SRAD在DNA双链断裂损伤修复途径选择中的作用及其机制

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31730021
  • 项目类别:
    重点项目
  • 资助金额:
    290.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0507.核酸生物化学
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2017
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2018-01-01 至2022-12-31

项目摘要

Replication-associated one-ended DNA double-strand breaks (DSBs) are almost exclusively repaired by homologous recombination (HR), but the underlying molecular mechanisms remain poorly understood. Here we identify SRAD, a largely uncharacterized protein, as the key determinant of DSB repair pathway choice. SRAD physically interacts with CtIP and is required for efficient CtIP accumulation at DSBs. SRAD possesses intrinsic DNA binding ability with a strong preference for DNA substrates that mimic structures generated at stalled replication forks. Consequently, loss of SRAD impairs CtIP-dependent DNA end resection and compromises HR repair. We propose that, through enhancing the tethering of CtIP at perturbed replication forks, SRAD directs replication-associated one-ended DSBs towards the HR repair pathway. A successful completion of this study will provide new insights into the molecular mechanisms that regulate DSB repair pathway choice.
DSBs(DNA double-strand breaks)根据它末端性质可以分为双末端DSBs(Two-ended DSBs)和复制相关的单末端DSBs(Replication-associated one-ended DSBs)。复制相关的单末端DSBs只能通过同源重组(homologous recombination,HR)完成修复;如果通过非同源末端连接(non-homologous end-joining,NHEJ)完成修复,则会导致不同染色体之间的连接,进而引起translocation的发生以及基因组不稳定。但是,细胞如何区分这两种不同类型的 DSBs从而保证复制相关的单末端DSBs通过HR完成修复还不清楚。我们发现新蛋白SRAD可能通过区分不同类型的DNA底物从而调控DSBs修复途径选择。该项目的完成将使我们进一步认识正确的DSBs修复途径选择在维持基因组稳定中的重要作用。

结项摘要

DSBs是最具威胁的DNA损伤类型之一,如果不能及时修复或发生错误修复,则会导致基因突变、基因组不稳定以及肿瘤等重大疾病的发生。DSBs根据它末端的性质可以分为两种类型:双末端DSBs (Two-ended DSBs)和复制相关的单末端DSBs (Replication-associated one-ended DSBs)。DSBs主要通过非同源末端连接(non-homologous end-joining,NHEJ)和同源重组(homologous recombination,HR)这两种修复途径完成修复。研究表明,Two-ended DSBs主要通过NHEJ完成修复;而Replication-associated one-ended DSBs则只能通过HR完成修复。如果Replication-associated one-ended DSBs通过NHEJ完成修复,则会导致不同染色体之间的连接,进而引起translocation的发生以及基因组不稳定。然而,细胞如何识别并区分这两种不同类型的DSBs从而选择正确的DSBs修复途径还很不清楚。. 我们发现SRAD/AUNIP蛋白是一个重要的DSBs的识别因子。一方面,AUNIP通过优先结合Replication-associated one-ended DSBs从而区分Two-ended DSBs和Replication-associated one-ended DSBs。另一方面,SRAD/AUNIP通过与HR关键起始蛋白CtIP直接相互作用从而优先招募CtIP蛋白到Replication-associated one-ended DSBs上,使得Replication-associated one-ended DSBs只能通过HR完成修复。与此同时,由于SRAD/AUNIP蛋白结合Two-ended DSBs能力较弱,导致CtIP蛋白不能够被有效的招募到Two-ended DSBs位点,进而使得Two-ended DSBs主要通过NHEJ完成修复。相关研究结果分别发表于Nature Communications (2篇)、Molecular Cell (2篇)、PNAS以及Nucleic Acids Research等杂志。

项目成果

期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
BRCA2 antagonizes classical and alternative nonhomologous end-joining to prevent gross genomic instability.
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  • DOI:
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  • 发表时间:
    2017-11-13
  • 期刊:
    Nature communications
  • 影响因子:
    16.6
  • 作者:
    Han J;Ruan C;Huen MSY;Wang J;Xie A;Fu C;Liu T;Huang J
  • 通讯作者:
    Huang J
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  • DOI:
    10.1093/nar/gkac447
  • 发表时间:
    2022-06-10
  • 期刊:
    NUCLEIC ACIDS RESEARCH
  • 影响因子:
    14.9
  • 作者:
    Ding, Linli;Luo, Yi;Tian, Tian;Chen, Xu;Yang, Yulan;Bu, Min;Han, Jinhua;Yang, Bing;Yan, Haiyan;Liu, Ting;Wu, Mengjie;Zhang, Guofei;Xu, Yipeng;Zhu, Shaoxing;Huen, Michael S. Y.;Mao, Genxiang;Huang, Jun
  • 通讯作者:
    Huang, Jun
AUNIP directs DNA double-strand breaks towards the homologous recombination repair pathway
AUNIP 将 DNA 双链断裂引导至同源重组修复途径
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    Nat Commun
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Lou J.;Chen H.;Han J.;Feng X.H.;Liu T.;Huang J
  • 通讯作者:
    Huang J
Structural insight into BRCA1-BARD1 complex recruitment to damaged chromatin
深入了解 BRCA1-BARD1 复合物招募至受损染色质的结构。
  • DOI:
    10.1016/j.molcel.2021.05.010
  • 发表时间:
    2021-07-01
  • 期刊:
    MOLECULAR CELL
  • 影响因子:
    16
  • 作者:
    Dai, Linchang;Dai, Yaxin;Zhou, Zheng
  • 通讯作者:
    Zhou, Zheng

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  • 通讯作者:
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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