低深度全基因组测序鉴定特发性慢性胰腺炎新基因及其功能研究
批准号:
81770636
项目类别:
面上项目
资助金额:
56.0 万元
负责人:
廖专
依托单位:
学科分类:
H0313.胰腺外分泌功能异常与胰腺炎
结题年份:
2021
批准年份:
2017
项目状态:
已结题
项目参与者:
邹文斌、喻东、王敏君、钱阳阳、唐欣颖、林金欢、邓顺江
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中文摘要
慢性胰腺炎(CP)是一种胰腺持续性炎症引起形态学不可逆改变和内外分泌功能损害的疾病,给社会带来了巨大的公共医疗负担,其发病机制亟待研究,遗传因素在其发病中发挥着重要作用。特发性慢性胰腺炎(ICP)病因不明确,在我国CP患者中所占比例极高(>70%)。本研究拟以我院所有特发性胰腺炎患者为研究对象,前期我们使用扩增子测序方法对4个已知易感基因进行外显子测序分析,对未携带已知突变的ICP患者,利用新的高通量低深度全基因组测序技术进行SNP筛选,筛选出显著差异的SNP变异或者罕见致病突变,运用sanger测序技术在另一批1000例特发性CP患者中进行重复验证。对候选基因和突变的功能进行初步探索,寻找其致病机制;从而进一步补充我国ICP患者临床资料、标本和遗传特征资源库,为研究中国CP患者易感基因特征、CP的早期诊断和治疗提供新的理论基础和研究方法。
英文摘要
Chronic pancreatitis (CP) is a kind of persistent inflammatory disease of the pancreas, which could lead to irreversible changes in morphology and failure of exocrine and endocrine pancreatic function. It has brought a huge public medical burden to society. The etiology and pathogenesis of chronic pancreatitis is still uncertain, in which genetic factors play an important role as we know. Our previous study found that idiopathic chronic pancreatitis (ICP) accounts for a large proportion (> 70%) in Chinese CP patients. This study will collect all patients with idiopathic pancreatitis in our hospital. We have previously used the method of amplicon sequencing to perform exon sequencing analysis of four known susceptibility genes. In this study, we intend to use new high-throughput low-depth whole genome sequencing techniques to perform SNP screening for ICP patients who did not carry known mutations. Then, it will screen out SNP variation or rare pathogenic mutations with significant differences. Next, sequential validation will be performed in another 1,000 patients with idiopathic CP by Sanger sequencing. We will also explore the function of candidate genes and mutations to find its pathogenic mechanism. This study further supplement the clinical data, specimens and genetic resources of CP patients in China. Finally, a new theoretical basis and research methods will be provided for studying the genetic characteristics of CP patients in China and the early diagnosis and treatment of CP.
慢性胰腺炎(CP)是一种胰腺持续性炎症引起形态学不可逆改变和内外分泌功能损害的疾病,给社会带来了巨大的公共医疗负担,其发病机制亟待研究。遗传因素在其发病中发挥着重要作用,但已知的易感基因仅能解释50%左右的患者,且中西方存在显著差异,因此,新的CP易感基因有待进一步发现和研究。本研究对464例CP患者和504例健康对照人群进行高通量低深度全基因组测序,筛选出显著差异的SNP变异或者罕见致病突变;通过国际合作明确CP候选易感基因相关SNP在中国人群的作用与差异;分析已知基因座PRSS1-PRSS2常见的SNP位点与饮酒剂量对CP的影响,明确弱环境因素与弱遗传因素在CP疾病中的作用;通过Gene-burden分析发现与CP相关的新基因TRPV6,通过功能学实验明确TRPV6功能缺失型突变与CP显著相关,并在动物实验中证实Trpv6敲除小鼠对雨蛙素刺激更敏感,证实TRPV6是CP新型易感基因。申请者以通讯作者发表SCI共12篇,获批1项发明专利,获得树兰医学青年奖、国家万人计划等人才项目。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
DOI:10.1097/MPA.0000000000001278
发表时间:2019
期刊:Pancreas
影响因子:--
作者:Ru Nan;Zou Wen Bin;Qian Yang Yang;Tang Xin Ying;Zhu Jia Hui;Hu Liang Hao;Li Zhao Shen;Liao Zhuan
通讯作者:Liao Zhuan
DOI:10.1007/s10620-020-06732-2
发表时间:2021
期刊:Digestive Diseases and Sciences
影响因子:3.1
作者:Tang Xin-Ying;Ru Nan;Li Qing;Qian Yang-Yang;Sun Hui;Zhu Jia-Hui;He Lin;Wang Yuan-Chen;Hu Liang-Hao;Li Zhao-Shen;Zou Wen-Bin;Liao Zhuan
通讯作者:Liao Zhuan
Meta-analysis of the impact of the SPINK1 c. 194 2T> C variant in chronic pancreatitis
SPINK1 影响的荟萃分析 c.
DOI:--
发表时间:2020
期刊:Digestive and Liver Disease
影响因子:4.5
作者:Tang Xinying;Zou Wenbin;Yu Feifei;Wang Lei;Ru Nan;Zhu Jiahui;Li Zhaoshen;Liao Zhuan
通讯作者:Liao Zhuan
DOI:10.19538/j.nk2018070106
发表时间:2018
期刊:中国实用内科杂志
影响因子:--
作者:赵安静;邹文斌;廖专
通讯作者:廖专
Factors associated with prior acute pancreatitis episodes among patients with chronic pancreatitis
慢性胰腺炎患者既往急性胰腺炎发作的相关因素
DOI:10.1016/j.dld.2021.03.001
发表时间:2021-08-25
期刊:DIGESTIVE AND LIVER DISEASE
影响因子:4.5
作者:Ru, Nan;Zhu, Jia-Hui;Liao, Zhuan
通讯作者:Liao, Zhuan
“肠—胰对话”在胰腺炎发生发展中的机制研究
- 批准号:82330016
- 项目类别:重点项目
- 资助金额:220.00万元
- 批准年份:2023
- 负责人:廖专
- 依托单位:
TRPV6基因在慢性胰腺炎中的遗传致病机制及精准防治策略研究
- 批准号:82120108006
- 项目类别:国际(地区)合作与交流项目
- 资助金额:250万元
- 批准年份:2021
- 负责人:廖专
- 依托单位:
重组AAV-8介导胰腺特异表达SPINK1基因防治慢性胰腺炎的实验研究
- 批准号:81970560
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:59.0万元
- 批准年份:2019
- 负责人:廖专
- 依托单位:
酒精性慢性胰腺炎易感基因筛选及鉴定研究
- 批准号:81470884
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:65.0万元
- 批准年份:2014
- 负责人:廖专
- 依托单位:
Erbin对TGF-β1诱导胰腺上皮细胞间质转化(EMT)的作用机制研究
- 批准号:81270541
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:70.0万元
- 批准年份:2012
- 负责人:廖专
- 依托单位:
Obestatin对大鼠胰腺外分泌调节作用的实验研究
- 批准号:30800510
- 项目类别:青年科学基金项目
- 资助金额:20.0万元
- 批准年份:2008
- 负责人:廖专
- 依托单位:
国内基金
海外基金















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