Wu Z;Chen S;Li J;Wen X;Li L;Zhang W;Zhao J;Zhang F;Li Y
通讯作者:Li Y
Association between MEFV Mutations M694V and M680I and Behcet's Disease: A Meta-Analysis
MEFV 突变 M694V 和 M680I 与白塞病之间的关联:荟萃分析
DOI:10.1371/journal.pone.0132704
发表时间:2015-07-15
期刊:PLOS ONE
影响因子:3.7
作者:Wu, Ziyan;Zhang, Shulan;Li, Yongzhe
通讯作者:Li, Yongzhe
白塞病新特异性自身抗体筛选及靶抗原与发病机制研究
- 批准号:81871302
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:56.0万元
- 批准年份:2018
- 负责人:李永哲
- 依托单位:
TYK2基因可选择性剪接模式与原发性胆汁性肝硬化的关系研究
- 批准号:81671618
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:55.0万元
- 批准年份:2016
- 负责人:李永哲
- 依托单位:
IL12A基因两个潜在的增强子区域在原发性胆汁性肝硬化发病机制中作用的研究
- 批准号:81172857
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:55.0万元
- 批准年份:2011
- 负责人:李永哲
- 依托单位:
基于人类全基因组编码蛋白高通量芯片筛选原发性胆汁性肝硬化血清特异性标志物的研究
- 批准号:81072486
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:30.0万元
- 批准年份:2010
- 负责人:李永哲
- 依托单位:
国内基金
海外基金
