基于下一代测序技术鉴定遗传性先天性面神经麻痹的致病基因

批准号:
81600850
项目类别:
青年科学基金项目
资助金额:
17.0 万元
负责人:
岑志栋
依托单位:
学科分类:
H1501.口腔颅颌面组织器官生长发育相关疾病
结题年份:
2019
批准年份:
2016
项目状态:
已结题
项目参与者:
肖建军、高柳燕、王健达、章殷希、郑晓省、吴泓蔚
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中文摘要
遗传性先天性面神经麻痹是一罕见的遗传性先天性疾病,常染色体显性、隐性遗传家系或散发患者均有报道,具有一定遗传异质性。1996年首次定位至今,共有3个致病基因位点被报道,但仅有一个致病基因-HOXB1-被鉴定发现,提示仍有新的致病基因有待被鉴定发现。本课题组目前收集到4个遗传性先天性面神经麻痹家系及3例散发患者,Sanger测序未在其先证者或患者发现HOXB1基因有意义突变,提示可能存在未知的致病基因突变致病,是开展遗传性先天性面神经麻痹致病基因鉴定研究的宝贵遗传资源。下一代测序技术的出现,为遗传性疾病致病基因鉴定研究开辟了新的道路,尤其为小家系或散发病例的致病基因鉴定研究提供了有力的研究手段。本课题组拟应用基于下一代测序技术的全基因组测序技术,结合全基因组扫描、单体型分析等研究方法,鉴定遗传性先天性面神经麻痹的致病基因,为揭示该疾病的发病机制奠定基础。
英文摘要
Hereditary congenital facial palsy is a rare hereditary congenital disease, which could be autosomal dominant inherited, autosomal recessive inherited or sporadic. There were three causative gene loci reported since 1996. However, only one causative gene - HOXB1 was identified. Most causative genes of hereditary congenital facial palsy pedigrees and sporadic patients were still unknown. We have collected four hereditary congenital facial palsy pedigrees and three sporadic patients. No causative mutation in HOXB1 was found in these pedigrees and patients by using Sanger sequencing. This indicates that novel causative genes of hereditary congenital facial palsy could be identified in these pedigrees and patients. Next-generation sequencing is a powerful tool to identify causative gene of hereditary disease, especially for small pedigrees and sporadic patients. In this study, we will perform Whole-genome sequencing, combining with Whole-genome scan and haplotype analysis to identify the novel causative gene of hereditary congenital facial palsy. This will offer clues for further molecular pathogenesis study of hereditary congenital facial palsy.
遗传性先天性面神经麻痹是一罕见的遗传性先天性疾病,常染色体显性、隐性遗传家系或散发患者均有报道,具有一定遗传异质性。1996年首次定位至今,共有3个致病基因位点,但仅有一个致病基因-HOXB1-被鉴定发现,提示仍有新的致病基因有待被鉴定发现。本项目至今共收集到非常罕见的遗传性先天性面神经麻痹家系或患者共12个,建立了鉴定遗传性先天性面神经麻痹新致病基因的宝贵样本库。基于兄妹患病的家系A,通过全基因组扫描和单体型分析,定位出基因组中694.8Mb的候选致病基因区间。通过全外显子组测序、生物信息学分析筛选、Sanger测序家系内疾病基因共分离等手段,最终在家系A鉴定出一个符合常染色体隐性遗传的遗传性先天性面神经麻痹新候选致病基因-X基因(文章未发表,基因名用X代替)。进一步在其他遗传性先天性面神经麻痹家系和散发患者中进行X基因的Sanger测序和外显子拷贝数检测,在家系E和家系F的先证者均检测到X基因的很可能的杂合致病突变。基于上述研究结果,我们推测X基因很可能是一个新的遗传性先天性面神经麻痹 致病基因,进一步更多家系的验证和X基因及所发现的致病突变的功能研究,可能提供更多的支持证据。该遗传性先天性面神经麻痹研究成果目前已撰写成SCI论文,正在投稿中。同时在该项目的支持下,基于本项目中所用到的类似分子遗传学研究手段,还鉴定发现了其他单基因遗传病的新致病基因、新突变和新表型,目前总计发表标注该基金项目编号的SCI论文11篇,其中第一标注3篇,项目负责人作为共同通讯作者1篇、第一作者5篇。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
DOI:10.3988/jcn.2019.15.2.271
发表时间:2019
期刊:Journal of Clinical Neurology
影响因子:3.1
作者:You Chen;Zhidong Cen;Xiaosheng Zheng;Fei Xie;Si Chen;Wei Luo
通讯作者:Wei Luo
A novel homozygous SYNJ1 mutation in two siblings with typical Parkinson's disease
患有典型帕金森病的两个兄弟姐妹中出现新的纯合 SYNJ1 突变
DOI:10.1016/j.parkreldis.2019.11.001
发表时间:2019-12-01
期刊:PARKINSONISM & RELATED DISORDERS
影响因子:4.1
作者:Xie, Fei;Chen, Si;Luo, Wei
通讯作者:Luo, Wei
Underestimated disease prevalence and severe phenotypes in patients with biallelic variants: A cohort study of primary familial brain calcification from China
双等位基因变异患者的疾病患病率和严重表型被低估:中国原发性家族性脑钙化的队列研究
DOI:10.1016/j.parkreldis.2019.04.009
发表时间:2019-07-01
期刊:PARKINSONISM & RELATED DISORDERS
影响因子:4.1
作者:Chen, Si;Cen, Zhidong;Zhang, Xiaoluo
通讯作者:Zhang, Xiaoluo
Q1OR mutation in SCN9A gene is associated with generalized epilepsy with febrile seizures plus
SCN9A 基因 Q1OR 突变与全身性癫痫伴热性惊厥相关
DOI:10.1016/j.seizure.2017.06.023
发表时间:2017-08-01
期刊:SEIZURE-EUROPEAN JOURNAL OF EPILEPSY
影响因子:3
作者:Cen, Zhidong;Lou, Yuting;Feng, Jianhua
通讯作者:Feng, Jianhua
Biallelic loss-of-function mutations in JAM2 cause primary familial brain calcification
JAM2双等位基因功能丧失突变导致原发性家族性脑钙化
DOI:10.1093/brain/awz392
发表时间:2020-02-01
期刊:BRAIN
影响因子:14.5
作者:Cen, Zhidong;Chen, You;Luo, Wei
通讯作者:Luo, Wei
靶向长读长测序探索神经元核内包涵体病表型异质性的分子遗传学机制
- 批准号:LY23H090010
- 项目类别:省市级项目
- 资助金额:0.0万元
- 批准年份:2023
- 负责人:岑志栋
- 依托单位:
国内基金
海外基金
