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基于RNA-Seq筛选的功能性LincRNA-NR_034037与乳腺癌发生发展的关联研究
结题报告
批准号:
81472630
项目类别:
面上项目
资助金额:
78.0 万元
负责人:
周翊峰
依托单位:
学科分类:
H1805.肿瘤表观遗传
结题年份:
2018
批准年份:
2014
项目状态:
已结题
项目参与者:
邓杰琼、杨磊、曹华、武宏春、李娜、李巍、李芳、黎银燕
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中文摘要
研究表明LincRNA与多种恶性肿瘤存在着密切的关系。前期预实验中我们通过RNA-Seq的方法发现1q42染色体上TSNAX和DISC1基因间LincRNA-NR_034037在乳腺癌-癌旁组织中存在差异表达;进一步研究显示该LincRNA与TSNAX-DISC1融合转录本的表达存在关联;目前,TSNAX-DISC1的融合机制尚不明确,而预实验的结果亦提示LincRNA-NR_034037可能参与了调控两基因间绝缘子与CTCF的结合。据此,我们假设该LincRNA可以通过调控顺式剪接(cis-splicing)的方式影响TSNAX-DISC1融合转录本的形成,进而影响乳腺癌的发生发展。本项目拟在此基础上,联合使用双中心大样本分析、机制研究和功能表型实验等方法系统的阐明该LincRNA的异常表达在乳腺癌中的作用。以期为乳腺癌高危人群的筛查、预防、治疗及预后评估提供科学依据和手段。
英文摘要
It had been determined that lincRNAs were associated with a variety of malignancies. In preliminary experiments, we found a significant difference in the expression levels of lincRNA-NR_034037, which is located between TSNAX and DISC1 genes on chromosome 1q42, between breast cancer and surrounding tissues by analyzing our RNA-Seq data from paired breast samples. The fusion mechanism of chimeric transcript TSNAX-DISC1 generated by TSNAX and DISC1 genes was still uncertain. Biochemical analysis further demonstrated thatlincRNA-NR_034037 was associated with the expression of TSNAX-DISC1, and might affect the affinity between insulators and CTCF. Therefore, we hypothesized that lincRNA-NR_034037 might regulate the generation of chimeric transcript TSNAX-DISC1 by cis-splicing of adjacent genes, thereby involving in the development of breast cancer. On the basis of above results, we are to clarify the role of lincRNA-NR_034037 in breast cancer progression with multiple methods, such as two-center large sample analysis, mechanisms exploring, and phenotype-function test, to provide scientific basis and means for screening, prevention, treatment, and prognosis of high-risk breast cancer populations.
乳腺癌作为危害我国女性生命健康的主要杀手,其发病率逐年增加。本项目以乳腺癌为对象, 研究RNA-Seq 筛选确定的功能性LincRNA-NR_034037 对该疾病发生及发展的影响。在前期研究的基础上,开展大样本量、双中心的临床样本分析,探讨LincRNA-NR_034037 异常表达与乳腺癌的关系;通过表型检测和一系列体内、外功能表型实验揭示这些遗传改变的功能机制,将宏观关联发现与微观生物学功能统一起来。本项目中我们研究发现了LincRNA-NR_034037能通过竞争性抑制绝缘子上CTCF 结合位点来影响TSNAX-DISC1 融合转录本的形成,从而促进了肿瘤的发生。我们首次研究了LincRNA在调控融合基因形成中发挥的重要作用,为建立乳腺癌高危人群的筛选和预防提供科学依据。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
DOI:10.18632/oncotarget.3469
发表时间:2015-03-20
期刊:Oncotarget
影响因子:--
作者:Li F;Zhang L;Li W;Deng J;Zheng J;An M;Lu J;Zhou Y
通讯作者:Zhou Y
LincRNA-uc002yug.2 involves in alternative splicing of RUNX1 and serves as a predictor for esophageal cancer and prognosis
LincRNA-uc002yug.2 参与 RUNX1 的选择性剪接,并可作为食管癌和预后的预测因子。
DOI:10.1038/onc.2014.400
发表时间:2015-09-03
期刊:ONCOGENE
影响因子:8
作者:Wu, H.;Zheng, J.;Zhou, Y.
通讯作者:Zhou, Y.
DOI:10.1074/jbc.m116.758508
发表时间:2017-04-07
期刊:JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY
影响因子:4.8
作者:Li, Wei;Li, Hua;Zhou, Yifeng
通讯作者:Zhou, Yifeng
DOI:10.1093/carcin/bgu201
发表时间:2014-12-01
期刊:CARCINOGENESIS
影响因子:4.7
作者:Li, Na;Zheng, Jian;Zhou, Yifeng
通讯作者:Zhou, Yifeng
MLLT4-AS1编码微肽XBP1SBM参与三阴性乳腺癌代谢重编程的分子机制研究
  • 批准号:
    81972649
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    60.0万元
  • 批准年份:
    2019
  • 负责人:
    周翊峰
  • 依托单位:
Y染色体连锁LINC00278调控ZFY基因可变剪接促进男性食管鳞癌发生发展的分子机制研究
  • 批准号:
    81772544
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    60.0万元
  • 批准年份:
    2017
  • 负责人:
    周翊峰
  • 依托单位:
X染色体失活中心区域内遗传变异与乳腺癌发生发展的关联研究
  • 批准号:
    81171895
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    60.0万元
  • 批准年份:
    2011
  • 负责人:
    周翊峰
  • 依托单位:
11p13拷贝数多态与正常核型急性髓系白血病发生发展的关联研究
  • 批准号:
    81001278
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    22.0万元
  • 批准年份:
    2010
  • 负责人:
    周翊峰
  • 依托单位:
国内基金
海外基金