银鲫a亚类干扰素基因IFNa1转录成胞外和胞内干扰素两个转录本的选择性剪接机理及抗病毒机制

批准号:
31972826
项目类别:
面上项目
资助金额:
58.0 万元
负责人:
张义兵
依托单位:
学科分类:
水产生物免疫学
结题年份:
2023
批准年份:
2019
项目状态:
已结题
项目参与者:
张义兵
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中文摘要
不同于哺乳类I型IFN基因,鱼类a亚类IFN基因在转录时推测发生了选择性剪接,但没有转录剪接发生的实验证据,且转录产生的胞内干扰素与胞外干扰素的协同抗病毒机制也需要更深入研究。本项目拟在我们前期成功体外模拟银鲫IFNa1基因转录成胞外和胞内IFN(eIFNa1和iIFNa1)两个转录本的基础上,进一步研究调控序列在介导eIFNa1和iIFNa1转录中的功能及信号通路,揭示IFNa1基因在转录成两个转录本时如何被启动表达的分子机理;研究剪接位点在介导eIFNa1和iIFNa1转录产生中的作用,揭示IFNa1基因如何通过选择性剪接表达成两个转录本的分子机制;研究胞内iIFNa1可能的胞外功能,揭示鲫IFNa1基因同时转录成胞内和胞外IFN时如何发挥抗病毒作用的分子机制。本项目的研究结果将阐明银鲫IFNa1的转录剪接及抗病毒作用机理,同时也将有助于理解鱼类具有自身特点的干扰素抗病毒反应机制。
英文摘要
Unlike mammalian type I IFN genes, fish type I IFN genes of subgroup a of group I have the potential to express two transcripts including extracellular IFN and intracellular IFN, which is predicated just by an alternative splicing event through bioinformatic analyses, but is not concluded from substantial experimental data. In addition, little is known about the molecular mechanism underlying the cooperatively antiviral function of the intracellular and extracellular IFNs when they both are transcribed from a single fish IFN gene. Our previous studies have successfully established an in vitro system whereby gibel carp IFNa1 is believed to generate two transcripts, eIFNa1 and iIFNa1, which in vitro mimics the transcription events of IFNa1 in virally-infected gibel carp tissues. In the current project, firstly, regulatory sequences involved in gibel carp IFNa1 gene transcription will be cloned to compare the induction pathways triggered by different IFN stimuli, thus clarifying how gibel carp IFNa1 gene is initiated for transcription in response to virus infection. Secondly, the potential effects of alternative acceptor sites and alternative donor sites in mediating transcriptional generation of eIFNa1 and iIFNa1 by IFNa1 will be determined, thus revealing how gibel carp IFNa1 expresses two transcripts by alternative splicing. Finally, whether iIFNa1 also exerts antiviral function through cell membrane IFN receptors besides cytoplasmic receptors and the cooperative antiviral effects of eIFNa1 and iIFNa1 will be further determined, thus clarifying how gibel carp IFNa1 gene function when it simultaneously generates two transcripts in response to viral infection. If this project is supported, the moelcular mechanisms underlying alternative splicing and antiviral function of gibel carp IFNa1 will be revealed and importantly, these data will aid to comprehensively understand fish-own antiviral mechanisms involved in interferon antiviral response.
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DOI:10.4049/jimmunol.2200343
发表时间:2022-09
期刊:The Journal of Immunology
影响因子:--
作者:Zi-Ling Qu;Yi-Lin Li;Xiu-Ying Gong;Xiang Zhao;Haoyun Sun;Cheng Dan;J. Gui;Yi-Bing Zhang
通讯作者:Zi-Ling Qu;Yi-Lin Li;Xiu-Ying Gong;Xiang Zhao;Haoyun Sun;Cheng Dan;J. Gui;Yi-Bing Zhang
DOI:10.1016/j.molimm.2020.01.004.
发表时间:2020
期刊:Molecular Immunology
影响因子:--
作者:Zang Zhaoxing;Dan Cheng;Zhou Li;Zhang Qi-Ya;Gui Jian-Fang;Zhang Yi-Bing
通讯作者:Zhang Yi-Bing
DOI:10.11964/jfc.20210712942
发表时间:2021
期刊:水产学报
影响因子:--
作者:赵祥;张义兵
通讯作者:张义兵
DOI:10.7541/2020.113
发表时间:2020
期刊:水生生物学报
影响因子:--
作者:李依琳;张义兵
通讯作者:张义兵
Molecular identification and function characterization of four finTRIM genes from the immortal fish cell line, EPC
永生鱼细胞系 EPC 中四个 finTRIM 基因的分子鉴定和功能表征
DOI:10.1016/j.dci.2020.103775
发表时间:2020
期刊:Developmental and Comparative Immunology
影响因子:2.9
作者:Li Yi-Lin;Zhao Xiang;Gong Xiu-Ying;Dan Cheng;Gui Jian-Fang;Zhang Yi-Bing
通讯作者:Zhang Yi-Bing
鱼类TRIM16家族基因TRIM16a负调控干扰素抗病毒免疫反应的功能研究
- 批准号:31772875
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:65.0万元
- 批准年份:2017
- 负责人:张义兵
- 依托单位:
鱼类特有的干扰素调节因子基因IRF11调控干扰素抗病毒反应的作用机理
- 批准号:31572646
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:65.0万元
- 批准年份:2015
- 负责人:张义兵
- 依托单位:
鱼类特有基因Gig1和Gig2在干扰素抗病毒反应中的功能研究
- 批准号:31272690
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:85.0万元
- 批准年份:2012
- 负责人:张义兵
- 依托单位:
不同斑马鱼干扰素基因的诱导表达及比较研究
- 批准号:31172435
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:56.0万元
- 批准年份:2011
- 负责人:张义兵
- 依托单位:
鱼类一个新的eIF2α蛋白激酶的结构域功能及抗病毒机理
- 批准号:30871922
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:38.0万元
- 批准年份:2008
- 负责人:张义兵
- 依托单位:
鲫鱼干扰素调节因子7基因的功能研究
- 批准号:30671617
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:30.0万元
- 批准年份:2006
- 负责人:张义兵
- 依托单位:
鱼类干扰素系统基因的表达特征及抗病毒机理研究
- 批准号:30471333
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:23.0万元
- 批准年份:2004
- 负责人:张义兵
- 依托单位:
感染病毒的鱼类培养细胞差异表达基因的鉴定和克隆
- 批准号:30200207
- 项目类别:青年科学基金项目
- 资助金额:20.0万元
- 批准年份:2002
- 负责人:张义兵
- 依托单位:
国内基金
海外基金
