探索多属性变化特征的三向聚类方法及其可视化

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    41901317
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    27.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    D0114.地理信息学
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2019
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2020-01-01 至2022-12-31

项目摘要

Clustering analysis can be used to extract useful information from large amounts of spatio-temporal data. Multi-attribute spatio-temporal data is typically organized in the space-time cube for the further analysis where rows indicate locations, columns indicate timestamps and depth indicate attributes. However, current one-way clustering, co-clustering and tri-clustering methods are unable to identify similar attributes changing characteristics in the cube. In this study we are going to develop a tri-clustering method that can identify similar attributes changing characteristics in the cube, and then choose and design visualizations to analyze the complex patterns of multi-attribute changes along both space and time dimensions. To be specific, we will develop a new tri-clustering algorithm that can identify similar attributes changing characteristics based on an existing tri-clustering algorithm for similar attribute values and co-clustering algorithm for similar attribute changing characteristics. Then, we are going to choose and also design visualizations to display the tri-clustering results. Finally, we will use national air pollutants concentration data as the case study and apply both new tri-clustering algorithm and visualizations to it. The developed tri-clustering method and its visualizations can be used to analyze patterns of multi-attribute changes along both space and time dimensions, and therefore help to better understand complex patterns in spatio-temporal data.
聚类方法已广泛用于提取海量时空数据中的有用信息。多属性时空数据通常被组织在数据立方体中以便于分析。现有单向、双向和三向聚类方法无法识别时空数据立方体中多属性变化特征相似的三向聚簇,因此不能分析多属性同时随时空变化的模式。本项目将发展一个用于分析数据立方体中多属性变化特征相似的三向聚类方法,并选择和设计可视化方法来展示聚类结果中多属性同时随时空变化的模式。具体来说,本项目首先将结合分析属性值相似的三向聚类算法和属性变化特征相似的双向聚类算法来发展新的三向聚类算法用于识别多属性变化特征相似的三向聚簇;其次,本项目将选择和设计可视化方法对三向聚簇进行图形化表达用于展示多属性同时随时空变化的模式;最后,本项目将使用新三向聚类算法和可视化方法分析全国空气污染因子浓度数据。本项目发展的三向聚类算法及其可视化方法能够分析时空数据立方体中多属性同时随时空变化的模式,从而帮助更好的理解时空数据中的复杂模式。

结项摘要

地学领域产生了前所未有的海量数据,聚类分析可以有效地挖掘出隐藏在大量时空数据中的复杂模式。然而无论是单向聚类还是双向聚类方法都无法对组织在数据立方体中的时空数据进行一体化的聚类分析。而现有的三向聚类方法仅能识别出属性值相似的三向聚簇而无法找出属性变化特征相似的聚簇。因此,本项目发展了一个新的用于分析时空数据立方体中多属性变化特征相似的三向聚类算法,进一步选择和设计能够有效展示三向聚类结果中多属性同时随时空变化模式的可视化方法,从而帮助更好的理解多属性时空数据中复杂的时空变化模式,并将发展的三向聚类算法和可视化方法应用于分析全国多种空气污染因子同时随时空变化的模式。项目研究结果发现:(1)新发展的Bregman tri-clustering algorithm with minimum sum-squared residue (BCC_MSSR) 算法能够成功的用于识别任何实值数据矩阵中具有相似变化特征的三向聚簇;(2)并列地图、二维和近似三维热力图、环形时间线等可视化方法能够有效地展示多属性时空数据中复杂的时空变化模式;(3)结合BCC_MSSR算法和上述可视化方法能够有效地分析空气污染因子随时空变化的复杂模式,即空气污染物及其之间关系的时空异质性。比如,除O3外,空气污染物浓度的空间变化为南方城市低北方城市高,季节性变化为夏季低冬季高;在污染程度较高的北方城市,因为NO2的氧化反应,从夏季到冬季随着NO2浓度的增加,O3的浓度先下降,然后从秋季到冬季浓度又有所增加。上述研究结果对于认识聚类分析的作用以及理解海量时空大数据中的复杂模式很有意义。

项目成果

期刊论文数量(5)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Tri-clustering–based exploration of spatio-temporal heterogeneity of six criteria air pollutants and their relationships in China
基于三聚类的中国六类标准空气污染物时空异质性及其关系探讨
  • DOI:
    10.3389/feart.2022.951510
  • 发表时间:
    2022-10
  • 期刊:
    Frontiers in Earth Science
  • 影响因子:
    2.9
  • 作者:
    Xiaojing Wu
  • 通讯作者:
    Xiaojing Wu
Tri-Clustering Based Exploration of Temporal Resolution Impacts on Spatio-Temporal Clusters in Geo-Referenced Time Series
基于三聚类的时间分辨率对地理参考时间序列中时空聚类影响的探索
  • DOI:
    10.3390/ijg19040210
  • 发表时间:
    2020-03
  • 期刊:
    ISPRS INTERNATIONAL JOURNAL OF GEO-INFORMATION
  • 影响因子:
    3.4
  • 作者:
    Wu Xiaojing;Zheng Donghai
  • 通讯作者:
    Zheng Donghai
An overview of clustering methods for geo-referenced time series: from one-way clustering to co- and tri-clustering
地理参考时间序列的聚类方法概述:从单向聚类到联合聚类和三聚类
  • DOI:
    10.1080/13658816.2020.1726922
  • 发表时间:
    2020-02-17
  • 期刊:
    INTERNATIONAL JOURNAL OF GEOGRAPHICAL INFORMATION SCIENCE
  • 影响因子:
    5.7
  • 作者:
    Wu, Xiaojing;Cheng, Changxiu;Song, Changqing
  • 通讯作者:
    Song, Changqing
Spatio-temporal differentiation of spring phenology in China driven by temperatures and photoperiod from 1979 to 2018
1979-2018年气温和光周期驱动的中国春季物候时空分异
  • DOI:
    10.1007/s11430-019-9577-5
  • 发表时间:
    2020-03
  • 期刊:
    Science China-Earth Sciences
  • 影响因子:
    5.7
  • 作者:
    Wu Xiaojing;Cheng Changxiu;Qiao Cancan;Song Changqing
  • 通讯作者:
    Song Changqing
Identification of Co-Clusters with Coherent Trends in Geo-Referenced Time Series
地理参考时间序列中具有一致趋势的共簇识别
  • DOI:
    10.3390/ijgi11020134
  • 发表时间:
    2022-02
  • 期刊:
    ISPRS International Journal of Geo-Information
  • 影响因子:
    3.4
  • 作者:
    Xiaojing Wu
  • 通讯作者:
    Xiaojing Wu

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其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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