基于蛋白质二级结构的蛋白质相互作用及网络的研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    60761001
  • 项目类别：
    地区科学基金项目
  • 资助金额：
    24.0万
  • 负责人：
    蔡禄
  • 依托单位：
    内蒙古科技大学
  • 学科分类：
    F0124.生物电子学与生物信息处理
  • 结题年份：
    2010
  • 批准年份：
    2007
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2008-01-01 至2010-12-31

项目摘要

后基因组时代，最有意义和最具挑战性的工作之一是大规模蛋白质相互作用及其网络的理解。这项工作的基本目标是确定生物体蛋白质相互作用的关系、形成网络的机制，进而采用系统生物学的观点从根本上解释生物学过程的机理。本项目以人、线虫、果蝇、酿酒酵母、幽门螺杆菌和大肠杆菌等生物为对象，以蛋白质相互作用数据库为基础，用物理学、生物信息学、信息学等理论方法和计算机技术发展预测相互作用和网络构建的新方法。研究内容包括：①、研究蛋白质二级结构（或超二级结构）与其相互作用对关系统计意义上的规律，发展预测蛋白质相互作用的新方法。②、研究构建蛋白质相互作用网络的新方法。③、发展预测蛋白质相互作用及构建网络软件的原型系统。④、研究相互作用网络的保守模式和动力学理论。

结项摘要

项目成果

期刊论文数量（30）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（14）
专利数量（0）
黑腹果蝇蛋白质编码区碱基分布与起始密码子及终止密码子的关系
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    内蒙古科技大学学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    崔向军;蔡禄;刘辉
  • 通讯作者：
    刘辉
基于二级结构预测蛋白质复合体亚基相互作用
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    内蒙古科技大学学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    裴智勇;蔡禄
  • 通讯作者：
    蔡禄
基于二级结构信息的蛋白质相互作用贝叶斯分类预测
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    内蒙古科技大学学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    蔡禄;秦笙
  • 通讯作者：
    秦笙
多样性增量结合 支持向量机方法 预测酵母核小体定位
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    生物物理学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    裴智勇;赵秀娟;刘佳;蔡禄
  • 通讯作者：
    蔡禄
Simple sequence-based kernels do not predict protein-protein interactions
简单的基于序列的内核不能预测蛋白质-蛋白质相互作用
  • DOI：
    10.1093/bioinformatics/btq483
  • 发表时间：
    2010-10-01
  • 期刊：
    BIOINFORMATICS
  • 影响因子：
    5.8
  • 作者：
    Yu, Jiantao;Guo, Maozu;Westhead, David R.
  • 通讯作者：
    Westhead, David R.

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其他文献

RNA结合蛋白Sam68及其功能
  • DOI：
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  • 期刊：
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  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    李珺;邢永强;蔡禄
  • 通讯作者：
    蔡禄
利用CCD优化C/N和pH对污泥厌氧发酵产沼气的影响
  • DOI：
    10.14088/j.cnki.issn0439-8114.2016.06.015
  • 发表时间：
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  • 期刊：
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  • 作者：
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  • 通讯作者：
    蔡禄
人类转录因子与剪接因子互作网络的构建与分析
  • DOI：
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  • 发表时间：
    2014
  • 期刊：
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  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    魏官云;邢永强;蔡禄
  • 通讯作者：
    蔡禄
酿酒酵母ARS305侧翼序列对其自主复制活性的影响
  • DOI：
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  • 发表时间：
    2013
  • 期刊：
    湖北农业科学
  • 影响因子：
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  • 作者：
    张启声;王馨;赵秀娟;蔡禄
  • 通讯作者：
    蔡禄
与人遗传病相关的DNA重复序列的体外核小体定位特性
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2013
  • 期刊：
    基础医学与临床
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    柴荣;赵宏宇;蔡禄
  • 通讯作者：
    蔡禄

其他文献

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相似海外基金

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AI项目解读示例

课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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