包含Drosophila melanogaster和D. pseudoobscura等模式物种的果蝇属水果果蝇亚属（Sophophora）是进化生物学研究的经典类群，过去的证据均支持该亚属的单系地位。然而日本学者以及我们近期的研究发现，Sophophora亚属中的部分种组与拱背果蝇属（Lordiphosa）聚为一枝。我们进一步发现，对于二者关系的细节，线粒体和核基因的数据支持不同的假设。此外，我们对发现于我国云南的一个果蝇新类群的形态学、初步分子系统学分析结果提示，该类群与Lordiphosa属最为近缘。这意味着Sophophora大进化枝上存在前所未知的、重要的谱系分化事件，过去对该进化枝的认识可能在很大程度上是不完整的。我们将采用多个线粒体及核基因标记，基于包括上述类群在内的更全面的代表类群，力图重建更为完整、可靠的Sophophora大进化枝进化历史。